图像处理方法以及细胞分取方法技术

提供一种图像处理方法，包括以下工序：图像获取工序(S1)，对小片排列进行拍摄，获取包含已被分割的切片的整体的分割切片图像，该小片排列是将基板与该基板上的生物体组织的切片一起分割为多个小片而得到的排列；小片识别工序(S3)，从分割切片图像中识别小片的像；属性信息附加工序(S4)，对构成识别出的小片的像的像素的各个像素附加该像素所归属的小片的像在小片排列的像中的位置的信息；以及复原工序(S5)，将包括被附加了位置的信息的像素的小片的像彼此接合为一个像，由此生成将已被分割的切片的像接合为一个像所得到的复原切片图像。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】图像处理方法以及细胞分取方法
本专利技术涉及一种图像处理方法和细胞分取方法。
技术介绍
以往，已知如下一种方法：对粘接在薄板上的基板粘贴生物体组织的切片，通过薄板的伸展将基板与切片一起分割为多个小片，从薄板提取一部分小片，由此分取切片内的确定区域的细胞(例如，参照专利文献1)。在专利文献1中，从生物体组织的相邻位置切出两个切片，利用上述的方法将一方切片与基板一起分割，将另一方切片染色。而且，基于已被染色的切片的图像来决定切片内的所要提取的区域，提取与决定好的区域对应的位置的小片。专利文献1：国际公布第2012/066827号
技术实现思路
专利技术要解决的问题然而，在薄板上，非常多的微小的(例如，0.5mm以下的)小片以矩阵状排列。将分割前的基板和切片的图像与分割后的实际的基板和切片进行比较并从这样的小片排列中准确地确定期望的小片的位置的作业是繁杂且困难的。本专利技术是鉴于上述情形而完成的，其目的在于提供一种即使是多个微小的小片进行排列的小片排列也能够易于从其中确定期望的小片的图像处理方法和细胞分取方法。用于解决问题的方案为了达成上述目的，本专利技术提供以下方法。本专利技术的第一方式是一种图像处理方法，对小片排列的图像进行处理，该小片排列是将粘有生物体组织的切片的基板与所述切片一起分割为多个小片而得到的、所述小片彼此隔开间隙地二维状排列的排列，该图像处理方法包括以下工序：图像获取工序，对所述小片排列进行拍摄，获取包含已被分割的所述切片的整体的分割切片图像；小片识别工序，从在该图像获取工序中获取到的所述分割切片图像中识别所述小片的像；属性信息附加工序，对构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素的各个像素附加属性信息，该属性信息包含构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素所归属的小片的像在所述小片排列的像中的位置的信息；以及复原工序，将包括在该属性信息附加工序中被附加了所述属性信息的像素的所述小片的像彼此接合为一个像，由此生成将所述已被分割的切片的像接合为一个像所得到的复原切片图像。根据本专利技术的第一方式，在小片识别工序中识别在图像获取工序中获取到的分割切片图像内的小片的像，在复原工序中将小片的像彼此以没有间隙且不重合的方式合成为一个像，由此生成包含分割前的切片的整体像的复原切片图像。能够从复原切片图像中准确地把握切片内的组织构造、细胞的分布等。因而，用户能够基于复原切片图像适当地选定要从切片中提取的位置。在该情况下，在属性信息附加工序中，对构成复原切片图像的各个像素附加位置的信息来作为属性信息，该位置的信息表示构成复原切片图像的像素与小片排列内的哪个位置的小片对应。因而，根据复原切片图像内的要提取的位置的像素的位置的信息，能够容易且准确地确定要提取的小片是分割切片图像内的哪个小片。而且，通过将分割切片图像内的小片排列的像与实际的小片排列进行比较，即使是多个微小的小片，也能够易于从其中确定期望的小片。在上述第一方式中，也可以包含颜色校正工序，在该颜色校正工序中，对于在所述复原切片图像内的相邻的所述小片的像的边界处隔着该边界而相邻的像素的颜色，基于相应像素的附近的像素的颜色来进行校正。在复原切片图像中，小片的像之间的边界由于在将基板和切片分割时沿着分割线产生的毛边等而易于变得明显。因而，通过将位于边界的位置处的像素的颜色校正为与该像素的周围的像素的颜色相同或类似的颜色，能够复原为小片的像之间的边界不明显的、更自然的分割前的切片的整体像。在上述第一方式中，也可以，在所述属性信息附加工序中，对构成所述分割切片图像的全部像素进一步附加区域信息来作为所述属性信息，该区域信息表示像素是否为构成所述小片的像的像素，在所述复原工序中，基于所述区域信息去除不构成所述小片的像的像素，将剩下的构成所述小片的像的像素彼此接合为一个像，由此生成所述复原切片图像。由此，能够通过简单的处理来生成复原图像。本专利技术的第二方式是一种细胞分取方法，包括以下工序：上述任一项所记载的图像处理方法；显示工序，显示所述复原切片图像；指定工序，针对在该显示工序中显示的所述复原切片图像指定要从所述切片中提取的位置；以及提取工序，基于对与在该指定工序中指定出的位置对应的像素附加的所述位置的信息来从所述小片排列中提取小片。通过本专利技术的第二方式，基于在指定工序中被指定的位置的像素的位置的信息，能够易于从实际的小片排列中确定要提取的小片，能够在提取工序中提取被确定的小片。专利技术的效果通过本专利技术，起到如下效果：即使是多个微小的小片进行排列的小片排列，也能够易于从其中确定期望的小片。附图说明图1是本专利技术的一个实施方式所涉及的用于实施细胞分取方法的细胞分取系统的整体结构图。图2A是示出图1的细胞分取系统中使用的分割前的基板和切片的图。图2B是示出将图2A的基板和切片分割后的图。图3是示出本专利技术的一个实施方式所涉及的图像处理方法和细胞分取方法的流程图。图4是图像获取工序中获取到的分割切片图像的一例。图5是复原工序中生成的复原切片图像的一例。图6是示出图3的图像处理方法和细胞分取方法的变形例的流程图。图7是在颜色校正工序中被进行了颜色校正的复原切片图像的一例。具体实施方式以下，参照附图来对本专利技术的一个实施方式所涉及的细胞分取方法进行说明。首先，对本实施方式所涉及的用于实施细胞分取方法的细胞分取系统1进行说明。细胞分取系统1是用于从生物体组织的切片A中提取包含期望的细胞的特定区域的系统，如图1所示，细胞分取系统1具备：具有水平的台10的倒立型的光学显微镜2，设置于台10的上方的落料部3，用于对由光学显微镜2获取到的图像进行处理的图像处理装置4，显示部5以及将所述各部彼此连接的数据总线6。如图2A所示，细胞分取系统1中使用的切片A粘贴在像玻璃盖片那样的薄的基板7上。在基板7的表面以格子状形成有槽8，该槽8具有到基板7的厚度尺寸的途中位置为止的深度。相邻的槽8的间隔为0.2mm～2.0mm，优选为0.3mm～1.0mm，更优选为0.3mm～0.5mm。基板7的背面通过粘合剂而粘合在薄板9(例如，切割用的薄板)上，该薄板9在表面方向上具有伸缩性。当使该薄板9在表面方向伸展时，能够如图2B所示那样将基板7沿着槽8分割为多个小的矩形的小片7a。此时，基板7上的切片A也与基板7一起沿着槽8而被分割为多个小的断片。由此，如图2B所示，生成隔开间隙地正方排列的包括多个小片7a的小片排列70。光学显微镜2在台10的下方具备：物镜11，其用于对台10上的标本进行放大观察；以及像数字照相机这样的摄像部12，其用于对由该物镜11获取到的标本的像进行拍摄。另外，台10在其大致中央部分具有沿铅直方向贯通的窗10a。如图1所示，通过以使小片排列70位于窗10a的位置处且使形成有小片排列70的面朝向下侧的方式将薄板9载置在台10上，能够通过物镜11从台10的下侧观察小片排列70，并能够通过摄像部12拍摄由该物镜11获取到的小片排列70的像。落料部3具备：针13；以及保持件14，其能够以使针头13a朝向下侧的方式保持针13并且能够沿水平方向和铅直方向移动。通过保持件14沿水平方向移动，能够使针头13a在水平方向上与台10上的小片7a对位。另外，通过保持件14沿铅直方向下降，能够利用针头13a冲撞小片7a的本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种图像处理方法，对小片排列的图像进行处理，该小片排列是将粘有生物体组织的切片的基板与所述切片一起分割为多个小片而得到的、所述小片彼此隔开间隙地二维状排列的排列，该图像处理方法包括以下工序：图像获取工序，对所述小片排列进行拍摄，获取包含已被分割的所述切片的整体的分割切片图像；小片识别工序，从在该图像获取工序中获取到的所述分割切片图像中识别所述小片的像；属性信息附加工序，对构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素的各个像素附加属性信息，该属性信息包含构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素所归属的小片的像在所述小片排列的像中的位置的信息；以及复原工序，将包括在该属性信息附加工序中被附加了所述属性信息的像素的所述小片的像彼此接合为一个像，由此生成将所述已被分割的切片的像接合为一个像所得到的复原切片图像。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种图像处理方法，对小片排列的图像进行处理，该小片排列是将粘有生物体组织的切片的基板与所述切片一起分割为多个小片而得到的、所述小片彼此隔开间隙地二维状排列的排列，该图像处理方法包括以下工序：图像获取工序，对所述小片排列进行拍摄，获取包含已被分割的所述切片的整体的分割切片图像；小片识别工序，从在该图像获取工序中获取到的所述分割切片图像中识别所述小片的像；属性信息附加工序，对构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素的各个像素附加属性信息，该属性信息包含构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素所归属的小片的像在所述小片排列的像中的位置的信息；以及复原工序，将包括在该属性信息附加工序中被附加了所述属性信息的像素的所述小片的像彼此接合为一个像，由此生成将所述已被分割的切片的像接合为一个像所得到的复原切片图像。2.根据权利要求1所述的图像处理方法，其特征在于，包括颜色校正工...

【专利技术属性】
技术研发人员：船崎纯，
申请(专利权)人：奥林巴斯株式会社，
类型：发明
国别省市：日本,JP