与谷子穗长性状相关的分子标记及其检测引物和应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与谷子穗长性状相关的分子标记及其检测引物和应用，所述分子标记是PL‑02‑016，其位于谷子第2号染色体的序列第38395016bp位置，碱基为C/T。本发明专利技术的分子标记及其检测引物，可以预测谷子穗长，为实现谷子穗长性状的早期鉴定和筛选育种提供分子辅助技术支持。

Molecular markers related to panicle length characters of foxtail millet, detection primers and uses thereof

The invention discloses a correlation with ear length traits and molecular marker detection primer and application of the molecular marker is PL 02 016, which is located in chromosome second sequence millet 38395016bp location base for C/T. The molecular marker and the detection primer thereof can predict the panicle length of millet, and provide molecular auxiliary technical support for early identification and selective breeding of panicle length characters of Foxtail millet.

【技术实现步骤摘要】
与谷子穗长性状相关的分子标记及其检测引物和应用
本专利技术涉及谷子育种
，尤其涉及与谷子穗长性状相关的分子标记及其检测引物和应用。
技术介绍
我国是谷子的原产地和世界上栽培面积最大、产量最高的国家，产量约占全世界总量的80％。同时，我国也是谷子遗传资源数量最多、多样性最丰富的国家。穗长、株高等是影响谷子产量的重要因子，研究与控制谷子穗长等产量性状相关的基因位置及其功能等，对于指导谷子遗传育种具有重要的意义。单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)是基因组水平上由单个核苷酸碱基的变异引起的DNA序列多态性，其在基因组中数量多，分布广泛，遗传稳定性好。随着基因测序技术的发展和成本的降低，对不同个体同一基因或基因片段进行直接测序和序列比较，可以确定碱基是否存在变异。因此，SNP检测有利于基因分型，适用于快速和规模化筛查未知或已知SNP与某遗传性状的关系。目前关于谷子数量性状相关的QTL(quantitativetraitlocus)定位和SNP标记研究主要集中于SSR标记的开发利用等途经，而利用群体自交系基因组测序检测单核苷酸多态性(SNP)本文档来自技高网...

【技术保护点】
与谷子穗长性状相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记是PL‑02‑016，其位于谷子第2号染色体的序列第38395016bp位置，碱基为C/T。

【技术特征摘要】
1.与谷子穗长性状相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记是PL-02-016，其位于谷子第2号染色体的序列第38395016bp位置，碱基为C/T。2.根据权利要求1所述的与谷子穗长性状相关的SNP标记，其特征在于，所述PL-02-016位点所在的序列如SEQIDNO：3所示，所述PL-02-016位点是SEQIDNO：3所示序列自5’端起第148位碱基。3.根据权利要求1或2所述的与谷子穗长性状相关的SNP标记，其特征在于，对所述SNP标记，利用复合区间作图法，采用5%的总体显著水平，QTL检测的LOD值为3.7556，表型变异解释率为3.35%。4.一种用于检测如权利要求1-3任一项所述的SNP标记的引物对，其特征在于，包括：上游引物7_2F：5’-GTATGCTCCACGCCCTTTA-3’（SEQIDNO：1）和下游引物7_2R：5’-TTGCGATTACCACTTGATT-3’（SEQIDNO...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵治海，冯小磊，范光宇，王峰，魏玮，宋国亮，李双东，邹洪峰，任全军，
申请(专利权)人：张家口市农业科学院，
类型：发明
国别省市：河北,13