一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法技术

本发明专利技术公开一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤：1）从ICD起搏器中导出PDF格式的报告文件；2）根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；3）读取文件内容；4）扫描报告文件，并提取文本内容；5）调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据；6）将数据写入数据库；该针对ICD起搏器的结构化数据提取方法能节省人力资源。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法。
技术介绍
充血性心力衰竭是有较高死亡率的严重疾患，每年有成千上万的患者死于心力衰竭。在过去的10余年中，在患者体内植入CRT设备已经成为治疗该级别最显著的非药物治疗方法。患者植入CRT设备后，需要定期回医院进行随访，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，并结合CRT的诊断功能，优化设备参数、调整治疗方案。CRT设备植入患者回医院进行随访时，心血管专科医生工作流程如下——通过CRT厂家提供的程控仪，读取患者体内的CRT程控数据从CRT程仪器中的患者数据导出为PDF格式的随访报告，人工查阅报告中的各项参数指标，做出医学判断。将本次导出的报告进行存档，以便患者下次随访时进行对比。目前国内外CRT厂家仅允许将程控数据导出为PDF文件，不允许导出为excel、csv、xml等文件格式。由于PDF文件是典型的非结构化数据格式，国内临床科研工作者进行心血管领域的大数据研究时，只能通过人工抄录的方式从上述PDF文件中提取各项参数指标。由于患者数量多、程控参数复杂，人工抄录劳动强度大。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术问题是提供一种能节省人力资源的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法。为解决上述问题，本专利技术采用如下技术方案：一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤：1）从ICD起搏器中导出PDF格式的报告文件；2）根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；3）读取文件内容；4）扫描报告文件，并提取文本内容；5）调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据；6）将数据写入数据库。作为优选，所述CRT参数抽取规则库的每条规则均对应着报告文件中的一个指标或参数。作为优选，所述步骤3）的具体实现方式为：3.1）采用JAVA程序打开报告文件；3.2）编程读取报告文件。作为优选，所述步骤4）的具体实现方式为：4.1）逐行扫描报告文件的内容；4.2）将每行的内容提取出来。作为优选，所述步骤5）的具体实现方式为：5.1）使用JAVA程序调用CRT参数抽取规则库；5.2）在CRT参数抽取规则库找到每行内容的抽取规则；5.3）根据抽取规则将报告文件中整行匹配的数据抽取出来；作为优选，所述步骤6）的具体实现方式为：6.6）编程将抽取出来的数据进行汇总；6.6）将汇总后的数据写入数据库。作为优选，所述数据库为SQL数据库，功能强大、简单易学、使用方便。作为优选，所述编程均为JAVA编程，具有简单性、面向对象、分布式、健壮性、安全性、平台独立与可移植性、多线程、动态性等特点，功能强大和简单易用。本专利技术的有益效果为：采用计算机编程读取PDF格式的CRT程控文件中的文本内容，将文本内容抽取出来并保存到数据库，并可导出成Excel和cvs等数据格式进行统计分析，数据抽取效率和数据抽取准确率高，彻底解决了人工抄录模式难以管控质量的难题，能节省人力资源，方便医务人员工作，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，以便患者下次随访时进行对比。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例中的技术方案，下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。图1为实施例2中的步骤5）的数据抽取流程图。具体实施方式实施例1一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤：1）从ICD起搏器中导出PDF格式的报告文件；2）根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；3）读取文件内容；4）扫描报告文件，并提取文本内容；5）调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据，如图1所示；6）将数据写入数据库。本实施例的有益效果为：采用计算机编程读取PDF格式的CRT程控文件中的文本内容，将文本内容抽取出来并保存到数据库，并可导出成Excel和cvs等数据格式进行统计分析，数据抽取效率和数据抽取准确率高，彻底解决了人工抄录模式难以管控质量的难题，能节省人力资源，方便医务人员工作，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，以便患者下次随访时进行对比。实施例2一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤：1）从ICD起搏器中导出PDF格式的报告文件；2）根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；3）采用JAVA编程打开报告文件，JAVA编程读取报告文件；4）逐行扫描报告文件的内容，将每行的内容提取出来；5）使用JAVA编程调用CRT参数抽取规则库,在CRT参数抽取规则库中找到每行内容的抽取规则；根据抽取规则将报告文件中整行匹配的数据抽取出来，如图1所示；6）使用JAVA编程将抽取出来的数据进行汇总；将汇总后的数据写入SQL数据库。所述CRT参数抽取规则库的每条规则均对应着报告文件中的一个指标或参数，如设置了规则“体重 =${体重本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于：包括以下步骤：。

【技术特征摘要】
1.一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于：包括以下步骤：。2.1）从ICD起搏器中导出PDF格式的报告文件；2）根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；3）读取文件内容；4）扫描报告文件，并提取文本内容；5）调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据；6）将数据写入数据库。3.根据权利要求1所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于：所述CRT参数抽取规则库的每条规则均对应着报告文件中的一个指标或参数。4.根据权利要求2所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于：所述步骤3）的具体实现方式为：3.1）编程打开报告文件；3.2）读取报告文件。5.根据权利要求3所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于：所述步骤4）的具体实现方式为：...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈样新，毛涌泉，罗超，
申请(专利权)人：广州市皓轩软件科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44