水稻耐盐基因及其紧密连锁分子标记的育种应用制造技术

技术编号：14828083 阅读：38 留言：0更新日期：2017-03-16 14:43

本发明专利技术公开了一种水稻耐盐基因及其紧密连锁分子标记的育种应用。本发明专利技术提供了一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法，包括如下步骤：检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505 SNP位点的基因型为CC基因型还是TT基因型；如果待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505 SNP位点的基因型为CC基因型、待测水稻为感盐水稻；如果待测水稻的基因组DNA中基于rs12_14215505SNP位点的基因型为TT基因型、待测水稻为耐盐水稻。本发明专利技术提供了一个水稻耐盐基因位点，并提供该基因位点的分子标记，该标记可以预测水稻耐盐性，从而为水稻耐盐分子标记辅助选择育种提供基础。

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【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及水稻抗逆育种领域，具体涉及一种水稻耐盐基因及其紧密连锁分子标记的育种应用。
技术介绍
水稻是我国重要的粮食作物之一，目前我国65％以上的人口以此作为主食。但随着人口与经济的快速增长，粮食生产面临着巨大的挑战，其中水稻安全生产对于中国的可持续发展至关重要。水稻对盐碱表现为中度敏感，其生长和结实会受到盐碱的抑制。当前，土地盐碱化已成为威胁水稻生产的重要因素之一，盐碱可以使粮食作物严重减产，甚至高达40％以上。目前，全球大约20％的耕地存在盐碱化现象，其中中国约为2000万公顷，加之灌溉技术不当，造成的耕地次生盐碱化面积也在日益扩大。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种水稻耐盐基因及其紧密连锁分子标记的育种应用。本专利技术提供了一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法，包括如下步骤：检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505SNP位点的基因型，如果所述rs12_14215505SNP位点的基因型为CC基因型、待测水稻为感盐水稻，如果所述rs12_14215505SNP位点的基因型为TT基因型、待测水稻为耐盐水稻。所述“检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505SNP位点的基因型”的实现方法如下：提取待测水稻的基因组DNA，以所述基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，然后将PCR扩增产物进行测序。本专利技术还保护一种检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505SNP位点的基因型的方法，包括如下步骤：提取待测水稻的基因组DNA，以所述基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR...

【技术保护点】
一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法，包括如下步骤：检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505 SNP位点的基因型，如果所述rs12_14215505 SNP位点的基因型为CC基因型、待测水稻为感盐水稻，如果所述rs12_14215505 SNP位点的基因型为TT基因型、待测水稻为耐盐水稻。

【技术特征摘要】
1.一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法，包括如下步骤：检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505SNP位点的基因型，如果所述rs12_14215505SNP位点的基因型为CC基因型、待测水稻为感盐水稻，如果所述rs12_14215505SNP位点的基因型为TT基因型、待测水稻为耐盐水稻。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于：所述“检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505SNP位点的基因型”的实现方法如下：提取待测水稻的基因组DNA，以所述基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，然后将PCR扩增产物进行测序；所述引物F为如下(a1)或(a2)：(a1)序列表的序列2所示的单链DNA分子；(a2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代且与序列2具有相同功能的DNA分子；所述引物R为如下(a3)或(a4)：(a3)序列表的序列3所示的单链DNA分子；(a4)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代且与序列3具有相同功能的DNA分子。3.一种检测待测水稻的基因组DNA中rs12_14215505SNP位点的基因型的方法，包括如下步骤：提取待测水稻的基因组DNA，以所述基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，然后将PCR扩增产物进行测序；所...

【专利技术属性】
技术研发人员：张帆，周永力，黎志康，石英尧，高岭岭，王文生，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，中国农业科学院深圳生物育种创新研究院，
类型：发明
国别省市：北京;11

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