一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列制造技术

本发明专利技术涉及一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，用单个字母表示氨基酸，该蛋白的氨基酸序列为：RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP。用单个字母表示脱氧核糖核酸，编码该抗菌蛋白的基因的DNA序列为：AGAAGCGCATTGAGCTGTCAAATGTGTGAGTTGGTTGTCAAGAAATACGAAGGATCCGCCGATAAGGATGCCAATGTCATCAAGAAGGATTTCGATGCTGAATGCAAGAAGCTTTTCCACACCATCCCATTCGGAACCAGAGAATGCGATCATTACGTCAACAGCAAGGTAGACCCAATCATTCACGAGCTGGAAGGAGGAACCGCTCCAAAGGATGTGTGCACCAAGCTTAACGAATGCCCATAA。本发明专利技术提出的抗菌蛋白可以避免细菌/病原菌产生耐药性为前提，在多领域应用于细菌性疾病的防治，包括医疗，农业，水生生物以及动物养殖业。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，属于基因

技术介绍
在当前的医疗，农业，水生生物以及动物养殖业，细菌性疾病的防治是一个绕不开的过程。一方面，传统抗生素可以被用作生物饲料添加剂，实现提高产能，降低饲养成本，提高经济效益的目的。另一方面，在临床上，医院或门诊的抗细菌感染治疗普遍依赖于传统抗生素，这类传统的抗生素(尤其是广谱抗生素)可以实现及时地抗细菌感染治疗，有效避免病情因拖延而恶化，尤其是对于目前尚无法迅速实现准确而特异的临床诊断的受细菌感染的病人。在当前的医疗，农业，水生生物以及动物养殖业，传统抗生素的实际应用存在一个两难。一方面，为了细菌性疾病的防治，抗生素的使用是一个绕不开的过程。另一方面，从进化的角度看，传统抗生素的滥用会加速耐药细菌株的出现，以至于传统抗生素对该菌株不再有效。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种难耐药的天然抗菌蛋白，以便更好地克服上述不足，改善使用效果。为了实现上述目的，本专利技术的技术方案如下。一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，用单个字母表示氨基酸，该蛋白的氨基酸序列为：RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP。用单个字母表示脱氧核糖核酸，编码该抗菌蛋白的基因的DNA序列为：AGAAGCGCATTGAGCTGTCAAATGTGTGAGTTGGTTGTCAAGAAATACGAAGGATCCGCCGATAAGGATGCCAATGTCATCAAGAAGGATTTCGATGCTGAATGCAAGAAGCTTTTCCACACCATCCCATTCGGAACCAGAGAATGCGATCATTACGTCAACAGCAAGGTAGACCCAATCATTCACGAGCTGGAAGGAGGAACCGCTCCAAAGGATGTGTGCACCAAGCTTAACGAATGCCCATAA。随着基础与临床研究的深入，抗菌蛋白被认为最具有临床应用前景的传统抗生素代替品，其主要原因在于其难耐药性(目前为止尚无对抗菌蛋白耐药菌株出现的报道)和对原核生物/真核生物细胞膜的选择性渗透性溶解功能，该类抗菌蛋白对病原菌的细胞膜具有渗透性溶解功能，对动物(包括人类)的细胞膜不具有渗透性溶解功能，即不破坏动物(包括人类)机体自身的生命单元。有鉴于抗菌蛋白相对于传统抗生素在难耐药方面的优势，本专利技术致力于提出一种难耐药的天然抗菌蛋白，该抗菌蛋白的表达最初在秀丽线虫的肠道内被发现，秀丽线虫生存于土壤环境中，是一种寿命很短的长约1毫米的小虫，被土壤中的微生物(包括细菌)等包围，同时也以此为食物，后续研究表明该抗菌蛋白对秀丽线虫构成一种非常重要的抗细菌感染机制，对于秀丽线虫在肠道内顺利消化土壤中的细菌(也即是它的食物)而不受到细菌对秀丽线虫本身器官的感染具有重要作用。此外，该抗菌蛋白对病原菌的细胞膜具有渗透性溶解功能，从而造成细胞内器官与内容物的致命性扩散，造成细菌解体死亡，同时该抗菌蛋白对动物(包括人类)的细胞膜不具有渗透性溶解功能，即不破坏动物(包括人类)机体自身的生命单元。这样一种特异的抗菌机制使得细菌很难(也许根本不可能)产生对该抗菌蛋白耐药的进化行为。从进化史角度看，秀丽线虫是比人类更古老的生物，而该抗菌蛋白被秀丽线虫采用至今依旧有效地执行其为秀丽线虫抗细菌感染的功能。因此，本着师法自然的原则，本专利提出该抗菌蛋白的专利申请，以为替代传统抗生素提供一种现实的可能性。鉴于当前基因工程生产重组蛋白的相关技术以及外包市场均已成熟，该抗菌蛋白生产制备方法采用常规技术进行。一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，直接利用基于该蛋白的生物制剂治疗细菌感染，也可以通过基因重组技术编码该蛋白的所有DNA片段，间接利用该蛋白相关的基因技术靶向精准治疗细菌感染。该专利技术的有益效果在于：本专利技术提出的抗菌蛋白可以避免细菌/病原菌产生耐药性为前提，在多领域应用于细菌性疾病的防治，包括医疗，农业，水生生物以及动物养殖业。具体实施方式下面结合实施例对本专利技术的具体实施方式进行描述，以便更好的理解本专利技术。实施例本实施例中的难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，用单个字母表示氨基酸，该蛋白的氨基酸序列为：RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP。用单个字母表示脱氧核糖核酸，编码该抗菌蛋白的基因的DNA序列为：AGAAGCGCATTGAGCTGTCAAATGTGTGAGTTGGTTGTCAAGAAATACGAAGGATCCGCCGATAAGGATGCCAATGTCATCAAGAAGGATTTCGATGCTGAATGCAAGAAGCTTTTCCACACCATCCCATTCGGAACCAGAGAATGCGATCATTACGTCAACAGCAAGGTAGACCCAATCATTCACGAGCTGGAAGGAGGAACCGCTCCAAAGGATGTGTGCACCAAGCTTAACGAATGCCCATAA。本专利技术中的难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，直接利用基于该蛋白的生物制剂治疗细菌感染，也可以通过基因重组技术编码该蛋白的所有DNA片段，间接利用该蛋白相关的基因技术靶向精准治疗细菌感染。由于DNA与氨基酸之间并非一一对应(对应关系见表1)，不同的DNA序列可以编码同样的蛋白分子。表1：氨基酸代码编码对应氨基酸的脱氧核糖核酸代码组合AGCT，GCC，GCA，GCGLTTA，TTG，CTT，CTC，CTA，CTGRCGT，CGC，CGA，CGG，AGA，AGGKAAA，AAGNAAT，AACMATGDGAT，GACFTTT，TTCCTGT，TGCPCCT，CCC，CCA，CCGQCAA，CAGSTCT，TCC，TCA，TCG，AGT，AGCEGAA，GAGTACT，ACC，ACA，ACGGGGT，GGC，GGA，GGGWTGGHCAT，CACYTAT，TACIATT，ATC，ATAVGTT，GTC，GTA，GTG理论上共有9094700285584521228370927550271062016种不同的DNA序列可以编码与本专利提出的抗菌蛋白同样的抗菌蛋白分子，该数字由附件中的Python脚本运行得出。任何一个氨基酸序列，通过常规的蛋白质或者DNA序列比对软件或者在线的序列比对工具进行序列比对之后，只要它与源序列的序列同源度高于75％，或者它与源序列之间互相匹配的氨基酸的个数大于60，则该氨基酸序列以及编码他们的所有DNA序列同样得到专利技术专利保护。本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，其特征在于：用单个字母表示氨基酸，该蛋白的氨基酸序列为：RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP；用单个字母表示脱氧核糖核酸，编码该抗菌蛋白的基因的DNA序列为：AGAAGCGCATTGAGCTGTCAAATGTGTGAGTTGGTTGTCAAGAAATACGAAGGATCCGCCGATAAGGATGCCAATGTCATCAAGAAGGATTTCGATGCTGAATGCAAGAAGCTTTTCCACACCATCCCATTCGGAACCAGAGAATGCGATCATTACGTCAACAGCAAGGTAGACCCAATCATTCACGAGCTGGAAGGAGGAACCGCTCCAAAGGATGTGTGCACCAAGCTTAACGAATGCCCATAA。

【技术特征摘要】
2016.02.26 CN 20161010562911.一种难耐药的天然抗菌蛋白的氨基酸序列，其特征在于：用单个字母表示氨基酸，该蛋白的氨基酸序列为：RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP；用单个字母表示脱氧核糖核酸，编码该抗菌蛋白的基因的DNA序列为：AGAAGCGCATTGAGC...

【专利技术属性】
技术研发人员：李炜，
申请(专利权)人：李炜，
类型：发明
国别省市：江苏;32