一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法技术

技术编号:13918871 阅读:97 留言:0更新日期:2016-10-27 17:49
本发明专利技术公开了一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法。本发明专利技术提供的方法包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型,AA基因型绵羊的生长性状优于GA基因型绵羊;GA基因型绵羊的生长性状优于GG基因型绵羊。本发明专利技术还保护一种特异引物对,由引物F和引物R组成,分别如序列表的序列1和序列表的序列2所示。应用本发明专利技术的方法可以辅助筛选生长性状优的绵羊,对于绵羊的育种具有重要意义,也对于进一步研究绵羊的生长性状具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法
技术介绍
SNP(single nucleotide polymorphism单核苷酸多态性)主要指在基因组水平,由单个核苷酸的变异引起的DNA序列的多态性,包括转换、颠换、插入或缺失。在基因组中分布密集的SNP,因其携带巨大的遗传信息量,被认为是应用前景最好的遗传标记物,人类SNP标记的检测已经成为基因诊断的重要手段。SNP标记的遗传图谱的研究,对分子辅助育种有巨大的促进作用,农业动物中很多重要性状的基因已经定位。绵羊是世界及我国具有重要经济性状的家畜,为人类提供了大量的肉、毛、皮等产品。利用传统的育种方法对绵羊的选育与提高取得了显著的效果,促进了地方绵羊群体的改良和各地绵羊新品种的形成,然而,运用传统的育种方法对绵羊的遗传改良的进展十分缓慢,一个新品种的形成就需要上十年甚至几十年的时间。随着分子生物学技术的出现与发展,特别是人类基因组研究的开展和其他物种基因组的研究提上新的日程,带动了绵羊基因组的研究。绵羊前期的分子生物学方面的研究主要集中在以标记为基础构建绵羊物种的遗传连锁图谱,以连锁图谱为基础的重要经济性状的定位、以候选基因法为基础的基因克隆及其结构与功能研究、分子标记育种应用等。近几十年来,绵羊基因组的研究成果有限,因此,对绵羊基因组的研究是迫在眉睫的问题。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种基于rs430810656 SNP位点辅助鉴定绵羊生长性状的方法。本专利技术提供的鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;如果为AA基因型或GA基因型、待测绵羊候选为体重大和/或胸围大的绵羊,如果为GG基因型、待测绵羊候选为体重小和/或胸围小的绵羊;所述体重大体现为四月龄时体重大于等于28kg和/或六月龄时体重大于等于30kg;所述胸围大体现为四月龄时胸围大于等于78cm和/或六月龄时胸围大于等于79cm;所述体重小体现为四月龄时体重小于28kg和/或六月龄时体重小于30kg;所述胸围小体现为四月龄时胸围小于78cm和/或六月龄时胸围小于79cm。所述绵羊具体可为4月龄或6月龄的绵羊。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;如果为AA基因型或GA基因型、待测绵羊候选为体高大和/或体斜长大和/或胸宽大的绵羊,如果为GG基因型、待测绵羊候选为体高小和/或体斜长小和/或胸宽小的绵羊;所述体高大体现为六月龄时体高大于等于60cm;所述体斜长大体现为六月龄时体斜长大于等于64cm;所述胸宽大体现为六月龄时胸宽大于等于15cm;所述体高小体现为为六月龄时体高小于60cm;所述体斜长小体现为六月龄时体斜长小于64cm;所述胸宽小体现为六月龄时胸宽小于15cm。所述绵羊具体可为6月龄的绵羊。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;AA基因型绵羊的生长性状优于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的生长性状优于GG基因型绵羊。生长性状优体现为如下(a1)至(a5)中的至少一种:(a1)体重大;(a2)胸围大;(a3)体高大;(a4)体斜长大;(a5)胸宽大;当生长性状优体现为体重大时,AA基因型绵羊的体重大于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的体重在统计学上大于GG基因型绵羊。当生长性状优体现为胸围大时,AA基因型绵羊的胸围在大于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的胸围统计学上大于GG基因型绵羊。当生长性状优体现为体高大时,AA基因型绵羊的体高大于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的体高大于GG基因型绵羊。当生长性状优体现为体斜长大时,AA基因型绵羊的体斜长大于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的体斜长上大于GG基因型绵羊。当生长性状优体现为胸宽大时,AA基因型绵羊的胸宽大于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的胸宽大于GG基因型绵羊。所述绵羊具体可为4月龄或6月龄的绵羊。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。以上任一所述方法中,所述“检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型”包括如下步骤:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用特异引物对进行PCR扩增,然后将PCR扩增产物进行测序;所述特异引物对由引物F和引物R组成;所述引物F为如下(b1)或(b2):(b1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;(b2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;所述引物R为如下(b3)或(b4):(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;(b4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子。本专利技术还保护一种特异引物对,由引物F和引物R组成;所述引物F为如下(b1)或(b2):(b1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;(b2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;所述引物R为如下(b3)或(b4):(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;(b4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子。本专利技术还保护所述特异引物对的应用,为如下(c1)或(c2):(c1)辅助鉴定绵羊生长性状;(c2)制备辅助鉴定绵羊生长性状的试剂盒。所述生长性状为如下(d1)至(d5)中的至少一种:(d1)体重;(d2)胸围;(d3)体高;(d4)体斜长;(d5)胸宽。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。本专利技术还保护含有所述特异引物对的试剂盒。所述试剂盒的用途为辅助鉴定绵羊生长性状。所述生长性状为如下(d1)至(d5)中的至少一种:(d1)体重;(d2)胸围;(d3)体高;(d4)体斜长;(d5)胸宽。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。本专利技术还保护一种与绵羊生长性状相关的含有所述rs430810656 SNP位点的DNA片段,如序列表中序列3所示。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。本专利技术还保护以上任一所述方法,或,所述的引物对,或,所述的试剂盒,在绵羊的育种中的应用。所述育种的目的是培育生长性状优的绵羊。生长性状优体现为如下(a1)至(a5)中的至少一种:(a1)体重大;(a2)胸围大;(a3)体高大;(a4)体斜长大;(a5)胸宽大。所述绵羊具体可为乌珠穆沁绵羊。以上任一所述rs430810656 SNP位点具体可为绵羊基因组中序列表的序列3自5′末端第25位核苷酸。本专利技术发现了一个rs430810656 SNP位点,发现rs430810656 SNP位点与绵羊生长性状具有相关性。该SNP可以作为绵羊生长性状的分子标记,应用本专利技术的方法可以辅助筛选生长性状优的绵羊,对于绵羊的育种具有重要意义,也对于进一步研究绵羊的生长本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;如果为AA基因型或GA基因型、待测绵羊候选为体重大和/或胸围大的绵羊,如果为GG基因型、待测绵羊为体重小和/或胸围小的绵羊;所述体重大体现为四月龄时体重大于等于28kg和/或六月龄时体重大于等于30kg;所述胸围大体现为四月龄时胸围大于等于78cm和/或六月龄时胸围大于等于79cm;所述体重小体现为四月龄时体重小于28kg和/或六月龄时体重小于30kg;所述胸围小体现为四月龄时胸围小于78cm和/或六月龄时胸围小于79cm。

【技术特征摘要】
1.一种鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;如果为AA基因型或GA基因型、待测绵羊候选为体重大和/或胸围大的绵羊,如果为GG基因型、待测绵羊为体重小和/或胸围小的绵羊;所述体重大体现为四月龄时体重大于等于28kg和/或六月龄时体重大于等于30kg;所述胸围大体现为四月龄时胸围大于等于78cm和/或六月龄时胸围大于等于79cm;所述体重小体现为四月龄时体重小于28kg和/或六月龄时体重小于30kg;所述胸围小体现为四月龄时胸围小于78cm和/或六月龄时胸围小于79cm。2.一种鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;如果为AA基因型或GA基因型、待测绵羊候选为体高大和/或体斜长大和/或胸宽大的绵羊,如果为GG基因型、待测绵羊候选为体高小和/或体斜长小和/或胸宽小的绵羊;所述体高大体现为六月龄时体高大于等于60cm;所述体斜长大体现为六月龄时体斜长大于等于64cm;所述胸宽大体现为六月龄时胸宽大于等于15cm;所述体高小体现为六月龄时体高小于60cm;所述体斜长小体现为六月龄时体斜长小于64cm;所述胸宽小体现为六月龄时胸宽小于15cm。3.一种鉴定或辅助鉴定绵羊生长性状的方法,包括如下步骤:检测待测绵羊的基因组DNA中基于rs430810656 SNP位点的基因型为AA基因型、GG基因型还是GA基因型;AA基因型绵羊的生长性状优于GA基因型绵羊,GA基因型绵羊的生长性状优于GG基因型绵羊。4.如权利要求3所述的方法,其特征在于:所述生长性状优体现为如下(a1)至(a5)中的至少...

【专利技术属性】
技术研发人员:张莉马晓萌杜立新轩俊丽魏彩虹赵福平朱才业吴明明袁泽湖刘瑞凿
申请(专利权)人:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
类型:发明
国别省市:北京;11

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