改善猪肉质的MYH4基因分子标记及在猪遗传改良中的应用制造技术

本申请涉及改善猪肉质的MYH4基因分子标记及在猪遗传改良中的应用，包括如下至少一种：(I)SEQ ID No.1上的从5’端起的第11031位点的核苷酸Y；(II)SEQ ID No.2上的从5’端起的第1780位点的核苷酸Y，(III)与SEQ ID No.1和/或SEQ ID No.2具有90％以上的一致性的核苷酸序列III上的SNP标记，与SEQ ID No.1上的从5’端起的第11031位点的SNP标记具有一致性；其中，所述核苷酸序列III能够在所述猪中翻译出与如SEQ ID No.3具有相同功能蛋白质；(VI)与(I)至(III)中的至少一种中SNP的连锁不平衡程度r

【技术实现步骤摘要】
改善猪肉质的MYH4基因分子标记及在猪遗传改良中的应用
本申请涉及一种用于测定和/或遗传改良猪肉质性状的SNP标记。
技术介绍
随着人们生活水平的不断提高，对肉品质的要求越来越高。由于高肌内脂肪含量而形成的“雪花肉”是肉中精品。肌内脂肪含量与猪肉的风味和食用价值密切相关，它影响猪肉的嫩度和多汁性。肌内脂肪含量越高，肉的多汁性、嫩度、香味及总体可接受性越高。因此，研究猪高肌内脂肪含量形成的遗传学基础，对改善猪肉品质及生产有利于人体健康的优质肉具有重要意义。
技术实现思路
申请人利用大规模莱芜猪群体，测定了覆盖莱芜猪全部血缘316头个体的背最长肌肌内脂肪含量，通过全基因组关联(GWAS)分析检测到了12号染色体上影响猪肌内脂肪含量的主效基因位点(QTL)，初步定位的区间大小为650kb。通过增加QTL区间内的SNP标记密度，利用单倍型分析和LDLA分析，将QTL区间缩小到525.99kb。对该区域开展重测序，多态位点的搜寻、鉴别及其与猪肌内脂肪含量相关性研究，基因表达分析及eQTL定位，多个群体的验证分析等分离到影响肌内脂肪含量等猪肉质性状的因果基因MYH4，以建立高效准确的基因育种技术开展本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种猪的SNP标记，所述SNP标记包括如下SNP标记中的至少一种：(I)核苷酸序列I上的SNP标记，为SEQ ID No.1上的从5’端起的第11031位点的核苷酸Y，所述Y选自C或T；SEQ ID No.1上的从5’端起的第11031位点对应于10.2版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第58244116位点；(II)核苷酸序列II上的SNP标记，为SEQ ID No.2上的从5’端起的第1780位点的核苷酸Y，所述Y选自C或T；SEQ ID No.2上的从5’端起的第1780位点对应于10.2版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第58244116位点；(III)与SEQ...

【技术特征摘要】
1.一种猪的SNP标记，所述SNP标记包括如下SNP标记中的至少一种：(I)核苷酸序列I上的SNP标记，为SEQIDNo.1上的从5’端起的第11031位点的核苷酸Y，所述Y选自C或T；SEQIDNo.1上的从5’端起的第11031位点对应于10.2版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第58244116位点；(II)核苷酸序列II上的SNP标记，为SEQIDNo.2上的从5’端起的第1780位点的核苷酸Y，所述Y选自C或T；SEQIDNo.2上的从5’端起的第1780位点对应于10.2版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第58244116位点；(III)与SEQIDNo.1和/或SEQIDNo.2所示的核苷酸序列具有90％以上的一致性的核苷酸序列III上的SNP标记，与SEQIDNo.1所示的核苷酸序列上的从5’端起的第11031位点的SNP标记具有一致性；其中，所述核苷酸序列III能够在所述猪中翻译出与如SEQIDNo.3所示的氨基酸序列具有相同功能蛋白质；(VI)核苷酸序列VI上的SNP标记，其为与(I)至(III)中的至少一种SNP的连锁不平衡程度r2≥0.8的SNP标记。2.一种核酸序列，所述核酸序列为包含如权利要求1所述的SNP标记的核酸序列，所述核酸序列选自DNA序列、cDNA序列和RNA序列中的至少一种。3.根据权利要求2所述的核酸序列，其特征在于，所述核酸序列具有5bp至26560bp；优选所述核酸序列具有5bp至10000bp；优选所述核酸序列具有5bp至5928bp；优选所述核酸序列选自SEQIDNo.1和/或SEQIDNo.2；优选所述核酸序列具有5bp至1000bp；优选所述核酸序列具有5bp至500bp；优选所述核酸序列具有5bp至300bp。4.一种氨基酸序列，所述氨基酸序列由包含如权利要求1所述SNP标记的核酸序列编码得到，与所述SNP标记相对应的氨基酸O，所述O选自丙氨酸或缬氨酸；且当所述SNP标记为T时，其对应的氨基酸为缬氨酸；当所述SNP标记为C时，其对应的氨基酸为丙氨酸；优选所述核酸序列为能够在所述猪中翻译出与如SEQIDNo.3所示的氨基酸序列具有相同功能蛋白质的核酸序列；优选所述氨基酸序列为SEQIDNo.3；其中，在如SEQIDNo.3所示的氨基酸序列，氨基酸O位于第576位。5.如权利要求1所述的SNP标记、如权利要求2或3所述的核酸序列和如权利要求4所述的氨基酸序列中至少一种在测定和/或遗传改良猪肉质性状中的应用，所述猪肉质性状包括肌内脂肪含量、大理石纹、肌肉红度、肌肉黄度、肌肉亮度、肌肉纤维类型和水分含量中的至少一种；优选遗传改良猪肉质性状的种猪选自莱芜猪、二花脸、梅山猪、陆川猪、民猪、米猪、淮猪、河套大耳猪、玉山黑猪、滇南小耳猪、马身猪、藏猪、八眉猪、蓝塘猪中的至少一种。6.一种猪的遗传改良的方法，所述方法包括：确定种猪核心群中的种猪的如权利要求1所述的SNP标记，并根据所述SNP标记做出相应的选择：对于(I)，在所述种猪核心群中选择在所述SEQIDNo.1上的从5’端起的第11031位点为TT和TC基因型的种猪个体，淘汰在该位点为CC基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因T的频率；优选在所述SEQIDNo.1上的从5’端起的第11031位点为TT基因型的种猪个体，淘汰在该位点为TC和CC基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因T的频率；对于(II)，在所述种猪核心群中选择在所述SEQIDNo....

【专利技术属性】
技术研发人员：黄路生，陈从英，熊信威，方绍明，宿英，
申请(专利权)人：江西农业大学，
类型：发明
国别省市：江西,36