一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法技术

技术编号:16095770 阅读:51 留言:0更新日期:2017-08-29 19:56
本发明专利技术公开了一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法。本发明专利技术的引物共8对,其中7对SNP引物组合可以用于构建樟树的指纹图谱。本发明专利技术利用樟树转录组数据开发的SNP引物能够对不同樟树进行基因分型,并且本发明专利技术操作方法简单,通量高,成本低。此外,本发明专利技术开发的7对SNP引物构建了不同樟树的指纹图谱,验证的8个SNP位点还可以用来分子标记辅助育种,遗传多样性研究,基于SNP的关联分析,以及用于种质资源鉴定与分类等。

【技术实现步骤摘要】
一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法
:本专利技术属于生物
,具体涉及一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法。
技术介绍
樟树,别名香樟、芳樟、小叶樟等,隶属于樟科(Lauraceae)樟属(Cinnamomum),在我国具有重要的经济价值,且广泛分布于我国亚热带地区,如海南、江西、湖南、浙江、重庆、等省市区。樟树具有树姿雄伟、四季浓绿、灭菌驱虫和挥发香气等特点,发挥着重要的材用、药用、香料、油用和生态环境建设等价值。樟树因其可以提取天然樟脑和芳香油,而这两者分别是重要的工业和医药原料,因此针对樟树的研究也颇受关注。单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNP)主要是指由于单个核苷酸的变异而引起基因组水平上的DNA序列多态性,形式包括单碱基的缺失、插入、转换及颠换等。SNP是一种最常见的遗传变异,具有遗传稳定性高、位点丰富且分布广泛、富有代表性、检测快速、易于实现自动化分析等特点。另外,由于SNP自身具有密度高、分布广等特点,又加上先进的高通量SNP检测系统的研制,SNP标记将对未来生命科学领域产生重大的影响。本文档来自技高网...
一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物及检测方法

【技术保护点】
一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物,其特征在于,由8对引物组成,各引物的核苷酸序列如下表所示:

【技术特征摘要】
1.一种用于对不同樟树进行基因分型的SNP引物,其特征在于,由8对引物组成,各引物的核苷酸序列如下表所示:引物名称上游引物(5’to3’)下游引物(5’to3’)SNP1AAGCTGCAAACCCATTCGAGTGACCTGCTTGGCATACGCSNP2CATGGCTCTAATGGGCAATCTGCGGGCTCTCGTAGAAASNP3CGCCAGGCAGGGTAAGCCAACAGACAGGGCACTAAAGSNP4GCCTATAAGGGATAAGAGAATACATTTTACAAAGAGATTCCACATSNP5CAACCCTCTAATCAGTGATGAGGGTGGATCTTATCTTGAGATSNP6TGAGTTGAAACTTTATGAGGCCATCTACTTCAGTCCCACCTTSNP7CTCAAAAGGACAAGAGTGAGATGTTTGACTTCAGCAGAGACTSNP8AAGCTTCTTCTTCGATATAGACTACGAAAGAAGAAAGAGAAGAAC2.应用权利要求1所述的SNP引物构建樟树的指纹图谱,获得29个樟树对应的指纹图谱,如下表所示:3.根据权利要求2所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员:胥猛钟永达章昊郦芝汀王建文陈彩惠徐立安余发新
申请(专利权)人:南京林业大学江西省科学院生物资源研究所
类型:发明
国别省市:江苏,32

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