一种检测百合斑驳病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法技术

一种检测百合斑驳病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法，根据Genbank中查找到LMoV的CP序列进行引物设计，该LAMP引物组包括内引物FIP和BIP，外引物F3和B3，该LAMP引物组特异性强，与常见侵染百合的7种病毒无交叉，灵敏度高，可在模板纯度只有10

LAMP primer set, kit and detection method for detecting Lily mottle virus

A detection of Lily mottle virus LAMP primer set, kit and detection method, according to the Genbank to find CP sequence of LMoV primers, the LAMP primers including group inner primers FIP and BIP, the outer primers F3 and B3, the LAMP group specific primers, no cross, and 7 kinds of common virus infection Lily's high sensitivity in template purity is only 10.

【技术实现步骤摘要】
一种检测百合斑驳病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法
本专利技术属于植物病毒检测
，具体涉及一种检测百合斑驳病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法。
技术介绍
百合斑驳病毒(Lilymottlevirus，LMoV)是马铃薯Y病毒属(Potyvirus)成员，基因组为单分子正链RNA，约9.6kb，编码一个相对分子质量约350kDa的多聚蛋白，通过自我剪切后形成外壳蛋白CP、细胞质内含体蛋白cI等10个不同大小的功能蛋白。LMoV仅侵染百合科的郁金香属和百合属植物，可由摩擦接种或由蚜虫非持续性传播感染寄主，引起百合斑驳病。该病的相关报道最早见于1944年，症状主要表现为百合叶片有斑驳条纹甚至坏死斑，后期发展为花、叶片卷曲畸形，开碎色花，并常伴随植株矮小、花与球茎的减产等。由于扦插和分球等无性繁殖手段是百合种球生产的主要方式，使得百合一旦感染LMoV病毒后，在开放的环境中，病毒就会在该范围内积累扩散传播，造成更大的经济损失。百合斑驳病毒在我国百合主要产区的自然发病率在20～30％，有些甚至达到70％，从荷兰引进的种球带毒率就在30％以上。目前针对LMoV，传统的诊断方法主要有：本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于检测百合斑驳病毒的LAMP引物组，其包括外引物F3和B3，内引物FIP和BIP，从5’端到3’端，具体序列如下：F3:5’‑AATGGCGTGTGGCTCATG‑3’；B3:5’‑GGTGAGATTTCGCTGAAGGC‑3’；FIP:5’‑CGTCGGTTTTGCGTGTTCAAGTTTTTTGGACGGAGATCAGCAAGTT‑3’；BIP:5’‑GCGCATTTCTCAAACCTCGCTGTTTTCGTACCTAGGCATGTACGGT‑3’。

【技术特征摘要】
1.一种用于检测百合斑驳病毒的LAMP引物组，其包括外引物F3和B3，内引物FIP和BIP，从5’端到3’端，具体序列如下：F3:5’-AATGGCGTGTGGCTCATG-3’；B3:5’-GGTGAGATTTCGCTGAAGGC-3’；FIP:5’-CGTCGGTTTTGCGTGTTCAAGTTTTTTGGACGGAGATCAGCAAGTT-3’；BIP:5’-GCGCATTTCTCAAACCTCGCTGTTTTCGTACCTAGGCATGTACGGT-3’。2.一种包含权利要求1所述LAMP引物组的百合斑驳病毒的LAMP检测试剂盒。3.根据权利要求2所述百合斑驳病毒的LAMP检测试剂盒，其特征在于，其含有LAMP反应体系，该LAMP反应体系包括：内引物FIP、内引物BIP、外引物F3、外引物B3、10×buffer、Mg2+、dNTPs、甜菜碱和BstDNA聚合酶，其中，内引物与外引物的浓度之比范围为1-16：1。4.根据权利要求3所述百合斑驳病毒的LAMP检测试剂盒，其特征在于，所述LAMP反应体系中，各成分的终浓度为：内引物FIP0.8-1.6μM，内引物BIP0.8-1.6μM，外引物F30.1-0.8μM，外引物B30.1-0.8μM，Mg2+1.0-2.0mM，dNTPs0.2-0.4mM，甜菜碱0.4-0.8M，BstDNA聚合酶0.16-0.48U/μL，其中，内引物与外引物的浓度比为1-16：1。5.根据权利要求3所述百合斑驳病毒的LAMP检测试剂盒，其特征在于，LAMP反应体系中，各成分的终浓度为：内引物FIP0.8-1.0μM，内引物BIP0.8-1.0μM，外引物F30.5-0.8μM，外引物B30.5-0.8μM，Mg2+1.3-1.7mM，dNTPs0.3-0.4mM，甜菜碱0.4-0.6M，BstDNA聚合酶0.32-0.48U/μL，其中，内引物与外引物的浓度比范围为1-16：1。6.根据权利要求3所述百合斑驳病毒的LAMP检测试剂盒，其特征在于，LAMP反应体系中，各成分终浓度为：内引物FIP0.8μM，内引物BIP0.8μM，外引物F30.8μM，外引物B30.8μM，10×buffer，Mg2+1.5mM，dNTPs0.4mM，甜菜碱0.4M，BstDNA聚合酶0.32U/μL。7.一种百合斑驳病毒的LAMP快速检测方法，包括以下步骤：1)提取待测样品RNA，将总RNA的50ng...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵凯，蔡友铭，张永春，杨丹，范小瑞，赵笑，梁洁玲，杜亚楠，赵庆，史斌，赵桓震，赵斌安，潘磊，张琪，张晓霞，
申请(专利权)人：上海市农业科学院，
类型：发明
国别省市：上海,31