一种鉴定砗磲的DNA条形码标准检测方法及其应用技术

本发明专利技术提供一种用于鉴定砗磲DNA条形码组合，包含有用于鉴定砗豪的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1、用于鉴定无磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列其核苷酸序列为SEQ ID NO:2、用于鉴定大砗磲的DNA条形码，核苷酸序列为SEQ ID NO:3、用于鉴定长砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:4、用于鉴定磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:5、用于鉴定番红砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:6。本发明专利技术再一个方面提供扩增上述砗磲科贝类DNA条形码的通用引物对，其引物的序列为SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。本发明专利技术的条形码和扩增引物可以有效的鉴定砗磲的具体种类。

DNA bar code standard detection method for identification of Tridacna and its application

The present invention provides a method for identification of Tridacna DNA barcode combination, including for DNA barcoding Cheng Ho, the nucleotide sequence of SEQ ID NO:1, for DNA barcoding without phosphorus tridacnas its nucleotide sequence, the nucleotide sequence of SEQ ID NO:2, for DNA barcoding Tridacna gigas, nucleotide sequence SEQ ID NO:3, for DNA barcoding Tridacna maxima, the nucleotide sequence of SEQ ID NO:4, for DNA barcoding of tridacnas phosphorus and its nucleotide sequence was SEQ, NO:5, ID for DNA barcoding safranin tridacnas, the nucleotide sequence of SEQ ID NO:6. Another aspect of the invention provides universal primers to amplify the tridacnidae DNA barcode sequence of shellfish, the primers for SEQ ID and SEQ NO:7 ID NO:8. The invention of specific types of bar codes and primers can identify effectively the tridacna.

【技术实现步骤摘要】
一种鉴定砗磲的DNA条形码标准检测方法及其应用
本专利技术属于贝类分子标记
，具体涉及一种鉴定砗磲的DNA条形码标准检测方法及其应用。
技术介绍
砗磲科(Tridacnidae)隶属双壳纲(Bivalvia)，异齿亚纲(Heterodonta)，帘蛤目(Veneroida)，是一种体型较大的双壳贝类，主要生活在热带海域，珊瑚礁或海砂表面。砗磲科贝类肉质鲜美，营养及药用价值高，价格昂贵，其加工制品具有极高的艺术价值，在世界各地均遭到过度捕捞。近年一些国家已将大砗磲(Tridacnagigas)等三种砗磲列为世界珍稀保护动物，加以保护。长砗磲(Tridacnamaxima)亦被世界自然保护联盟红色名录列为近危物种。砗磲科目前发现9种，根据不同种放射肋上褶襞的分布，足丝孔，主、侧齿和闭壳肌痕等形态特征区分不同种，但实际上贝壳有较高的可塑性，在发育过程中存在中间形态和中间生境，造成砗磲科不同种难以区分。目前，对于砗磲科(Tridacnidae)的研究主要集中在生态环境、资源保护方面，在遗传特性、系统发育关系方面，有报道的研究较少，这种现状极大的阻碍了砗磲科种质资源的保护和物种鉴定。近年来，利用DNA条形码对物种进行分类鉴定和系统发育分析已成为一种高效的方法。DNA条形码的工作原理是基于DNA短片段来识别动物、植物或其它生物的类别，它具有迅速和价格低廉两个独特的优点。DNA条形码不仅是传统物种鉴定的强有力补充，更由于它采用数字化形式，使样本鉴定过程能够实现自动化和标准化，突破了对经验的过度依赖，解决了依靠形态学鉴定存在的问题，并可利用有机体的残片进行快速有效的鉴定，能够在较短时间内建立形成易于利用的应用系统。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是针对现有技术中存在的不足，而提供一种鉴定砗磲的DNA条形码标准检测方法及其应用，从而解决依据外部形态和人工经验难以准确鉴定砗磲的问题，能够快速有效地鉴定砗磲，对于研究砗磲科的物种分类、系统发育、系统地理学和保护砗磲科种质资源具有重要意义。本专利技术首先提供一种用于鉴定砗磲DNA条形码组合，包含有：用于鉴定砗的DNA条形码，其核苷酸序列如下(SEQIDNO:1)：TGACCAGCTTCAGGCTTCAAAATAATATATAATGTTATTGTTACTACCCACGCTTTGATTATGATTTTTTTATGGTAATACCAGTTATAATAGGCGGGTTTGGTAATTGATTGGTGCCTTTGATGATGGTCATACCAGATATACCCTCGATTAAATAATTTAAGATTTTGATTGGTACCTAATGCATTTTTTTTGTTGGGAGTGTCGGGCTTTGTAGAAGGGGGTATAGGTGCCGGATGGACAATTTACCCCCCGCTAACATCGATTGAGTTTAAGGGACCCGTCCATAGATCTAGCAATTTTTTCTCTGCACCTTGGAGGTGCTTCTTCTATTGCTGCTAGTTTAAATTTTGCTAGGACAGTAGCTAACATACCACCAAAAACGTGGTTTTCACAAAGTTCCTATATTTCCTATTTCCTTAGGAATTACAGCGTTGCTATTAATTGTAGCAAT；用于鉴定无磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列如下(SEQIDNO:2)：TGACCAGCGTCTGGTTACAAAATAATATACAATGTTATTGTTACTACACATGCTTTGATTATGATTTTTTTATGGTAATGCCAGTAATAATAGGAGGTTTTGGCAATTGGCTTGTGCCTTTAATAATGTTGATGCCTGATATACCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTTCCTAATGCATTCTTTTTGCTTGGAGTTTCTGGGTTTGTAGAGGGAGGTATAGGCGCAGGTTGAACGATCTATCCTCCATTGACTTCAATTGACTTTAAGGGATCCGTCTATAGATCTTGCTATTTTTTCTTTACATTTAGGTGGTGCTTCTTCTATTGCGGCCAGGTTAAATTTTGCAAGGACTGTAGCTAATATGCCATCAAAAACGAGGTTTTCATAAAATCCCAATATTTCCGGTATCACTAGGAATTACAGCGTTACTTTTGATCGTTGCAAT；用于鉴定大砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列如下(SEQIDNO:3)：TGGCCAGCGTCTGACTTCAGAATAATATACAATGTTATTGTCACTACACATGCTTTAATCATAATTTTTTTATGGTAATACCGGTAATAATAGGAGGGTTTGGTAACTGGCTAGTACCGCTGATGATGGTCATGCCGGATATGCCCCCGGCTGAATAACTTAAGGTTTTGGCTGGTCCCAAATGCATTTTTTTTGCTTGGAGTTTCCGGGTTTGTAGAAGGAGGGATAGGAGCAGGGTGAACAATCTACCCCCCGTTAACATCGATTGATTTTGAGGGACCCCTCGATGGACCTAGCCATCTTTTCCCTTCATCTTGGGGGCGCATCTTCGATTGCAGCGAGATTAAATTTTGCAAGGACCGTGGCAAATATACCATCAAAAGCGTGGTTTTCATAAAATTCCTATATTCCCGGTGTCCTTAGGGATCACGGCATTACTTTTAATTGTAGCTAT；用于鉴定长砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列如下(SEQIDNO:4)：CCAGCTAAAACAGGCATTGCCACAATAAGCAACGCTGTAATACCTAATGACACTGGAAACATAGGAATTTTATGGAAACCACGTTTTTGATGCCGTATATTAGCCACAGTCTTGCAAAATTTAACCTGGCTGCAATAGATGAGGCACCGCCTAAGTGAAGGGAAAAAATGGCAAGATCTATAGACGGATCTCTTAAGAAATCGATTGAAGTCAGTGGGGGGTAGATTGTTCAACCAGCACCCATGCCTCCTTCTACAAATCCAGATACTCCTAAAAAAATGCATTTACAAACCAAAACCTCAAATTATTTAATCGAGGGAAATGCATATCTGGTATTACCATTATTAAAGGTACAAGTCAATTTCCAAATCCGCTATTATCACCGGCATTACCATAAAAAAATTATAATTAATGCATGTGTAGTAACGATTACATTATAATCTATTATTCTGCA；用于鉴定磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列如下(SEQIDNO:5)：TGGCCTGCCTCAGGTTACAGAATAATGTACAATGTGATTGTTACTACACATGCTTTAATTATAATTTTTTTATGGTAATACCAGTGATAGTAGGAGGGTTCGGAAATTGGCTTGTACCTTTAATAATG本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于鉴定砗磲DNA条形码组合，其特征在于，所述的组合包含有：用于鉴定砗豪的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1、用于鉴定无磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列其核苷酸序列为SEQ ID NO:2、用于鉴定大砗磲的DNA条形码，核苷酸序列为SEQ ID NO:3、用于鉴定长砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:4、用于鉴定磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:5、用于鉴定番红砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQ ID NO:6。

【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定砗磲DNA条形码组合，其特征在于，所述的组合包含有：用于鉴定砗豪的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQIDNO:1、用于鉴定无磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列其核苷酸序列为SEQIDNO:2、用于鉴定大砗磲的DNA条形码，核苷酸序列为SEQIDNO:3、用于鉴定长砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQIDNO:4、用于鉴定磷砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQIDNO:5、用于鉴定番红砗磲的DNA条形码，其核苷酸序列为SEQIDNO:6。2.权利要求1所述的DNA条形码组合在鉴定砗磲种中的应用。3.权利要求1所述的DNA条形码在制备鉴定砗磲种的制品中的应用。4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述的制品为检测试剂盒。5.一种用于扩增、权利要求1所述的DNA条形码的通用引物对，其特征在于，所述的引物对的序列信息如下...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑小东，姜典航，曾晓起，张晓英，李琪，
申请(专利权)人：中国海洋大学，
类型：发明
国别省市：山东,37