本发明专利技术涉及猪分子标记制备领域，具体地指一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因SVEP1的分子标记及其应用。本发明专利技术利用SVEP1基因序列中包含一个SNP位点，位于核苷酸序列SEQ ID NO.1的第44581bp处，该位点为A/G的碱基突变，导致Sfc Ⅰ‑RFLP多态性。这个碱基突变位于SVEP1基因第3内含子中，不改变其翻译的氨基酸序列。故在SVEP1基因序列的SNP位点附近设计引物，得到分子标记序列SEQ ID NO.2，从而鉴定猪背膘厚和肌内脂肪性状。本发明专利技术利用现有的PCR‑RFLP技术，在SVEP1基因第44581bp处发现一个A/G突变，且发现此多态位点与背膘厚和肌内脂肪性状(极)显著相关，对猪生长性状和肉质性状的研究有一定帮助。
【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术涉及猪分子标记制备领域，具体地指一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因SVEP1的分子标记及其应用。本专利技术利用SVEP1基因序列中包含一个SNP位点，位于核苷酸序列SEQ ID NO.1的第44581bp处，该位点为A/G的碱基突变，导致Sfc Ⅰ?RFLP多态性。这个碱基突变位于SVEP1基因第3内含子中，不改变其翻译的氨基酸序列。故在SVEP1基因序列的SNP位点附近设计引物，得到分子标记序列SEQ ID NO.2，从而鉴定猪背膘厚和肌内脂肪性状。本专利技术利用现有的PCR?RFLP技术，在SVEP1基因第44581bp处发现一个A/G突变，且发现此多态位点与背膘厚和肌内脂肪性状(极)显著相关，对猪生长性状和肉质性状的研究有一定帮助。【专利说明】猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因 SVEP1的分子标记及其 应用
本专利技术涉及猪分子标记制备领域，具体地指一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基 因 SVEP1的分子标记及其应用。
技术介绍
畜牧业在现代农业发展中占据着非常重要的地位，其在农业生产中所占有的比值 通常用来衡量一个国家和地区发展程度的重要指标。猪肉作为我国最主要的肉类来源，生 猪养殖产业在我国畜牧业中占据着举足轻重的地位。在20世纪80年代中期，我国肉类产量 约2000万吨，猪肉约占85%，2012年猪肉产量达到了5335万吨，约占肉类总量63.63%。虽然 猪肉所占比重逐渐下降，但其始终占据主导地位。 随着社会的发展和消费水平的提高，消费者对猪肉品质的要求日益增高，使猪肉 生产者和猪育种者要更加关注胴体品质和肉质性状的改良。背膘薄、肌内脂肪含量高一直 以来都是猪育种工作中的重点目标性状，随着百年来的育种工作进展，肉品质优良成为我 国地方猪种的优良特性之一。 我国地方猪种甚至含地方猪种血统的培育品种及杂交品系都因其优良的肉品质， 广受消费者欢迎。但是这些猪种多数都为脂肪型猪，其显著特点是背膘厚度大，我国地方猪 种及含有地方猪血统的品种背膘厚平均在3厘米以上。背膘沉积过多不仅导致生长缓慢，同 时也不符合当前形势对于节粮的要求。此外，肌内脂肪会显著影响猪肉风味，高的肌内脂肪 含量的猪肉具有更好的风味(黄业传，贺稚非等.皮下脂肪和肌内脂肪对猪肉风味的作用： .中国农业科学，2011,44(10): 2118-2130)。然而绝大多数胴体性状和肉质性状只能依 靠屠宰法进行性能测定，传统选育方法很难取得较大遗传进展，分子标记辅助育种是肉质 改良的有效途(刘欣.猪胴体性状全基因组关联分析及背膘厚主要基因筛选研究：.北 京：中国农业大学，2014)。尽管目前A超、B超在测定活体猪背膘厚方面有一定应用，但该测 定结果易受到各方面影响，如:猪只无法完全保定、易受测量环境影响而产生应激等等，而 且刘炜等研究已明确发现该方法测定猪背膘厚的扩展不确定度高达11.8%，因此在规模化 育种工作中利用此类方法会引入大量不准确因素，最终影响选育效果(杨秀娟，邓斌等.猪 背膘厚与眼肌厚活体A超测量技术研究：.西北农林科技大学学报，2014,42(5):23-27; 刘炜，吴昊昊等.猪活体背膘厚和眼肌面积不确定度评定：.上海畜牧兽医通讯，2013，6: 77)。此外，肌内脂肪性状更是只能通过屠宰法进行测定，给育种工作带来了极大的工作量。 SVEP1基因在2006年被Shur I等发现在骨骼组织、骨膜、骨髓以及骨髓间叶基质细 胞中表达，在肌肉和软骨中表达很低或不表达，可作为CAMs的组分调节细胞间黏附作用 (Shur I,Socher R,Hameiri M,Fried A,Benayahu D.Molecular and cellular characterization of SEL-〇B/SVEPlin osteogenic cells in vivo and in vitro.J Cell Physiol ,2006Feb;206(2) :420-7)。随后，Glait-Santar C等发现SVEP1 基因参与间叶 细胞的粘附过程，可以传导微环境中与细胞活性相关的信号，该基因在肌原细胞融合和肌 管形成过程中表达，表达量随着肌管成熟而减少(Shefer G，Benayahu D.SVEPlis a novel marker of activated pre-determined skeletal muscle satellite cells. Stem CellRev·2010Mar;42-9)。2012年，Glait-SantarC等发现SVEPlmodule在骨骼组织和各种 乳腺癌细胞中表达，参与调控骨骼微环境的交互网络，是骨小生境中生理病理交互的调节 因子（Glait-Santar C，Pasmanik-Chor Μ , Benayahu D . Expression pattern of SVEPlalternatively-spliced forms .Gene · 2012Aug; 137-45)。最新研究表明，SVEP1 基 因参与到脂肪酸储存以及葡萄糖代谢过程(Kokosar M，Benrick A，Perfilyev A，Fornes R,Nilsson E,Maliqueo M,Behre CJ,Sazonova A,0hlsson C,Ling C,Stener-Victorin E.Epigenetic and Transcriptional Alterations in Human Adipose Tissue of Polycystic Ovary Syndrome.Sci Rep.2016Mar 15;6:22883)，推测SVEP1 可能通过调 节脂肪酸和葡萄糖代谢进而影响脂肪沉积等过程。由于脂肪酸及葡萄糖代谢与背膘厚和肌 内脂肪性状密切相关，因此可以研究SVEP1基因是否对猪生长和肉质性状产生影响，这对改 良猪的经济性状和分子标记辅助育种有重要作用。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因 SVEP1的分子标记及 其应用。随着分子标记辅助育种的发展，越来越多的分子标记被用于大群体中目标性状的 选择，该方法具有快速、准确、不受环境条件干扰的优点。本专利技术中，我们发现SVEP1基因中 的一个SNP位点，该位点与猪背膘厚以及肌内脂肪含量显著相关，因此可以用作群体育种的 分子标记，提高育种效率。本专利技术利用该分子标记可迅速预测不同基因型群体猪之间背膘 厚以及肌内脂肪含量的差别，同时在猪育种工作中，该分子标记可作为背膘厚与肌内脂肪 性状的可靠标记。 为实现上述目的，本专利技术提供的一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因 SVEP1的 分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID N0.2所示，其中，该分子标记的核苷酸序列的340bp处还 有一个SNP位点G/A。 本专利技术还提供了一种用于获得上述分子标记的引物对，其特征在于:所述引物对 为： 正向引物：5 ' -TGTCGCATGTGCTTGGTAGAT-3 ' ； 反向引物： 5 '-GAACCTGGACTTCAAGGGACCATTCTTCCTCTCAGC-3 '。 本专利技术还提供了一种上述分子标记的获得方法，以具有S本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种猪背膘厚与肌内脂肪性状相关基因SVEP1的分子标记，其特征在于：其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其中，该分子标记的核苷酸序列的340bp处还有一个SNP位点G/A。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：李长春，邹成，罗文哲，李菁璇，张皓源，吴宇，胡岸，赵书红，余梅，李新云，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：湖北;42
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