基因组数据的安全传输制造技术

基因组数据的量以及信息的敏感性必然需要开发智能且有效的方式来以安全的方式传输基因组数据。尽管存在加密方案，但是还存在首先减小大量信息的量并且然后应用编码和加密方法的需求，其将在经济意识以及针对基因组数据的安全性这两方面都是有效的。在本发明专利技术中，我们讨论了对经处理的变异信息进行编码并将其发送到确保转换传送的远程场所的新颖的技术。该协议不仅对信息进行编码和加密；其还压缩需要传输的信息。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】基因组数据的安全传输
本专利技术的实施例总体上涉及安全的数据传输，并且更具体地涉及针对经受隐私限制的大量数据的安全传输以及在其他方面不安全的网络上的其他安全问题的系统和方法。
技术介绍
诸如基因组测序和SNP基因型分型的测序技术能够生成大量的基因组数据。例如，用于存储来自对染色体的测序变异的数据的变异调用文件(variantcallfile)可以是数百千兆字节的。研究人员和健康护理提供者经常需要将基因组数据从一个场所传输到另一在地理上远离的场所。由于跨越长距离的专用网络或私人网络会是过分昂贵的或者否则包括不安全的范围，因此常常通过不安全的网络来传输数据。基因组数据可能与特定患者相关联，并且因此存在隐私问题；事实上，传输可能会经受与对这样的数据的存储和传输有关的法律法规的限制。另外，在处理所述数据以识别患者特异性异常时，信息越敏感，则因此对安全传输机制的需求越大。数据的量以及信息的敏感性必然需要开发有效的技术来安全地传送基因组数据。现有的技术不一定考虑基因组数据(包括变异数据)的特性，也不考虑被传输的特异性数据的质量。因此，需要用于通过不安全的网络传输基因组数据的有效且安全的系统。专利本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于将从基因组测序的并被处理的数据变换成变异调用文件(VCF)的系统，所述系统包括：第一处理模块，其包括计算机处理器和计算机可读有形介质，其中，所述第一处理模块：基于参考数据将所述VCF减小成经注释的VCF，所述经注释的VCF主要包括来自所述VCF的非冗余变异数据；对所述经注释的VCF进行编码；并且存储经编码的VCF；以及第二处理模块，其包括计算机处理器和计算机可读有形介质，其中，所述第二处理模块：接收所述经编码的VCF；并且使用所述参考数据来扩充所述经编码的VCF。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.11.25 US 62/084,1461.一种用于将从基因组测序的并被处理的数据变换成变异调用文件(VCF)的系统，所述系统包括：第一处理模块，其包括计算机处理器和计算机可读有形介质，其中，所述第一处理模块：基于参考数据将所述VCF减小成经注释的VCF，所述经注释的VCF主要包括来自所述VCF的非冗余变异数据；对所述经注释的VCF进行编码；并且存储经编码的VCF；以及第二处理模块，其包括计算机处理器和计算机可读有形介质，其中，所述第二处理模块：接收所述经编码的VCF；并且使用所述参考数据来扩充所述经编码的VCF。2.根据权利要求1所述的系统，其中，所述参考数据包括来自短基因组变异(SNP)的数据库的参考等位基因数据和替代等位基因数据。3.根据权利要求1所述的系统，其中，对所述经注释的VCF进行编码包括使用数学坐标系来转换所述经注释的VCF的染色体号和染色体位置数据。4.一种将从患者的基因组测序的并被处理的数据变换成变异调用文件(VCF)的计算机实施的方法，所述方法包括：提供计算机处理器，所述计算机处理器被配置为：将所述VCF减小成经注释的VCF，所述经注释的VCF主要包括来自所述VCF的非冗余变异数据；对所述经注释的VCF进行编码；并且将经编码的VCF存储在计算机可读有形介质上。5.根据权利要求4所述的方法，其中，减小所述VCF包括移除其相关联的质量数据不满足预定阈值的变异调用。6.根据权利要求4所述的方法，其中，减小所述VCF包括使用短基因组变异(...

【专利技术属性】
技术研发人员：V·阿格拉瓦尔，N·迪米特罗娃，R·J·克拉辛斯基，
申请(专利权)人：皇家飞利浦有限公司，
类型：发明
国别省市：荷兰,NL