The invention discloses a method for detection of cattle SERPINA3 gene single nucleotide polymorphism and its application for measuring cattle whole genome DNA as the template, primer P1 with primers, PCR amplification of cattle SERPINA3 gene fragment; PCR product fragment size by agarose gel electrophoresis after PCR; amplified fragment with restriction endonuclease BstXI PCR then, agarose gel electrophoresis of amplified fragments digested; according to the results of agarose gel electrophoresis identification of bovine SERPINA3 gene 648th single nucleotide polymorphism loci; the detection method provided by the invention can be used in xia'nan cattle breeds such as meat Chinese growth traits of molecular marker assisted selection, and the rapid establishment of genetic resources excellent cattle population.
【技术实现步骤摘要】
一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用
本专利技术属于分子遗传学领域,涉及基因单核苷酸多态性的检测,特别涉及一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用。
技术介绍
单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)是由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心的学者Lander(1996)提出的一类遗传标记系统,就是指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A/G/C/T)的变化而引起的多态性。它的变异形式有:颠换、转换、插入和缺失等,主要由单个碱基的转换或者颠换所引起。具有转换型的碱基变异的SNPs约占2/3。在任何已知或未知的基因内或附近都可能找到数量不等的SNPs,基因编码区内的SNPs(cSNPs)比较少,因为在外显子内的变异率仅占周围序列的1/5,但它在育种的研究中却具重要意义,因此倍受关注。标记辅助选择就是将现代生物技术与常规选择方法相结合,通过对遗传标记的选择来间接选择控制某性状的数量性状位点(QTL),使之能够同时利用标记位点信息和数量性状的表型信息,更准确估计动物个体的育种值,提高选择效率,加快育种进展。标记辅助选择主要经历了三个阶段:第一阶段是家畜各性状间的遗传分析;第二阶段是蛋白质(酶)标记对数量性状的标记阶段;第三个阶段是分子遗传标记阶段。随着分子标记技术日渐成熟与丰富,使覆盖整个基因组的标记成为可能,通过与QTL间的连锁分析,实现分子标记辅助选择的目标。SNP作为新的遗传标记已广泛应用于基因定位、克隆、遗传育种及多样性的研究。分子育种,即分子标记辅助选择(molecula ...
【技术保护点】
一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;所述的引物对P1为:上游引物:5’‑TGGCTGGAGGGATGTGACTA‑3’;下游引物:5’‑TCATTATTGGTTCACCATAA‑3’;(2)用琼脂糖凝胶电泳分离PCR扩增产物,得到扩增片段;(3)用限制性内切酶BstXI对扩增片段进行酶切处理,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因上单核苷酸多态性位点的基因型。
【技术特征摘要】
1.一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;所述的引物对P1为:上游引物:5’-TGGCTGGAGGGATGTGACTA-3’;下游引物:5’-TCATTATTGGTTCACCATAA-3’;(2)用琼脂糖凝胶电泳分离PCR扩增产物,得到扩增片段;(3)用限制性内切酶BstXI对扩增片段进行酶切处理,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因上单核苷酸多态性位点的基因型。2.如权利要求1所述的检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述步骤(1)中,PCR扩增的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,51.8℃退火30s,72℃延伸40s,共38个循环;72℃延伸10min。3.如权利要求1所述的检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述步骤(2)中,琼脂糖凝胶电泳采用质...
【专利技术属性】
技术研发人员:黄永震,杨士珍,贺花,刘鲲鹏,邓立,陈宏,雷初朝,蓝贤勇,党瑞华,胡沈荣,
申请(专利权)人:西北农林科技大学,
类型:发明
国别省市:陕西,61
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