一种在DNA序列特定位点上装配染色质结构的能力检测方法技术

本申请涉及分子生物学领域，尤其涉及一种在DNA序列特定位点上装配染色质结构的能力检测方法，用以解决现有技术无法定点检测核小体占据率以确定染色质结构装配能力的问题。该方法主要是将含有特定限制性内切酶位点的DNA序列装配成染色质结构，用限制性内切酶进行酶切消化，去除各种蛋白后电泳检测，定量化计算该位点及其附近DNA序列核小体占据率，判断检测位点附近染色质局部结构。进而，分析出DNA序列上特定位点装配染色质结构的效率及核小体的组装能力，该检测方法实现过程简单、便捷，特异性及准确率高。

An ability detection method for assembling chromatin structure on DNA sequence special location point

The application involves in the field of molecular biology, especially a method for detecting chromatin structure on DNA sequence specific location points, so as to solve the problem that existing technology can not detect nucleosome occupancy rate to determine chromatin structure assembly ability. This method is mainly containing specific restriction sites DNA sequence assembly into chromatin structure, enzyme digestion with restriction endonuclease and electrophoresis detection to remove all kinds of protein, the quantitative calculation of the site and the nearby DNA sequence of nucleosome occupancy near the sites of chromatin in evaluating local structure. Then, we analyze the efficiency of constructing the chromatin structure and the assembly ability of nucleosomes on the DNA sequences, which is simple, convenient, specific and accurate.

【技术实现步骤摘要】
一种在DNA序列特定位点上装配染色质结构的能力检测方法
本申请涉及分子生物学领域，尤其涉及一种在DNA序列特定位点上装配染色质结构的能力检测方法。
技术介绍
核小体是真核生物染色质基本结构单元，H2A、H2B、H3和H4四种组蛋白各两个拷贝组成一个组蛋白八聚体，约147bp的DNA序列在其上以左手螺旋的方式缠绕1.7圈，构成核小体核心颗粒。核心颗粒之间由20-80bp的DNA连接，在组蛋白H1的作用下进一步压缩包装成30nm染色质二级结构。作为一种真核生物染色质基本结构单元，核小体及染色质具有结构与功能的双重作用。核小体在基因组DNA上的位置及染色质的局部结构对包括DNA复制、转录、修复、重组及剪接等在内的众多生物学过程起着调控作用，主要体现在以下几个方面：(1)、核小体为基因组DNA在体内高度压缩提供了最基本的结构单元；(2)、核小体在基因组DNA上动态变化调控了以染色质DNA为模板的DNA复制、修复及重组等生物学过程；(3)、核小体的形成会影响反式作用因子与核小体DNA的作用；(4)、染色质局部结构的开放或压缩状态会调控基因的转录活性。因此，DNA序列特定位点装配核小体及染色质结本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种在DNA序列特定位点上装配染色质结构的能力检测方法，其特征在于，包括：在确定的采样DNA序列上装配染色质结构，所述采样DNA序列上含有特定位点；对装配有染色质结构的采样DNA序列进行限制性内切酶酶切消化；对酶切消化处理后的采样DNA序列进行蛋白酶处理，并进行电泳分析；根据电泳分析结果，计算所述采样DNA序列的特定位点的核小体占据率。

【技术特征摘要】
1.一种在DNA序列特定位点上装配染色质结构的能力检测方法，其特征在于，包括：在确定的采样DNA序列上装配染色质结构，所述采样DNA序列上含有特定位点；对装配有染色质结构的采样DNA序列进行限制性内切酶酶切消化；对酶切消化处理后的采样DNA序列进行蛋白酶处理，并进行电泳分析；根据电泳分析结果，计算所述采样DNA序列的特定位点的核小体占据率。2.如权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述特定位点为：位于检测位点的上、下游45bp范围内且具有限制性内切酶的单酶切位点。3.如权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述染色质结构为体外装配的染色质结构，具体包括：环状染色质结构和线状染色质结构。4.如权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述限制性内切酶为：检测位点对应的内切酶。5.如权利要求1所述的检测方法，其特征在于，对酶切消化处理后的采样DNA序列进行蛋白酶处理，具体包括：采用蛋白酶，对酶切消化处理后的采样DNA序列进行组蛋白、内切酶降解。6.如权利要求5所述的检测方法，其特征在...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵宏宇，蔡禄，张凤慧，赵秀娟，刘国庆，
申请(专利权)人：内蒙古科技大学，
类型：发明
国别省市：内蒙古,15