包含与Ⅱ型糖尿病有关的单核苷酸多态性的多核苷酸、包含该多核苷酸的微阵列和诊断试剂制造技术

本发明专利技术提供了用于诊断或治疗Ⅱ型糖尿病的多核苷酸，其包括选自核苷酸序列ＳＥＱ　　ＩＤ　　ＮＯＳ：１－８０的核苷酸序列的至少１０个连续的核苷酸，并包括在所述核苷酸序列的１０１位的核苷酸，或其互补多核苷酸。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及与II型糖尿病有关的多核苷酸，包含该多核苷酸的微阵列和诊断试剂盒，和分析与II型糖尿病有关的多核苷酸的方法。
技术介绍
所有生物体的基因组在它们持续进化的过程中经受自发突变，产生先祖核酸序列(progenitor nucleic acid sequences)的变体形式(Gusella，Ann.Rev.Biochem.55，831-854(1986))。所述变体形式可赋予相对于先祖形式的进化优点或缺点，或可为中性形式(neutral)。在一些情况中，变体形式赋予致死的缺点，并且不遗传到该生物体的后代。在另外的情况中，变体形式将进化优点赋予物种，并最终整合入该物种大多数成员的DNA中且有效地变为祖先形式。在许多情况中，祖先及变体形式都幸存并在物种的种群中共存。序列的多种形式的共存引起多态性。已知几种不同类型的多态性(polymorphisms)，包括限制性片段长度多态性(RFLPs)、短串联重复(STRs)、可变数串联重复(VNTRs)和单核苷酸多态性(SNPs)。其中，SNPs具有相同物种的个体之间单核苷酸变异的形式。当SNPs在蛋白编码序列中发生时，任一种多态性形式可引起缺陷或变体蛋白的表达。在另一方面，当SNPs在非-编码序列中发生时，这些多态性中的一些可导致缺陷或变体蛋白的表达(例如，作为缺陷剪接(defective splicing)的结果)。其他的SNPs可以完全不具有表型效应(phenotypic effect)。已知人SNPs以大约1,000bp中1个的频率发生。当这样的SNPs诱导表型的表达，如疾病时，含有该SNPs的多核苷酸可用作诊断疾病的引物或探针。特异性地与该SNP结合的单克隆抗体也可用于诊断疾病。目前，SNPs的核苷酸序列和功能的研究正由许多研究所进行。鉴定出的人SNPs的核苷酸序列和其他实验结果已经制成数据库以使其便于获得。虽然迄今可利用的发现显示，具体的SNPs存在于人基因组或cDNAs上，但还没有揭示出所述SNPs的表型效应。除去少量的SNPs之外，大多数SNPs的功能也还没有公开。已知糖尿病患者总数的90-95％罹患II型糖尿病。II型糖尿病是这样的病症，其在异常产生胰岛素或对于胰岛素具有低敏感性的患者中发生，由此导致血糖水平的巨大变化。当胰岛素分泌的紊乱导致II型糖尿病的条件时，不能将血糖转移到体细胞，这使得食物向能量的转化变得困难。已知遗传原因在II型糖尿病中起作用。II型糖尿病的其它危险因子是年龄超过45、糖尿病肥胖症(obesity)、高血压(hypertension)和高胆固醇水平(high cholesterol level)的家族史(familial history)。目前，主要通过使用空腹血糖(fasting blood glucose)(FSB)测试、口服葡萄糖耐量试验(OGTT)等测定病理的表型改变，即，血糖水平来进行糖尿病的诊断。当作出II型糖尿病的诊断时，通过锻炼、特殊饮食、体重控制、药物治疗等可预防II型糖尿病或可延迟其发病。在这点上，可以说II型糖尿病是一种非常需要早期诊断的疾病。Millenium Pharmaceuticals Inc.报道可根据HNF1基因上存在的基因型变异(genotypic variations)来进行II型糖尿病的诊断和预测。Sequenom Inc.报道FOXA2(HNF3β)基因与II型糖尿病高度相关。虽然有关于与II型糖尿病有关的一些基因的报道，但是已将发生II型糖尿病的研究集中在特定人群中一些染色体的特定基因上。为此，研究结果可根据人的种类变化。此外，还没有鉴定出造成II型糖尿病原因的所有成因基因(causative gene)。通过所述的分子生物技术来诊断II型糖尿病现在是罕见的。另外，在II型糖尿病发病前的早期诊断目前是不可行的。因此，越来越需要找到新的与II型糖尿病高度相关的SNPs和存在于整个人基因组中的相关基因，并需要使用所述的SNPs和相关基因进行II型糖尿病的早期诊断。专利技术详述本专利技术的技术目标本专利技术提供了含有与II型糖尿病有关的单核苷酸多态性的多核苷酸。本专利技术也提供了微阵列和II型糖尿病诊断试剂盒，其每个包括含有与II型糖尿病有关的单核苷酸多态性的多核苷酸本专利技术也提供了分析与II型糖尿病有关的多核苷酸的方法。本专利技术的公开本专利技术提供了用于诊断或治疗II型糖尿病的多核苷酸，其包括选自核苷酸序列SEQ ID NOS1-80的核苷酸序列的至少10个连续的核苷酸，并包括在所述核苷酸序列的多态性位点(第101位)的核苷酸，或其互补多核苷酸。所述多核苷酸包括含有核苷酸序列的多态性位点的至少10个核苷酸的连续跨度(span)，所述核苷酸序列选自SEQ ID NOS1-80的核苷酸序列。所述多核苷酸长度为10至400个核苷酸，优选10至100个核苷酸，而且更优选10至50个核苷酸。在此，SEQ ID NOS1-80中每个核苷酸序列的多态性位点位于101位。SEQ ID NOS1-80的每个核苷酸序列是多态性序列。该多态性序列指含有多态性位点的核苷酸序列，在该多态性位点处发生单核苷酸多态性(SNP)。所述多态性位点指多态性序列的位置，在该位置发生SNP。所述核苷酸序列可为DNAs或RNAs。在本专利技术中，SEQ ID NOS1-80的多态性序列的多态性位点(第101位)与II型糖尿病相关。这通过源自II型糖尿病患者和正常人的血样的DNA序列分析得到确认。SEQ ID NOS1-80的多态性序列与II型糖尿病的关联和所述多态性序列的特点总结于表1-1、1-2、2-1和2-2。表1-1 表1-1(续) 表1-2 表1-2(续) 表2-1 表2-1(续) 表2-2 表2-2(续) 在表1-1和1-2中，栏中的内容定义如下。-Assay ID代表标记物名称。-SNP为SNP多态性位点的多态性碱基。此处，A1和A2分别代表低频等位基因(low mass allele)和高频等位基因(high mass allele)，作为根据同源MassEXTEND(hME)技术(Sequenom)序列分析的结果，并为了实验的方便任意地设计。-SNP序列代表含有SNP位点的序列，即，在101位含有等位基因A1或A2的序列。-在等位基因频率栏，cas_A2、con_A2和Delta分别代表病例组的等位基因A2频率、正常组的等位基因A2频率和cas_A2与con_A2之差的绝对值。此处，cas_A2为病例组中的(基因型A2A2频率×2+基因型A1A2频率)/(样品数×2)，而con_A2为正常组中的(基因型A2A2频率×2+基因型A1A2频率)/(样品数×2)。-基因型频率代表每种基因型的频率。此处，cas_A1A1、cas_A1A2和cas_A2A2分别为病例组中具有基因型A1A1、A1A2和A2A2的个体的数目，而con_A1A1、con_A1A2和con_A2A2分别为正常组中具有基因型A1A1、A1A2和A2A2的个体的数目。-df＝2代表具有两个自由度的chi-平方值。chi-value代表chi-平方值，p本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于诊断或治疗Ⅱ型糖尿病的多核苷酸，其包含选自核苷酸序列ＳＥＱ　　ＩＤ　　ＮＯＳ：１－８０的核苷酸序列的至少１０个连续的核苷酸，并包含在所述核苷酸序列的２０１位的核苷酸，或其互补多核苷酸。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：李圭祥，金载洽，朴卿希，李娟受，孙玉庆，赵志荣，朴娟雅，洪性宇，黄贞周，全涍廷，
申请(专利权)人：三星电子株式会社，
类型：发明
国别省市：KR[韩国]