The present application discloses a reagent, detection method and application for the detection of N9 subtype avian influenza virus. N9 subtype avian influenza virus detection reagent of the application, including primers and probes, primers primers were Seq ID and Seq No.1 ID No.2 shown in sequence, as shown by Seq ID probe No.3 sequence or its reverse complementary sequence; SEQ ID probe sequence No.3 in thirty-fourth, 6 fluorophore modified bases dT, thirty-eighth base substitutions for dSpacer, thirty-ninth base modification in the fluorescence quenching group dT, 3 'end modified C3 Spacer. The reagents used in this application can be used to detect the N9 subtype avian influenza virus by recombinant enzyme polymerase for sensitive, specific and efficient detection. Compared with the existing detection methods, the reagents and detection methods in this application are short in time, easy to operate, quick to draw conclusions, suitable for on-site detection, and of great significance for the rapid prevention and control of N9 subtype avian influenza virus.
【技术实现步骤摘要】
用于N9亚型禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用
本申请涉及N9亚型禽流感病毒检测领域,特别是涉及一种用于N9亚型禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用。
技术介绍
禽流感病毒(Avianinfluenzavirus,AIV)属于正黏病毒科、A型流感病毒属,为单股负链RNA,分为8个独立的RNA节段,分别编码HA、NA、NP、NS、MP、PA、PB1和PB2等10个蛋白。AVI显著的生物学特征之一是亚型众多,变异频繁。根据血凝素(Hemagglutinin,HA)与神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)的抗原性不同,可分为16个HA亚型(H1~H16)和9个NA亚型(N1~N9),不同亚型毒株对宿主的致病力差异很大。2013年3月中国首次出现人感染H7N9亚型流感病例,经过国家禽流感参考实验室证实,此次禽流感疫情由全球首次发现的H7N9新型流感病毒引起,同时证实H7N9亚型禽流感病毒是一种新的重配病毒,能导致人类发生严重或致命的呼吸系统疾病。根据国家卫生计生委疾病预防控制局发布的法定传染病疫情概况,2013年3月至2017年6月,人感染H7N9禽流感发病数累计1445例,死亡数562例,严重威胁人类健康,引起了全世界的关注。其中,仅2017年上半年,人感染H7N9禽流感发病数累计636例,死亡数261例,可见当前H7N9禽流感疫情防控形势严峻。因此,开展N9亚型流感病毒的特异、敏感、快速的检测工作具有重要意义。
技术实现思路
本申请的目的是提供一种用于N9亚型禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用。本申请采用了以下技术方案:本申请的一方面公开了一种用于N9 ...
【技术保护点】
一种用于N9亚型禽流感病毒检测的试剂,其特征在于:所述试剂包括引物对和探针,所述探针在引物对的扩增靶标区域内,所述引物对的上游引物为Seq ID No.1所示序列,所述引物对的下游引物为Seq ID No.2所示序列,所述探针为Seq ID No.3所示序列或者Seq ID No.3所示序列的反向互补序列;Seq ID No.1:5’‑GCTCTCAGCCAAGGAACAACAATCAGAGGGAAAC‑3’Seq ID No.2:5’‑TGCAGATGCATTGTTGTTTGGTCCTGATAT‑3’Seq ID No.3:5’‑CAATACACGATAGGTCCCAGTATCGCGCCCTGATAAGCTGGCCACTATCATCACC‑3’其中,SEQ ID No.3所示的探针序列中,第34个碱基修饰6‑荧光基团‑dT,第38个碱基替换为碱基类似物,第39个碱基修饰荧光淬灭基团‑dT,3’端修饰C3Spacer。
【技术特征摘要】
1.一种用于N9亚型禽流感病毒检测的试剂,其特征在于:所述试剂包括引物对和探针,所述探针在引物对的扩增靶标区域内,所述引物对的上游引物为SeqIDNo.1所示序列,所述引物对的下游引物为SeqIDNo.2所示序列,所述探针为SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互补序列;SeqIDNo.1:5’-GCTCTCAGCCAAGGAACAACAATCAGAGGGAAAC-3’SeqIDNo.2:5’-TGCAGATGCATTGTTGTTTGGTCCTGATAT-3’SeqIDNo.3:5’-CAATACACGATAGGTCCCAGTATCGCGCCCTGATAAGCTGGCCACTATCATCACC-3’其中,SEQIDNo.3所示的探针序列中,第34个碱基修饰6-荧光基团-dT,第38个碱基替换为碱基类似物,第39个碱基修饰荧光淬灭基团-dT,3’端修饰C3Spacer。2.根据权利要求1所述的用于N9亚型禽流感病毒检测的试剂,其特征在于:所述6-荧光基团-dT为6-FAM-dT。3.根据权利要求1所述的用于N9亚...
【专利技术属性】
技术研发人员:曹琛福,秦智锋,林彦星,阮周曦,王潇,黄超华,陶虹,刘建利,陈兵,曾少灵,吕建强,杨俊兴,花群义,
申请(专利权)人:深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心,深圳市检验检疫科学研究院,清华大学深圳研究生院,
类型:发明
国别省市:广东,44
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