本发明专利技术涉及一族新颖的分泌性蛋白质，称作ＳＥＣＦＡＭ１家族，它的家族成员包括新颖蛋白质ＩＮＳＰ１１３、ＩＮＳＰ１１４、ＩＮＳＰ１１５、ＩＮＳＰ１１６和ＩＮＳＰ１１７，经本发明专利技术鉴定为分泌性蛋白质，含有带表皮生长因子（ＥＧＦ）折叠的长１２５－１５３个氨基酸的结构域，以及含有８个保守性半胱氨酸残基；本发明专利技术还涉及这些蛋白质和编码基因的核酸序列在诊断、预防和治疗疾病中的用途。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及一族新颖的分泌性蛋白质，称作SECFAM1家族，它的家族成员包括新颖蛋白质INSP113、INSP114、INSP115、INSP116和INSP117，经本专利技术鉴定为分泌性蛋白质，含有带表皮生长因子(EGF)折叠的长125-153个氨基酸的结构域，以及含有8个保守性半胱氨酸残基；本专利技术还涉及这些蛋白质和编码基因的核酸序列在诊断、预防和治疗疾病中的用途。本文所引用的全部出版物、专利和专利申请，均纳入其全文作为参考。
技术介绍
目前，药物发现方法正蕴酿着一场根本革命，因为功能基因组学年代已经来临。术语“功能基因组学”应用于使用生物信息学工具将功能归因于感兴趣的蛋白质序列的方法。这些工具正日益显示其必要性，因为序列数据产生的速度远远高于研究实验室将功能划分给这些蛋白质序列的能力。随着生物信息学工具的功效和准确性提高，这些工具正快速取代生物化学特性鉴定的常规技术。事实上，鉴定本专利技术所用的先进生物信息学工具现在能够输出可获得较高置信度的结果。各所研究院和商业机构正在检查已有的序列数据，并且逐渐获得重大发现。然而，仍然有必要鉴定和特性分析其他基因和它们编码的多肽，作为研究和药物发现的目标。分泌性蛋白质的介绍细胞制造和分泌胞外蛋白质的能力是许多生物过程的中心。酶、生长因子、胞外基质蛋白和信号传导分子全部由细胞分泌出来。这是分泌小泡与质膜融合所致。多数情况下，但不是所有情况，蛋白质被信号肽导入内质网，并进入分泌小泡。信号肽是顺式作用序列，影响多肽链从细胞质转运至膜结合室如分泌小泡。靶向分泌小泡的多肽或者分泌进入胞外基质，或者留在质膜内。留在质膜内的多肽有一或多个跨膜结构域。在细胞机能发挥中心作用的分泌性蛋白质的例子是细胞因子、激素、胞外基质蛋白(粘附分子)、蛋白酶及生长和分化因子。含EGF结构域的蛋白质表皮生长因子(EGF)样蛋白质通过激活EGF受体(EGF-R)家族成员来刺激细胞分裂(Yarden等人，Eur J Cancer.2001 Sep；37 Suppl 4S3-81)。EGF是一种短肽，具有一个带6个保守性半胱氨酸的独有基序，其中全部6个半胱氨酸参与了二硫键的形成。事实上，在不同功能的各种蛋白质中都发现了这个基序(Davis等人，New Biol.1990 May；2(5)410-9)。而这些结构域可在很多类型的蛋白质中找到，但它们的功能多种多样，以致无法对它们的功能作出任何明确的结论，应当注意，所有EGF结构域(前列腺素G/H合成酶除外)或者在膜结合蛋白的胞外结构域内或者在已知分泌进入胞外基质的蛋白质内找到。业已知道，EGF结构域参与蛋白质间相互作用，同样地，它们的大部分疏水残基暴露在非结合蛋白质表面上。这一结构域由于具有高度保守性半胱氨酸模式，因此对从线虫类蠕虫到人的范围广泛的生物体中信号传导和调节事件起重要作用。已知，从组织修复和血液因子凝结调节的过程到涉及多种类型人肿瘤生长和发展的过程等多方面都牵涉到EGF结构域。后一种情况中，EGF-样蛋白质通过激活EGF信号传导途径来刺激细胞分裂(Yarden等人，Eur J Cancer，2001 Sep；37 Suppl 4S3-81)。正由于这些观察结果，它们在肿瘤进展中的作用对人们寻求抗癌治疗策略极为重要，本领域研制的一些新治疗药物都是基于干扰EGF信号传导途径这一方面(Waksal等人，Cancer Metastasis Rev.1999；18(4)427-36)。所以，关于这些结构的认识越多，对引起上述疾病状态和相关疾病状态的隐伏途径的理解越深，而且可以研究更有效的基因和/或药物疗法以治疗这些病症。本文详细描述了一族全新的分泌性蛋白质配体的鉴定。分泌性蛋白质配体的定义是一种由特定细胞分泌，而且通过调节(包括配体拮抗作用，如Dan家族那样)关连受体的活性和下游信号转导途径可在同一个或另一个细胞内产生表型应答的蛋白质。例如，已知的分泌性蛋白质配体家族是糖蛋白激素家族。卵泡刺激素(FSH)是糖蛋白激素家族其中一个成员。男性的FSH由脑下垂体前叶的细胞分泌，进入血流，然后再与睾丸支持细胞上的关连受体结合，调节精子生成过程。女性的FSH与卵巢的卵泡膜细胞、基质细胞和颗粒细胞上的受体结合，调节排卵。男性和女性缺乏FSH均可导致不孕症。给予蛋白质治疗剂形式的FSH可恢复FSH水平，采用这一方法可对抗FSH触发的不孕症。可获得的FSH例如是GONAL-fTM(Serono)。根据这一例子类推，可以看到鉴定新的分泌性配体蛋白质家族，为界定新颖配体-受体途径，特别是为详细描述配体结合的表型结果铺平了道路。若鉴定到人的病症是该新颖分泌性配体蛋白质家族中任一成员机能不良所引起的结果，那么，可给予该成员作为蛋白质治疗剂来对抗该病症。
技术实现思路
本专利技术基于如下发现INSP113、INSP114、INSP115、INSP116和INSP117多肽是分泌性蛋白质，具体地说，它們含有EGF样结构域的分泌性蛋白质，较佳地具有与凝血因子X相似的生物活性。INSP113、INSP114、INSP115、INSP116和INSP117一起构成本专利技术鉴定的SECFAM1蛋白质家族的一部分。SECFAM1蛋白质家族的注释现时并无关于本专利技术蛋白质的标注文字(annotation)，本专利技术的蛋白质含有一个强的分泌性蛋白质特征(signature)，为信号肽形式，可与类似蛋白质聚集在一起，获得其他物种的动物直向同源物支持。进一步检查可构建一族迄今为止未被定性分析过的蛋白质，该族蛋白质由5个人基因(INSP113、INSP114、INSP115、INSP116和INSP117)组成，并且包括哺乳动物和鱼类直向同源物，共含有15个序列。这些序列全部都具有一个强的信号肽区，该区的组成是可变的，其余为极相似的序列。总而言之，人序列内的序列同一性在49％或以上，有一个强的保守性残基轮廓(图1)。本文把这一相关序列群称作“SECFAM1家族”。本专利技术第一方面一实施例提供一种鉴定SECFAM1家族成员的方法，该方法包括搜索翻译核酸序列或多肽序列数据库，鉴定一个与下列序列轮廓(sequence profile)相匹配的多肽序列A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 02 N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -13 K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 14 R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -15 Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 06 L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种鉴定ＳＥＣＦＡＭ１家族成员的方法，其特征在于，所述方法包括： 搜索翻译核酸序列或多肽序列数据库，鉴定一个与下列序列轮廓相匹配的多肽序列： Ａ Ｒ Ｎ Ｄ Ｃ Ｑ Ｅ Ｇ Ｈ Ｉ Ｌ Ｋ Ｍ Ｆ Ｐ Ｓ Ｔ Ｗ Ｙ Ｖ １Ｍ －１－１－２－３－１ ０－２－３－２ ０ １－１ ７ ０－２－１－１－１－１ ０ ２Ｎ １ ２ ２－１－１ ０－１－１－１－１－１ ０ ３－２－２ １ ０－３－２－１ ３Ｋ ０ ０－１ ０－２ １ ２－２－１ ０－１ １－１－３ ２－１－１－３－２ １ ４Ｒ ０ ３－１－２ ４ ０－１－２－１ ０ ０ ０ ０－２－２ １－１－３－２－１ ５Ｙ １ ０－２－２－２－１－１－２－１ ０ ０－１ ０－１ ３ ０－１－２ ２ ０ ６Ｌ －１ ２－１－１－２ ０ ０－２－１－１ ０ ３ ２－２－２ ０ １－２－２－１ ７Ｑ １ ０ ０－１－１ １ ０－１－１－２－２ ０－１－２－１ ２ ２ ３－１－１ ８Ｋ －１－１ ２－１－２－１－１ ０－１ ０ ０ １ ２－１－２ ０ ０－３－２ ２ ９Ａ ０ ０－２－２－１－１－２－２－２ ０ ０－１ ０－１－２ ０－１ ７ ０ ０ １０Ｔ ０ １ ０－１－１ ０－１－１－１－１ ０ ０ ０－２ １ ２ １－３－２－１ １１Ｑ １ ０ ０－１－１ ２ ０－１－１－１ ０ ０ ０－２ ０ ２ ０－３－２－１ １２Ｇ ０ ０ ０ ２－２－１ ０ ３ ４－２－２－１ ２－２－２ ０－１－２－１－２ １３Ｋ １－１－１－１－２－１－１ ２－２－３－２ ０－１－１－２ ２－１ ７－１－２ １４Ｌ ０－２－２－３－１－２－２ １－２－１ ０－２ ０ ０－２－１ １ ８ ０－１ １５Ｌ ２－２－３－３－１－２－２－２－３ １ ３－２ ０－１－２－１ ０－３－１ ２ １６Ｉ －１－２－３－４－１－２－３－４－３ ２ ４－２ １ １－３－２－１－２ ０ １...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：C鲍尔，M优克，RJ法根，D米哈洛维奇，I姆肯德里克，
申请(专利权)人：阿雷斯贸易股份有限公司，
类型：发明
国别省市：CH[瑞士]
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