描述了具有酸性和芳族氨基酸特定模式的肽，这些肽能抑制病毒感染。这些肽包含１５－１８个氨基酸并可与其它的抗病毒制剂组合和／或以编码它们的核苷酸序列形式给药。（*该技术在2022年保护过期，可自由使用*）
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及能有效抑制利用内部核糖体进入位点(IRES)起动翻译的传染性病毒的复制、和/或能抑制在病毒生命周期任何阶段利用La蛋白质的病毒的肽。这些肽能与La蛋白质竞争并抑制产毒性病毒生命周期对所需La蛋白质的多种生化和生理功能的利用。更具体说本专利技术包括在这种抑制中具优异性能的非天然产生的肽。
技术介绍
纳入本文作为参考文献的PCT出版物WO96/11211描述了抑制信使RNA在内部核糖体进入位点(IRES)翻译的方法，依据的是能结合这种翻译所需蛋白质的一种寡核苷酸。如该PCT出版物所述，命名为“I-RNA”的此寡核苷酸是根据对表现出所需抑制性能的酵母菌60个核苷酸的RNA的鉴定。然而如本文进一步所述，该I-RNA也可采取此酵母RNA相关部分的各种模拟形式，如脊髓灰质炎病毒186-220核苷酸序列或脊髓灰质炎病毒578-618核苷酸序列和其它各种序列。此抑制性寡核苷酸(I-RNA)的重要性在于核苷酸序列本身和其结合内源蛋白质的能力。I-RNA结合的内源蛋白质命名为人La自身抗原，它能结合抑制性寡核苷酸从而防止抗原所需的与mRNA结合并抑制IRES与核糖体互相作用。如同样纳入本文参考文献的PCT出版物WO99/61613所述，此蛋白质的跨越野生型La自身抗原位置11-28的18个-氨基酸部分显示能抑制病毒复制。完整的La自身抗原的氨基酸序列先前已由Chambers，J.C.，等，J.Biol.Chem.(1988)25318043-18061描述，也纳入本文参考文献。La自身抗原(LAP)的18个-氨基酸结合区域和前述寡核苷酸抑制病毒RNA翻译的机制在上面所引用的WO99/61613中有所描述。如前所述，一些病毒包括小核糖核酸病毒、丙肝病毒和其它病毒利用IRES机制来起动翻译。由于上述寡核苷酸和LAP抑制此种翻译，它们也抑制病毒复制和其它病毒必需的功能。如这些出版物所证明，LAP能方便的进入细胞，并位于能影响此种抑制的位置上。现已发现一个相关肽家族但不包括LAP，在抑制IRES起动翻译并从而抑制病毒复制中具有用途。这些肽因此可用于治疗病毒感染和研究病毒感染的机制。专利技术公开的内容本专利技术针涉及可用作抗病毒制剂和作为阐明病毒感染机制研究工具的一个肽家族。这些肽能抑制IRES-起动RNA翻译。因此本专利技术一方面的内容所针对的肽公式为A1n A2n A3n A4A5A6A7A8A9A10A11A12A13A14A15A16A17A18(1)和其酰化和/或酰胺化形式，其中各个n独立为0或1；A1、A2和A3各自独立为任何氨基酸；A4、A12和A17独立为酸性氨基酸；A13、A14、A15和A18独立为芳族氨基酸；A5、A7、A8、A11和A16代表任何氨基酸；A6、A9和A10独立代表碱性氨基酸或极性中性氨基酸；其中各所述氨基酸可以是L型、外消旋形式或D型，条件是所述肽不包括LAP且不包括LAP同源物，由于它们出现在其它种属中，除非以分离和纯化形式。优选氨基酸A5、A7、A8、A11和A16独立为中性、非芳族氨基酸，更优选为疏水性中性、非芳族氨基酸。优选A1、A2和A3为中性，优选非芳族氨基酸，优选疏水性。在其它方面，本专利技术涉及抑制IRES起动的翻译和/或其它病毒功能的方法，这是通过将本专利技术的肽提供给无细胞系统或感染了利用IRES起动翻译的病毒的活细胞。本专利技术还涉及使用专利技术的肽或者其药学或兽医学组合物抑制病毒复制和治疗病毒感染的方法，且本专利技术也涉及这些药学或兽医学组合物。植物病毒感染也可用本专利技术的肽来抑制且这些肽和编码它们的核苷酸序列因此也可用于农业和园艺学。这些肽可这样提供或原位从核苷酸序列产生。利用IRES介导的译从而成为本专利技术肽合适靶子的病毒包括但不限于脊髓灰质炎病毒、鼻病毒、脑心肌炎病毒、口蹄疫病毒、丙肝病毒(HCV)、经典的(classic)猪瘟病毒、牛病毒性腹泻病毒、弗罗得鼠白血病病毒、莫洛尼鼠白血病病毒、罗斯肉瘤病毒、人免疫缺陷病毒(HIV包括HIV-1和HIV-2)、Plautia stali肠病毒、Rhopalosiphum padi病毒、cricket麻痹病毒、Kaposi肉瘤-相关疱疹病毒、甲肝病毒(HAV)、乙肝病毒(HBV)、人乳头瘤病毒(HPV)、流感病毒HAV、艾可病毒、柯萨奇病毒、狗霍乱病毒、猪瘟病毒、猪水泡病毒、Pesti病毒和Poty病毒。这些肽和编码它们的多核苷酸可与其它抗病毒制剂组合提供。具体说本专利技术的肽或它们的编码核苷酸序列与WO96/11211中所述I-RNA的组合是特别有用的。然而其它抗病毒制剂可和本专利技术的肽或与I-RNA组合的本专利技术的肽一起施用。另一方面，本专利技术涉及能与本专利技术肽起特异性免疫反应的抗体。这些抗体包括它们的免疫反应片段，可用于纯化本专利技术的抑制蛋白质和评估其在各种药学、兽医和农业组合物中的水平。此外，本专利技术的肽具有优先与一些组织，具体的肝脏相结合的特性。因此，这些肽可作为其它化合物和组合物的特殊输送系统，通过使本专利技术的肽与需要特殊输送的物质相融合或结合。实施本专利技术的模式本专利技术的肽具有上面列出的公式(1)，其中各氨基酸特征如上所确定。如所指出的，位置1、2和3中3个氨基酸残基之一可独立存在或缺失。这些氨基酸最优选是疏水性的，但一般任何中性氨基酸可替代且这些位置的氨基酸对于活性确实不重要，因此可使用任何氨基酸。优选的是A1、A2和A3从该肽中缺失。除了一个例外(A14在一些实施方案中出可是中性/极性的)，该肽需要在A4、A12和A17具有酸性氨基酸并在A13、A14、A15和A18具有芳族氨基酸。其余位置不大关键。常规氨基酸分类是根据它们的总体特性从而可进行保守替换而不改变分子的性质。最简单的分类是酸性和碱性氨基酸。酸性氨基酸在生理pH下具有负电荷且在天然产生的氨基酸中由谷氨酸(glu或E)和天冬氨酸(asp或D)为代表。类似的，碱性氨基酸在生理pH下其有正电荷且在天然产生的氨基酸中由赖氨酸(lys或K)、精氨酸(arg或R)或更小程度上的组氨酸(his或H)为代表。其余氨基酸是中性的，但这些中性氨基酸可进一步分成亚类。具体讲含芳族体系的氨基酸可置于“芳族”氨基酸分类中且在天然产生的氨基酸中由色氨酸(trp或W)、苯丙氨酸(phe或F)和酪氨酸(tyr或Y)为代表。中性氨基酸的另一亚类是极性氨基酸，在天然氨基酸中由谷氨酰胺(gln或Q)和天冬酰胺(asn或N)为代表。有时丝氨酸(ser或S)和苏氨酸(thr或T)由于存在OH也归于此类中。中性氨基酸的又一亚类是明显为疏水性的氨基酸。在天然产生的氨基酸中，这些氨基酸包括缬氨酸(val或V)、亮氨酸(leu或L)、甲硫氨酸(met或M)和异亮氨酸(ile或I)。有时包括在此类中的有半胱氨酸(cys或C)和丙氨酸(ala或A)甚至甘氨酸(gly或G)。然而由于这些氨基酸的小尺寸，它们不象异亮氨酸、缬氨酸和亮氨酸归类为疏水氨基酸。唯一的剩余基因-编码氨基酸脯氨酸(pro或P)很难分类，但显然是中性的。因为本专利技术肽可以合成以及从核苷酸序列翻译，没有必要限制这些氨基酸残基为由基因编码的那些残基。因此这些肽可包括非天然氨基酸如β-丙氨酸(β-ala)、3-氨基丙酸、2，3-二氨基丙酸(2，3-diap)、4-氨本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种以下公式的化合物Ａ↑［１］ｎＡ↑［２］ｎＡ↑［３ｎ］Ａ↑［４］Ａ↑［５］Ａ↑［６］Ａ↑［７］Ａ↑［８］Ａ↑［９］Ａ↑［１０］Ａ↑［１１］Ａ↑［１２］Ａ↑［１３］Ａ↑［１４］Ａ↑［１５］Ａ↑［１６］Ａ↑［１７］Ａ↑［１８］（１ ）及其酰化和／或酰胺化形式，其特征在于，各个ｎ独立为０或１；Ａ↑［１］、Ａ↑［２］和Ａ↑［３］各自独立为任何氨基酸；Ａ↑［４］、Ａ↑［１２］和Ａ↑［１７］独立为酸性氨基酸；Ａ↑［１３］、Ａ↑［１４］、 Ａ↑［１５］和Ａ↑［１８］独立为芳族氨基酸；Ａ↑［５］、Ａ↑［７］、Ａ↑［８］、Ａ↑［１１］和Ａ↑［１６］代表任何氨基酸；Ａ↑［６］、Ａ↑［９］和Ａ↑［１０］独立代表碱性氨基酸或极性中性氨基酸；其中各所述氨基酸可以是 Ｌ型、外消旋形式或Ｄ型，条件是当所有氨基酸是Ｌ型时公式（１）的化合物不是ＡＡＬＥＡＫＩＣＨＱＩＥＹＹＦＧＤＦ；当所有氨基酸是Ｌ型且公式（１）是序列ＡＬＥＡＫＩＣＨＱＩＥＹＹＦＧＤＦ、ＡＡＬＥＡＫＩＣＨＱＩＥＹＹＦＧＤＦ、ＬＤＬＤＴＫＩＣＥＱＩＥＹＹＦＧＤＦ、ＡＡＬＥＡＫＩＣＨＱＩＥＥＹＹＦＧＤＦ、ＤＤＡＤＱＲＩＩＫＱＬＥＹＹＦＧＮＩ、ＶＳＫＬＥＡＳＴＩＲＱＥＹＹＦＧＤＡ或ＱＥＲＡＩＩＲＱＶＥＹＹＦＧＤＦ时，公式（１）的化合物必须是分离形式。...
【技术特征摘要】
...
【专利技术属性】
技术研发人员：A达斯谷普塔，S达斯，N拜德亚，
申请(专利权)人：加利福尼亚大学董事会，
类型：发明
国别省市：US[美国]
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