本发明专利技术涉及家禽育种领域，具体涉及一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记及应用，它是朗德鹅TGH基因的5’‑UTR区域部分序列，该分子标记核苷酸系列如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3或/和SEQ ID No.4所示。在本发明专利技术的技术方案中，朗德鹅群体中只有一种单倍型，该基因10 个位点在该品种中有已经固定，将其命名为LD1，而在地方品种中则出现另外两种单倍型ZD1和ZD2，群体水平的测试表明LD1单倍型鹅肥肝重要显著大于ZD1和ZD2。该选择的效果显著，检测方法简单快捷，且不受外界环境的影响，可以用于朗德鹅鹅肥肝重的分子遗传标记。
【技术实现步骤摘要】
一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记及应用
本专利技术涉及家禽育种领域，具体涉及一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记及应用。
技术介绍
鹅肥肝是世界三大美食之一，备受人们喜爱，由于价格不菲，鹅肥肝产业也是养殖业中利润较高的一个行业，对于农民增收脱贫具有重要意义。鹅肥肝重是衡量鹅产肝能力的一个重要指标，也是鹅肥肝生产中的重要经济性状，同时也是典型的数量性状。家禽育种工作中，通过分子生物学中的策略和方法可以鉴定出许多与鹅肥肝重相关联的候选基因法，这些基因中所包含的遗传变异可被用于家禽重要经济性状的有效选择，称之为标记辅助选择（MarkerAssistedSelection，MAS）。在实际生产中，朗德鹅因其良好的产肝效率和肥肝品质被广泛用于鹅肥肝生产，根据申请人此前的研究发现，朗德鹅肝脏在28天的填饲期内可以从约150克增加至2000克，然而，剩余的增重并不会引起朗德鹅肝脏的生理性病变，在填饲结束后，经过一周即可恢复如初，群体水平的测试表明，朗德鹅群体鹅肥肝均重都超过1000克（11月和3月填饲结束），表现出极强的肝脏蓄脂增重能力。相对于朗德鹅，其他鹅种，尤其是中国地方鹅种，由于没有系统的肝用性状选育工作，其产肝能力较差，在鹅肥肝生产中基本得不到应用，丧失了一种非常重要的生产用途。浙东白鹅的生产性能数据表明，在30天的填饲期内，其肝脏量从约100克增加至最大650克，平均肥肝重不足400克。事实证明，朗德鹅经过高强度选育，基因组上势必存在与鹅肥肝重密切相关的基因，因此，通过利用肝产量优异的朗德鹅某些基因单倍型来用于MAS工作，也将帮助我们在地方品种中开发肝用型品系。家鹅通过短期内摄入大量高能饲料将多余能量在肝细胞中以甘油三酯（Triacylglycerol，TG）的形式储藏，肝脏分泌脂肪的能力差异是导致鹅肥肝重不同的一个重要因素，肥肝型的物种或者品种总是转运或分泌出更少的脂类，将更多的脂类保留在肝脏中以备氧化供能。TGH（TGhydrolase，TGH）基因是肝细胞中分解TG用于分泌的最重要水解酶，当细胞分泌TG时，TGH先将细胞质中的脂滴TG分解为甘油二酯（Diacylglycerol，DG），此时DG通过内质网膜进入内质网（Endoplasmicreticulum，ER），内质网中的DG在二酰甘油合酶DGAT2作用下重新生成TG用于极低密度脂蛋白的组装，这一过程需要TG转运蛋白MTP（Microsomaltriacylglyceroltransferprotein，MTP）、磷脂酶PLD（PhospholipaseD，PLD）、ApoB等基因的编码产物共同参与，TG最终将以VLDL的形式分泌进入血液转运至机体其他部位。由此可知，TGH为VLDL的形成提供了最主要底物，其活性的高低将决定个体肝脏分泌脂类的能力，也最终影响鹅肥肝重。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术问题是提供一种利用单倍型提高朗德鹅填饲后鹅肥肝重的方法，该方法利用朗德鹅TGH基因的单倍型对本群体填饲后鹅肥肝重进行标记辅助选择，不受环境影响。为实现上述目的，本专利技术采用的技术方案是：一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记，它是朗德鹅TGH基因的5’-UTR区域部分序列，该分子标记核苷酸系列如SEQIDNo.1、SEQIDNo.2、SEQIDNo.3或/和SEQIDNo.4所示,SEQIDNo.1片段的序列长度为1150bp，SEQIDNo.2片段的序列长度为626bp,SEQIDNo.3片段的序列长度为1418bp，SEQIDNo.4片段的序列长度为845bp；目的片段经琼脂糖凝胶电泳检测后用于Sanger测序得到DNA序列，经过ChromasV2.1.3软件比对后获取SNP位点及其形成的单倍型。其中所述SEQIDNo.1第570位点由A>G、第582位点由A>C、第887位点由T>C、第1019位点由A>G，所述SEQIDNo.2第353位点由T>C，所述SEQIDNo.3第610位点由T>C、第647位点由G>C、第698位点由A>T、第704位点由C>G，所述SEQIDNo.4第300位点由T>C。显然对于本领域技术人员来说，扩增上述分子标记的引物也属于本专利技术要求保护的范围，用于扩增SEQIDNo.1的引物为US1,序列为：F：5'-TCATTTAGTCTTCATCGGG-3'，R：5'-CCTCCTACCTTATTTGTGTGAT-3'；用于扩增SEQIDNo.2的引物为USP11,序列为：F：5'-GAGGGCAAAAGTCTTCTGAT-3'，R：5'-ATTTGGGTAGTAACCGCACA-3'；用于扩增SEQIDNo.3的引物为US3,序列为：F：5'-CACTGTGTTTGGCTTTGTA-3'，R：5'-TTCTCCACCTACCACTCAG-3',用于扩增SEQIDNo.4的引物为US4,序列为：F：5’-TTCATATCACGCCTGGGTG-3’，R：CCTCCTCAGTGTATTGCCT-3’。本专利技术还保护一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记在朗德鹅育种中的应用。本专利技术的原理为：针对TGH基因设计4对引物（US1、USP11、US3和US4），引物US1扩增产物存在4个SNP位点，USP11产生1个SNP位点，US3产生1个SNP位点，US4产生4个SNP位点，这些位点均位于TGH基因的5’-UTR区域，是调控基因活性的重点候选区域。本专利技术的有益技术效果是：在本专利技术的技术方案中，朗德鹅群体中只有一种单倍型，该基因10个位点在该品种中有已经固定，将其命名为LD1，而在地方品种中则出现另外两种单倍型ZD1和ZD2，群体水平的测试表明LD1单倍型鹅肥肝重要显著大于ZD1和ZD2。该选择的效果显著，检测方法简单快捷，且不受外界环境的影响，可以用于朗德鹅鹅肥肝重的分子遗传标记。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。图1是朗德鹅TGH基因10个SNPs位点的序列比较。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。实施例1、采样随机采取江西汇和科技有限公司同一批次50只填饲朗德鹅血样，同时采集浙东白鹅、狮头鹅及皖西白鹅等3个地方品种各12个个体血液。采用AxyPrepBloodGenomicDNAMiniprepkit提取鹅基因组DNA，保存于TE溶液，提取完毕后利用Quawell公司的Q3000核酸浓度测定仪测定浓度和纯度并将基因组保存于-20℃冰箱。2、引物设计与PCR扩增根据GenBank中已发表的鹅TGH基因序列（GeneID:MG本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记，它是朗德鹅TGH基因的5’‑UTR区域部分序列，其特征在于，该分子标记核苷酸系列如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3或/和SEQ ID No.4所示；其中所述SEQ ID No.1第570位点由A>G、第582位点由A>C、第887位点由T>C、第1019位点由A>G，所述SEQ ID No.2第353位点由T>C，所述SEQ ID No.3第610位点由T>C、第647位点由G>C、第698位点由A>T、第704位点由C>G，所述SEQ ID No.4第300位点由T>C。
【技术特征摘要】
1.一种朗德鹅填饲后鹅肥肝增重的分子标记，它是朗德鹅TGH基因的5’-UTR区域部分序列，其特征在于，该分子标记核苷酸系列如SEQIDNo.1、SEQIDNo.2、SEQIDNo.3或/和SEQIDNo.4所示；其中所述SEQIDNo.1第570位点由A>G、第582位点由A>C、第887位点由T>C、第1019位点由A>G，所述SEQIDNo.2第353位点由T>C，所述SEQIDNo.3第610位点由T>C、第647位点由G>C、第698位点由A>T、第704位点由C>G，所述SEQIDNo.4第300位点由T>C。2.用于扩增权利要求1所述分子标记的引物，其特征在于...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨云周，何大乾，刘毅，王翠，王慧影，龚绍明，
申请(专利权)人：上海市农业科学院，
类型：发明
国别省市：上海,31
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