The present invention provides for SNP molecular marker combination of maize genotypes, consisting of 448 SNP markers, the SNP markers were numbered ZmSNP001 ~ ZmSNP448, their nucleotide sequences respectively such as SEQ ID NO:1 448 shows. By using SNP molecular marker combination of the invention can carry out molecular marker fingerprint analysis, identify the genotype of offspring, hybrid populations were identified, the varieties of authenticity analysis and selection of agronomic traits association analysis of genetic background on the maize breeding material resources, has broad application prospects.
【技术实现步骤摘要】
用于玉米基因分型的SNP分子标记组合及其应用
本专利技术涉及基因组学、分子生物学、生物信息学和分子植物育种领域,具体地说,涉及一种用于玉米基因分型的SNP分子标记组合及其应用。
技术介绍
外显子组测序(wholeexomesequencing,WES)和限制性内切酶关联位点测序(RADseq)是复杂基因组物种中应用较多的高性价比的用于SNP发掘的基因组测序方法。分子标记技术(Molecularmarkertechnologies)是分子育种中的重要工具。传统分子标记技术,如RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,限制性片段长度多态性)和SSR(SimpleSequenceRepeat,简单序列重复)技术曾在功能基因组研究中发挥着重要作用。但是,传统的分子标记技术存在许多局限性,如通量低、数量少、操作过程繁琐,不能满足大规模商业化育种的需求。为了对目标基因进行精确控制,对遗传背景进行有效选择,对育种品种进行准确分析和鉴定,需要开发和利用高通量分子标记技术。目前,高通量分子标记技术平台主要包括:第二代测序技术,基因芯片技术 ...
【技术保护点】
用于玉米基因分型的SNP分子标记组合,其特征在于,由448个SNP标记组成,所述SNP标记的编号分别为ZmSNP001~ZmSNP448,核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1‑448所示,它们的信息如表1所示。
【技术特征摘要】
1.用于玉米基因分型的SNP分子标记组合,其特征在于,由448个SNP标记组成,所述SNP标记的编号分别为ZmSNP001~ZmSNP448,核苷酸序列分别如SEQIDNO:1-448所示,它们的信息如表1所示。2.权利要求1所述SNP分子标记组合在玉米分子标记辅助育种中的应用。3.权利要求1所述SNP分子标记组合在制备玉米全基因组育种芯片中的应用。4.利用KASP技术检测玉米基因型的方法,其特征在于,包括以下步骤:1)根据448个SNP位点两侧翼各5...
【专利技术属性】
技术研发人员:邹继军,阮详经,卢东林,刘海波,王冰冰,刘法新,
申请(专利权)人:袁隆平农业高科技股份有限公司,华智水稻生物技术有限公司,
类型:发明
国别省市:湖南,43
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