The present invention provides a method for extending the protected nucleotides, which can by liquid liquid extraction operation effectively and in high yield purification, and preparation method of implementation by oligonucleotide phosphoramidite method. It has been found that these problems can be resolved by specific base protected oligonucleotides and / or specific 3 '- bit branched aromatic protective oligonucleotides.
【技术实现步骤摘要】
碱基部保护寡核苷酸本申请是申请号为2013800095950、申请日为2013年2月15日、专利技术名称为“碱基部保护寡核苷酸”的中国专利申请的分案申请。
本专利技术涉及一种特定的碱基部保护寡核苷酸和使用其制备寡核苷酸的方法。此外，本专利技术涉及特定的含有支链的芳族保护基、具有被所述保护基保护的3’位羟基的寡核苷酸，以及使用具有被所述保护基保护的3’位羟基的所述寡核苷酸制备寡核苷酸的方法。
技术介绍
寡核苷酸的合成方法包括：磷酸三酯法、H-膦酸酯法、亚磷酰胺法等，而使用亚磷酰胺法的固相合成(固相方法)是目前最普遍使用的方法(非专利文献1)。固相方法就速度方面而言是有利的，因为已对工艺进行优化并且已取得自动化进展。然而，与其相关的缺陷在于：由于设备限制而限制了规模放大，使用过量的试剂和起始材料，并且难以在中间步骤中确定反应进展状态、分析中间体结构等。还已对通过液相方法的寡核苷酸合成方法进行了研究。然而，通常，每个反应后的处理通过如下方法来进行，所述方法包括(1)直接浓缩反应液，然后通过硅胶柱色谱法分离和纯化；(2)用诸如二氯甲烷、氯仿等的溶剂萃取，用水溶液洗涤，浓缩...
【技术保护点】
含支链的芳族保护寡核苷酸，其由通式(II)表示：
【技术特征摘要】
2012.02.17 JP 2012-033429;2012.11.20 JP 2012-254711.含支链的芳族保护寡核苷酸，其由通式(II)表示：式中，m表示0以上的任意整数；m+1个碱基1各自独立地表示任选被保护的核酸碱基；P1表示氢原子、或在酸性条件下可除去的临时保护基；X表示氢原子、任选被保护的羟基、卤素原子或与4位碳原子交联的有机基团；m个X’各自独立地表示氢原子、任选被保护的羟基、卤素原子或与4位碳原子交联的有机基团；m个P2各自独立地表示在碱性条件下可除去的保护基；m个R34各自独立地表示氧原子或硫原子；L表示由式(a1)表示的基团：式中，*表示与Y的键合位置；**表示与核苷酸3’位羟基的键合位置；L1表示任选取代的二价C1-22烃基；且L2表示单键，或表示由**C(=O)N(R2)-R1-N(R3)***表示的基团，式中，**表示与L1的键合位置，***表示与C=O的键合位置，R1表示任选取代的C1-22亚烷基，R2和R3各自独立地表示氢原子或任选取代的C1-22烷基，或R2和R3任选地一起形成任选取代的C1-22亚烷基键，Y表示氧原子或NR，其中R表示氢原子、烷基或芳烷基，且Z表示由式(a2)表示的基团：式中，*表示与Y的键合位置；R4表示氢原子，或者当Rb为由下述式(a3)表示的基团时，R4任选地与R6一起表示单键或-O-、并与环B一起形成芴基或呫吨基；k个Q各自独立地表示单键，或者表示-O-、-S-、-OC(=O)-、-NHC(=O)-或-NH-；k个R5各自独立地表示具有至少一个脂族烃基且总碳数为14以上且300以下的有机基团，所述脂族烃基具有一个以上支链；k表示1至4的整数；环A除了具有R4、k个QR5、和*C(Ra)(Rb)之外，进一步任选具有取代基，所述取代基选自卤素原子、任选被一个以上的卤素原子取代的C1-6烷基、和任选被一个以上的卤素原子取代的C1-6烷氧基；Ra表示氢原子；且Rb表示氢原子、或由式(a3)表示的基团：式中，*表示键合位置；j表示0至4的整数；j个Q各自独立地表示与上述相同的含义；j个R7各自独立地表示具有至少一个脂族烃基且总碳数为14以上且300以下的有机基团，所述脂族烃基具有一个以上支链；R6表示氢原子，或者任选地与R4一起表示单键或-O-、并与环A一起形成芴基或呫吨基；且环B除了具有j个QR7和R6之外，进一步任选具有取代基，所述取代基选自卤素原子、任选被一个以上的卤素原子取代的C1-6烷基、和任选被一个以上的卤素原子取代的C1-6烷氧基。2.根据权利要求1所述的含支链的芳族保护寡核苷酸，其中...
【专利技术属性】
技术研发人员：平井邦博，片山智，鸟居高好，中谷辽太朗，高桥大辅，
申请(专利权)人：味之素株式会社，
类型：发明
国别省市：日本,JP
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