一种划分玉米优势群体的SNP分子标记及其应用制造技术

技术编号:16030266 阅读:302 留言:0更新日期:2017-08-19 11:42
本发明专利技术属于分子生物学技术领域,公开了一种划分玉米优势群体的SNP分子标记及其应用。所述分子标记包括101个SNP标记,覆盖了玉米10条染色体,其中第1号染色体有22个,第2号染色体有13个,第3号染色体有3个,第4号染色体有9个,第5号染色体有6个,第6号染色体有5个,第7号染色体有22个,第8号染色体有8个,第9号染色体有5个,第10号染色体有8个。目前可以用于划分杂种有SNP标记数量在56k‑1k范围内,数量多、成本高,本发明专利技术仅利用101个SNP进行杂种优势群的划分,其效果与利用56K玉米SNP芯片划分结果相同。利用本发明专利技术公布的方法进行杂种优势群划分能够降低检测成本。

【技术实现步骤摘要】
一种划分玉米优势群体的SNP分子标记及其应用
本专利技术属于分子生物学
,具体涉及一种划分玉米优势群体的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
玉米是典型的异交作物表现极端的近交衰退和杂种优势。杂种优势利用是大幅度提高玉米产量和改良品质的有效途径。合理划分自交系优势类群是构建玉米杂种优势利用模式,有效指导玉米自交系的选育和提高组配玉米杂交种效率的重要基础性研究。随着基因芯片技术和测序技术的发展,SNP标记成为继RFLP和SSR之后最有前途的第三代分子标记。目前在玉米中应用比较广泛的SNP芯片有56k、1k左右等不同密度的SNP位点,它们可以用来鉴定不同玉米材料的品种真实性和划分杂种优势群。研究发现利用56kSNP芯片对367份自交系进行基因型检测,经质量控制,得到了41819个高质量的SNP位点杂种优势群的划分,结果分别为瑞德群,温热带群,P群,TSPT群,兰卡斯特群。利用1031个SNP标记的基于Neighbor-joining(NJ)聚类分析的方法将39份甜玉米自交系划分为5个类群,分别为华珍母本群、京甜糯2群、彩甜糯群、温带种质群和华珍父本群。还有研究发现在数据库上筛选了48本文档来自技高网...
一种划分玉米优势群体的SNP分子标记及其应用

【技术保护点】
一种划分玉米优势群体的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记包括101个SNP标记,覆盖了玉米10条染色体,其中第1号染色体有22个,第2号染色体有13个,第3号染色体有3个,第4号染色体有9个,第5号染色体有6个,第6号染色体有5个,第7号染色体有22个,第8号染色体有8个,第9号染色体有5个,第10号染色体有8个,具体101个SNP标记的基因型信息见下表:表101个SNP的基因型信息

【技术特征摘要】
1.一种划分玉米优势群体的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记包括101个SNP标记,覆盖了玉米10条染色体,其中第1号染色体有22个,第2号染色体有13个,第3号染色体有3个,第4号染色体有9个,第5号染色体有6个,第6号染色体有5个,第7号染色体有22个,第8号染色体有8个,第9号染色体...

【专利技术属性】
技术研发人员:阮燕晔崔震海张敖姜思奇张立军
申请(专利权)人:沈阳农业大学
类型:发明
国别省市:辽宁,21

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