RelB基因rs28372683 SNP在制备检测丙型肝炎易感性产品中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种人基因组中NF‑κB通路的RelB基因rs28372683单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）或基因型在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品或与丙型肝炎相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；在实际应用中，可将检测rs28372683的多态性（即等位基因）或基因型物质与其他物质（如检测其它的与丙型肝炎相关的单核苷酸多态性或基因型物质）联合在一起制备筛查丙型肝炎易感者的产品。

Application of RelB gene rs28372683SNP in the preparation of products for detection of susceptibility to hepatitis C

The invention discloses a human genome NF B pathway RelB gene rs28372683 single nucleotide polymorphism (single nucleotide polymorphism, SNP) in the preparation of applications or genotype detection or screening susceptibility to hepatitis C and hepatitis C related products or single nucleotide polymorphisms in the products; in practice, can the polymorphism of rs28372683 (i.e., allele or genotype) substances and other substances (such as detection of hepatitis C virus genotype single nucleotide polymorphism or other materials) together to prepare the hepatitis C screening susceptible products.

【技术实现步骤摘要】
RelB基因rs28372683SNP在制备检测丙型肝炎易感性产品中的应用
本专利技术涉及生物医药领域，特别是一种人基因组中NF-κB通路的RelB基因rs28372683单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)在制备检测丙型肝炎易感性产品中的应用。
技术介绍
SNP指的是单个核苷酸突变而引起的核酸序列的改变。一个SNP位点有两个等位基因，在人类基因组中，平均每100-300个核苷酸中存在一个SNP，SNPs是人类最常见的遗传变异类型。人类基因组的编码区和非编码区均分布有SNPs，大多数SNPs存在于非编码区。编码区的SNPs有非同义突变和同义突变，非同义SNPs可改变蛋白质的氨基酸序列，同义突变则不影响蛋白质编码。非编码区的SNPs可能影响基因的剪切、转录因子结合、mRNA降解等。人类SNPs的分布具有差异，导致了不同种族、人群的染色体基因组具有多样性，也导致了人体对疾病的易感性、病程进展、转归，及药物治疗效果存在差异。目前SNPs已被视为一种生物标志物，广泛用于研究遗传变异与人类疾病的关系。丙型病毒性肝炎是一种由丙型肝炎病毒(HCV)感染引起的病毒性肝炎。全球共有1.85亿HCV感染者，中国的HCV感染率约为1.6％，输血、注射吸毒、器官移植和血液透析已经成为国内主要的HCV传播途径。HCV急性感染可有两种不同的结局：病毒自限性清除和持续性感染。自限性清除者指的是HCV感染人体后，机体未经治疗、在感染后的12个月内自动清除HCV，从而免于持续性感染，表现为HCVRNA阴性，HCV抗体阳性。持续性感染指的是HCV感染人体后，机体未经治疗、在感染后的12个月内不能清除HCV，表现为HCVRNA阳性，HCV抗体阳性。超过70％的HCV感染者可发展为持续性感染，其中一部分患者还可能发展成为肝硬化、肝细胞肝癌(HCC)。HCV感染者的病情发展和转归可受多种因素可影响，包括病毒、宿主免疫和遗传因素。在过去几年中，在全球多项大型临床试验中，新的直接抗病毒药物(direct-actingantiviralagents,DAAs)将慢性丙肝的治愈率显著提高到95％以上，已成为传统的聚乙二醇干扰素+利巴韦林治疗方案的更优选择。然而，随着DAAs药物的应用，不断有新问题涌现：HBV/HCV合并感染者使用DAA药物可致HBV再激活；在部分获得持续性病毒应答(SVR)的肝硬化患者中，DAAs的应用并不能降低HCC的发生率；DAAs治疗还可导致耐药的发生，目前已确认的耐药相关突变(resistanceassociatedvariants,RAVs)位点包括NS3/4A靶点相关、NS5A靶点相关和NS5B靶点相关的几十个RAVs。考虑到阻止HCV传播的首要问题是筛查、识别易感人群。因此，进行中国人群遗传背景与HCV感染的关系的研究，对于深入探索遗传因素在丙肝病程进展的作用机制，为及时、有效防控丙肝流行提供有效的靶点、工具及理论基础，具有重要的现实意义。NF-κB是核转录因子，具有和某些基因上启动子区的特定核苷酸序列结合而启动基因转录、调节细胞增殖、凋亡、炎症过程及免疫应答的功能。NF-κB可被细菌/病毒抗原、细胞因子等许多刺激物激活，继而调节150多种基因的表达。NF-κB/ReL家族成员有c-ReL、NF-κB1(P50)、NF-κB2(P52)、ReLA(P65)、ReLB。这些蛋白都有一个大约由300个氨基酸组成的氨基末端，称为ReL同源区，包括DNA结合部位、二聚体化部位及与NF-κB抑制蛋白(IκB)结合位点。有活性的DNA结合的NF-κB是P50与P65二聚体。ReL蛋白成员间可形成同源或异源二聚体，不同的NF-κB/ReL蛋白二聚体具有不同的结合序列，而且各有特性，不同二聚体可识别不同的DNA靶目标，而对不同调节基因的表达能力得以提高。NF-κB蛋白P50/P65、P50/c-ReL、P65/c-ReL复合体具有转录激活作用，而P50/P50和P52/P52同源二聚体则具有转录抑制作用。现有研究表明，NF-κB家族基因(NF-κB1、NF-κB2、RelA、RelB、ReL)及其抑制基因IκB可能通过相关SNPs对宿主对HCV的易感性及体内抗病毒的免疫应答产生影响。2014年，有研究表明NF-κBε(IkBε)rs2233437-A显著提高宿主HCV自限清除能力，提示了NF-κB通路相关基因多态性可能与HCV感染转归存在关联。近年来研究发现，NF-κB1基因启动子区的rs28362491位点(ATTG插入/缺失)与中国人群的肝癌风险升高(WangX,HaoX,WangH,etal.ImpactofNFKB1andNFKBIAgenepolymorphismandadditionalgene-geneinteractiononlivercancerriskinChinesepopulation.INTERNATIONALJOURNALOFCLINICALANDEXPERIMENTALPATHOLOGY2016,9:12968-12975.)及慢性丙肝发展为慢性肝病的进展有关(FakhirF-Z,LkhiderM,BadreW,etal.The-94Ins/DelATTGpolymorphisminNFκB1promotermodulateschronichepatitisCandliverdiseaseprogression.Infection,GeneticsandEvolution2016,39:141-146.)；NF-κB1基因rs230530位点与肝癌(Gao,J.etal.GeneticpolymorphismofNFKB1andNFKBIAgenesandlivercancerrisk:anestedcase–controlstudyinShanghai,China.BMJopen4,e004427(2014).)及酒精依赖(Edenberg,H.J.etal.AssociationofNFKB1,whichencodesasubunitofthetranscriptionfactorNF-κB,withalcoholdependence.Humanmoleculargenetics17,963-970(2008).)有关。然而，目前国内外关于RelB基因rs28372683单核苷酸位点的多态性与丙型肝炎感染易感性的研究还没有报道。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种NF-κB通路RelB基因单核苷酸多态性rs28372683在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品中的应用。具体而言，本专利技术首先提供了以下任一用途：(1)人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品中的应用。(2)人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型在制备检测或筛查与丙型肝炎相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。其次，本专利技术还提供了以下任一用途：(1)检测人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品中的应用。(2)本文档来自技高网...

【技术保护点】
人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性或基因型在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性或基因型在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品中的应用。2.人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性或基因型在制备检测或筛查与丙型肝炎相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。3.检测人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性或基因型的物质在制备检测或筛查丙型肝炎易感性产品中的应用。4.检测人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性或基因型的物质在制备检测或筛查与丙型肝炎相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。5.根据权利要求3或4所述的应用，其特征在于，所述检测人基因组中RelB基因rs28372683单核苷酸多态性或基因型的物质包括TaqManPCR试剂。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述TaqManPCR试剂包括扩增人基因组中RelB基因rs28372683在内的基因组DNA片段的PCR引物和T...

【专利技术属性】
技术研发人员：岳明，张津玮，李军，李毓雯，朱传龙，周锋，韩亚萍，田亭，张云，
申请(专利权)人：南京医科大学第一附属医院，南京大学医学院附属鼓楼医院，
类型：发明
国别省市：江苏,32