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拟穴青蟹蛋白二硫键异构酶保守区域cDNA序列及其克隆方法技术

技术编号:1710867 阅读:300 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
拟穴青蟹蛋白二硫键异构酶保守区域cDNA序列及其克隆方法,涉及一种cDNA序列。提供一种拟穴青蟹蛋白二硫键异构酶保守区域cDNA序列及其克隆方法。拟穴青蟹蛋白二硫键异构酶保守区域cDNA序列是从拟穴青蟹脑组织中得到的PDI_a_PDI_a′_C保守区域的cDNA序列,它具有SEQ  ID  NO  1所示的序列。从拟穴青蟹克隆PDI_a_PDI_a′_C保守区域cDNA的方法包括:从拟穴青蟹的脑组织中提取总RNA;以拟穴青蟹脑组织总RNA为模板进行cDNA第一链合成;利用保守区域特异性引物和3’RACE引物进行RT-PCR反应;PDI保守区域的基因克隆和测序:cDNA片段的序列分析。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种cDNA序列,尤其是涉及一种拟穴青蟹蛋白二硫键异构酶保守区域基因 及其克隆方法。技术背景蛋白二硫键异构酶(PDI)是真核生物中广泛存在的一类蛋白,主要集中于内质网中,在 大部分组织和器官中以组成型表达。细胞内粗面内质网越多,结构越复杂,分布越密集,PDI 的含量及活性也就越高。PDI能通过催化分泌蛋白二硫键的形成、断裂和重排以帮助底物获 得正确的构象,但同时也发现该蛋白没有底物特异性,并且对那些不具备二硫键的蛋白也能 指导其正确折叠和分泌,所以PDI兼具分子伴侣和酶的特性(见文献1 、 Noiva R, Lennarz WJ. Protein disulfide isomerase. A multifunctional protein resident in the lumen of the endoplasmic reticulum . Biological Chemistry, 1992, 267(6):3553—3556; 2、 Freedman RB, Hirst TR, Tuite MR Protein disulphide isomerase: building bridges in protein folding. Trends Biochem Sci, 1994, 19(8):331 — 336)。象这样的一类分子被称为折叠酶(foldase), PDI是目前发现仅有的两种折叠 酶之一,故而有着较高的研究价值。除了在酶化学、分子伴侣和结构生物学上的研究意义以 外,PDI还和包括酵母生孢反应、T细胞抗原呈递、前胶原成熟加工等多种生物过程有关, 甚至还构成了另一些酶的亚基,如人脯氨酰-4-羟化酶p亚基(见文献3、TainaP, TarjaH, Kaisa T, et al. Molecular cloning of the P-subunit of human prolyl 4-hydroxylase. This subunit and protein disulphide isomerase are products of the same gene . The EMBO Journal, 1987,6(3): 643 — 649)。此外由于二硫键的形成是许多蛋白折叠途径中的限速步骤,PDI在应用开发方面也极 具价值,如在抗体突变研究中,作为无细胞翻译体系的添加物,PDI蛋白可以极大地改善反 应效率和实验效果。又如在酵母中表达外源分泌蛋白时,通过提高PDI的表达水平,可望将 目的蛋白的表达和分泌提高数十倍,这一点尤其具有经济价值(见文献4、 RobineonA,Hines V, Wittrup K. Protein disulfide isomerase over expression increases secretion of foreign proteins in Sac-charomyces cerevisiae. Biotechnology, 1994, 12:381—384)。PDI由6个保守区域(a, e, b, b', a', c)组成,其中a和a'区与硫氧还蛋白家族同源(见 文献5、 Edm肌JC, Ellis L, Blacher RW, et al. Sequence of protein disulphide isomerase and implications of its relationship to thioredoxin. Nature ,1985,317:267 — 270),都含有独立的具有异构酶活性的催化位点-CGHC-(见文献6、 Vuori K, Pihlajaniemi T, MyllylaR, et al. Site-directed mutagenesis of human protein disulphide isomerase: effect on the assembly, activity and endoplasmic reticulum retention of human prolyl 4-hydroxylase in Spodoptera frugiperda insect cells. The EMBO Journal, 1992, 11(11): 4213—4217; 7、 Reiko U, Tsuneyuki O, Hiroshi I, et al. Functions of Characteristic Cys-Gly-His-Cys (CGHC) and Gln-Glu-Asp-Leu (QEDL) Motifs of Microsomal ER-60 Protease . Biochem. 1997,122:834—842)。PDI_a—PDI—a'_C保守区域(NCBI编号cd02995)是属于PDIa家族C端硫氧还原蛋白(a,) 亚家族。该保守区域除了参与构成PDI还参与构成ERp72, ERp57(或ERp60)和EFP1 C端 氧化还原活性区域(见文献8、 Walker KW, Lyles MM, Gilbert HF. Catalysis of oxidative protein folding by mutants of protein disulfide isomerase with a single active-site cysteine. Biochemistry, 1996,35(6):1972 —1980; 9、 N0rgaard P, Winther J R. Mutation of yeast Euglp CXXS active sites to CXXC results in a dramatic increase in protein disulphide isomerase activity. Biochem,2001, 358(1):269—274; 10、 Lappi AK, Lensink MF, Alanen HI, et al. A conserved arginine plays a role in the catalytic cycle of the protein disulphide isomerases. J. Mol. Biol" 2004, 335(1):283—295)。早 前对PDI及其众多同源蛋白的报道涵盖了从线形动物、节肢动物到鱼类、两栖类、鸟类、哺 乳类,还包括很多植物和真菌(NCBI GenBank)。在节肢动物门中,昆虫纲中果蝇的PDI基 因已被深入研究(见文献11 、 McKay RR, Zhu L, Shortridge RD. A Drosophila gene that encodes a member of the protein disulfide isomerase/phospholipase C-alpha family. Insect Biochem Mol Biol, 1995,25(5):647 _654 ),但在甲壳纲仅见桡足亚纲的鲑疮痂鱼虱(Z^eop/^ezV^ ra/附o"本文档来自技高网...

【技术保护点】
拟穴青蟹蛋白二硫键异构酶保守区域cDNA序列,其特征在于CCTGTTACTGTTGCTGTTGCCAAGAACTTTGAAGAAGTTGTTACAAACTCTGAGAAAGAT60GTCTTGATAGAGTTCTATGCTCCTTGGTGTGGCCATTGCAAGAAATTGGCCCCAACCTAC120GATGAGTTGGGCGAGGCGATGAAGAATGAGAATGTTGCCATTGTGAAAATGGATGCAACT180GCCAATGACGTTCCACCATCCTTCAATGTGAGAGGATTCCCTACAATTTTCTGGAAGCCA240GCTGGAGGTTCCCCAGTTTCATATAATGGTGGCCGGGAATTGGATGACTTCATCAAATAT300ATT303a)序列特征:*长度:303碱基对*类型:核酸*链型:双链*拓扑结构:线性b)分子类型:cDNAc)假设:否d)反义:否e)最初来源:拟穴青蟹(Scyllaparamamosain)。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:叶海辉刘元婧杨玉荣黄辉洋
申请(专利权)人:厦门大学
类型:发明
国别省市:92[中国|厦门]

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