与水牛泌乳相关基因SCAP及其作为分子标记的应用制造技术

本发明专利技术提供了与水牛泌乳相关基因SCAP及其作为分子标记的应用，属于家畜分子标记领域，所述基因片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第1717600bp、1718168bp、1743088bp、1753656bp、1759116bp、1759142bp、1760740bp、1762368bp、1766036bp处分别有9个单碱基突变，且这9个SNP位点与水牛产奶性状均有显著相关。本发明专利技术公开了检测序列表SEQ ID NO:1的各碱基突变位点所需的上下游引物序列。本发明专利技术的应用，可以提高奶水牛产奶性能，为选育具有优良产奶性能的奶水牛提供技术支撑和奠定理论基础。

Buffalo milk associated gene SCAP and its use as molecular marker

The present invention provides SCAP with buffalo milk and its application as a molecular marker gene, which belongs to the field of animal molecular marker, the gene fragment of the nucleotide sequence of SEQ ID NO:1 shows, including 1717600bp, 1718168bp, 1743088bp, 1753656bp, 1759116bp, 1759142bp, 1760740bp, 1762368bp, 1766036bp respectively with 9 single the mutation, and the 9 SNP loci and milk production traits were significantly related to buffalo. The present invention discloses the base sequence detection table SEQ ID NO:1 mutation primer sequence loci required. The application of the invention can improve the milk production performance of the milk cow, and provide technical support and theoretical foundation for the breeding of milk buffalo with excellent milk producing performance.

【技术实现步骤摘要】
与水牛泌乳相关基因SCAP及其作为分子标记的应用
本专利技术涉及
，具体涉及一种动物分子标记领域。具体涉及与水牛泌乳相关基因SCAP及其作为分子标记的应用。
技术介绍
水牛是我国南方特有的种畜资源，而较低的产奶量和繁殖性能已成为了影响其产业发展的两大科学问题。显然，利用先进的分子标记技术应用于优良奶水牛种质资源的选育将会有效的提高选种效率。产奶性状是奶水牛的一个重要经济性状，由多种微效基因决定，是一种典型的由多基因控制的数量性状。克隆奶水牛泌乳性能相关基因并探讨其遗传特性，以提高奶水牛生产性能，为选育具有高产奶量的优良的奶水牛品种提供技术支撑和奠定理论基础。SCAP是一个内质网膜结合转录因子家族蛋白，在胆固醇稳态调节方面起着重要的作用(Hortonetal.,2002)。SCAP是一个由1276个氨基酸残基组成的膜蛋白，其氨基酸末端550个氨基酸形成相互间隔的疏水区和亲水区，包含8个跨膜螺旋结构，可溶性的羧基末端725个氨基酸包含5个拷贝的WD40重复序列介导蛋白之间的相互作用(Nohturfftetal.,1998；杜静等,2006)。到目前为止，SCAP基因已在不同本文档来自技高网...

【技术保护点】
与水牛泌乳性状相关的SCAP基因，其特征在于：其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第1717600bp、1718168bp、1743088bp、1753656bp、1759116bp、1759142bp、1760740bp、1762368bp、1766036bp处分别有A1717600G、G1718168A、G1743088A、T1753656C、G1759116A、C1759142T、G1760740A、A1762368G、T1766036C单碱基突变，且该1717600bp、1760740bp、1766036bp的SNP位点与水牛产奶量显著相关，1760740bp、1762368...

【技术特征摘要】
1.与水牛泌乳性状相关的SCAP基因，其特征在于：其核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，其中第1717600bp、1718168bp、1743088bp、1753656bp、1759116bp、1759142bp、1760740bp、1762368bp、1766036bp处分别有A1717600G、G1718168A、G1743088A、T1753656C、G1759116A、C1759142T、G1760740A、A1762368G、T1766036C单碱基突变，且该1717600bp、1760740bp、1766036bp的SNP位点与水牛产奶量显著相关，1760740bp、1762368bp、1766036bp的SNP位点与水牛产的奶中的总干物质显著相关，1762368bp的SNP位点与水牛产的奶中的无脂固形物显著相关，1717600bp、1718168bp、1743088bp、1753656bp、1759116bp、1759142bp、1760740bp、1762368bp以及1766036bp的SNP位点与水牛产的奶中的乳糖率显著相关。2.根据权利要求1所述的与水牛泌乳性状相关的SCAP基因，其特征在于：其第1717600bp、1718168bp、1743088bp、1753656bp、1759116bp、1759142bp、1760740bp、1762368bp以及1766036bp的SNP位点是通过以下步骤获得的：a.待测水牛基因组DNA提取；b.目的片段扩增及测序：随机取50头水牛基因组DNA进行混池，以作为PCR反应模板，利用正、反引物进行PCR技术扩增，获得的扩增产物进行测序，利用DNAStar7.0Seqman生物信息分析软件对测序结果进行比对，获取候选SCAP基因SNP位点；c.基因分型：针对384头水牛基因组DNA样本，利用飞行时间质谱法进行候选SNP位点的分型，根据质谱峰图判读各样本位点的基因型；d.关联分析：利用SAS9.4软件GLM程序对水牛个体的SNP分型结果以及产奶量、奶中的总干物质含量、奶中的无脂固形物含量、奶中的乳糖率数据进行数据分析，获得与水牛产奶量、奶中的总干物质含量、奶中的无脂固形物含量、奶中的乳糖率显著相关的SNP位点。3.根据权利要求2所述的与水牛泌乳性状相关的SCAP基因，其特征在于：步骤b中用于PCR技术扩增的正、反引物分别为：(ⅰ)获得A1717600G位点的引物序列为：正向引物SEQNO:2：5’-TCCTGATTGGGTCTCCACATCCCCG-3’；反向引物SEQNO:3：5’-TAAACATTAGATGTGCAATGAATCT-3’；(ii)获得G1718168A位点的引物序列为：正向引物SEQNO:4：5’-TCCTGATTGGGTCTCCACATCCCCG-3’；反向引物SEQNO:5：5’-TAAACATTAGATGTGCAATGAATCT-3’；(iii)获得G1743088A位点的引物序列为：正向引物SEQNO:6：5’-GGCAGGGGTTCTACGTGGAGTG-3’；反向引物SEQNO:7：5’-CCAATGCAGGGGACGCAGTTTCG-3’；(iv...

【专利技术属性】
技术研发人员：邓廷贤，梁贤威，庞春英，马小娅，梁莎莎，朱鹏，陆杏蓉，段安琴，
申请(专利权)人：广西壮族自治区水牛研究所，
类型：发明
国别省市：广西,45