梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记及应用制造技术

本发明专利技术属于梨分子育种领域，提供了一种梨果实单果重主效QTL位点的分子标记及应用。利用SSR标记构建‘红茄梨’和‘晚秀梨’联合遗传连锁图谱，结合梨果实单果重表型鉴定，并利用区间作图法进行QTL分析，在联合连锁图的第11连锁群检测到主效QTL位点的存在，该主效QTL位点贡献率为51.9％。与该主效QTL位点紧密连锁的SSR标记为QS1122‑135，其遗传距离为4.37cm。本发明专利技术所获得的梨果实单果重主效QTL分子标记可用于单果重这一果实性状进行早期选择，对于提高育种效率具有重要的理论和实践指导意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于梨分子遗传育种领域，具体涉及一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记及其筛选方法和应用。
技术介绍
梨(PyrusL.)是我国重要的经济作物，栽培面积和产量均居世界首位。梨果实的营养价值高，酥脆多汁、酸甜适口，并具有一定的医疗价值，受到广大消费者的喜爱。单果重是梨果实外观品质的重要因素，果实大或小直接决定了梨品种的产量和经济效益。因此，梨果实单果重是梨品种主要经济性状之一。培育迎合不同消费者需求的单果重是梨育种目标之一。梨是多年生木本植物，世代周期长，结果晚。传统育种中，是利用果实表型性状对梨基因型进行选择，这种方法不仅受到梨童期的影响，而且易受到外界环境的左右。随着分子育种技术的发展，通过分子标记构建高密度遗传连锁图谱并对果实单果重进行QTL(Quantitativetraitloci，数量性状基因座)分析和定位成为现实，也为提高目标数量性状优良基因选择的准确性和预见性奠定了基础。利用分子标记定位数量性状QTL，其实质就是分析分子标记与目标性状QTL之间的交换率，来确定QTL的具体位置。基于获得的标记基因型分离与数量性状之间的关系，可直接确定控制数量性状的位点，开发可应用于分子标记辅助选择育种的技术，这已在许多重要农作物上取得了成功的应用。目前有关梨数量性状的QTL定位研究仍属起步阶段，针对病害、生长性状和果实部分性状QTL定位及分子标记的研究已有报道。但针对梨果实单果重的QTL定位只限于‘八月红’这一亲本，其实用性仍受限于‘八月红’和‘砀山酥梨’的F1杂交群体。因此，开展不同群体遗传连锁图谱构建，并进行梨单果重的QTL定位是拓宽分子标记应用范围的必要手段。本专利技术采用‘红茄梨’和‘晚秀梨’的杂交后代F1代群体进行遗传连锁图谱构建和单果重的QTL定位是单果重分子标记辅助选择育种技术的提高和补充。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记以及该分子标记的引物对。本专利技术的另一目的是提供一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记方法。本专利技术的又一目的是提供一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记的筛选方法。本专利技术的再一目的是提供梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记在梨梨分子育种中的应用。本专利技术的目的可以通过如下技术方案实现：一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135，该分子标记QS1122-135的正向引物序列如SEQIDNO.1所示，反向引物序列如SEQIDNO.2所示。上述的分子标记QS1122-135是以梨品种晚秀梨的基因组DNA为底物进行PCR扩增所得的长度为135bp的DNA片段，该分子标记QS1122-135与MSF之间的遗传距离为4.37cm。一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135的引物对，所述引物对的正向引物序列如SEQIDNO.1所示，反向引物序列如SEQIDNO.2所示。一种鉴定梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记方法，所述方法是以梨基因组DNA作为模板，用上述分子标记QS1122-135的引物对为引物进行PCR扩增，扩增产物进行电泳检测，如扩增出长度为135bp的DNA片段，则标志梨果实单果重主效QTL位点MSF存在。一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135的筛选方法，包括以下步骤：(1)利用梨品种‘红茄梨’和‘晚秀梨’杂交，获得F1代群体单株；(2)利用SSR分子标记方法分析两个亲本及其F1群体，统计分析在亲本间具有多态性的位点在后代群体中的遗传类型，获得多态性标记位点，然后对其进行连锁分析，构建‘红茄梨’和‘晚秀梨’联合遗传连锁图谱，其中对多态性标记位点进行连锁分析时采用Jionmap4.0作图软件；(3)对‘红茄梨’和‘晚秀梨’杂交后代的F1群体单株的果实单果重进行测定，利用MapQTL5.0作图软件的区间作图法(MapQTL5.0作图软件)，将F1群体每个单株的单果重与步骤(2)构建的‘红茄梨’和‘晚秀梨’联合遗传连锁图谱中的分子标记进行连锁和QTL分析，以LOD值≥3为标准，大于3说明存在一个QTL位点，在‘红茄梨’和‘晚秀梨’联合遗传连锁图谱的第11连锁群上检测到单果重的QTL位点MSF，其LOD值为8.78，贡献率为51.9％，是主效QTL；(4)根据步骤(3)得到的主效QTL位点所在区域，选择与其连锁距离小于5cm的SSR分子标记，其中分子标记QS1122-135能对F1群体果实单果重性状进行良好的分型，因此，本专利技术选择QS1122-135作为梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记。所述分子标记QS1122-135的长度为135bp，与MSF之间的遗传距离为4.37cm，该分子标记可以作为梨果实单果重的标记；所述分子标记QS1122-135的正向引物序列如SEQIDNO.1所示，反向引物序列如SEQIDNO.2所示。根据上述的梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135的筛选方法，所述主效QTL位点MSF位于‘红茄梨’和‘晚秀梨’联合遗传图谱的第11连锁群上，该位点贡献率为51.9％。上述的梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135在梨分子育种中的应用。上述的梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135的筛选方法在梨分子育种中的应用。本专利技术的有益效果：(1)本专利技术采用的两个亲本‘红茄梨’和‘晚秀梨’果实单果性状差异大，‘红茄梨’平均单果重200g，‘晚秀梨’平均单果重400g左右，其杂交后代果实单果重性状进行了很好的分离，因此，可确保梨果实单果重性状QTL位点检测的准确性和可重复性。(2)本专利技术采用了SSR标记方法进行梨果实单果重性状QTL定位和连锁标记的筛选，SSR标记在分子标记辅助育种中操作更为简便、重复性更好、技术要求低、准确度高，是共显性和锚定标记，更加容易在分子标记辅助育种中应用。(3)本专利技术中确定了‘红茄梨’和‘晚秀梨’杂交群体F1代单株梨果实单果重的主效QTL位点，对该数量性状贡献率较高，位点的贡献率为51.9％，因此，基于此位点筛选连锁分子标记对单果重判断的准确性较好，尤其在单果重极大与极小之间鉴别准确性较高。(4)目前普遍认可的应用于分子辅助选择的连锁标记与目标性状的距离需≤5.0cm，本专利技术的分子标记QS1122-本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122‑135，其特征在于，所述分子标记QS1122‑135的正向引物序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。

【技术特征摘要】
1.一种梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记QS1122-135，其特征在于，
所述分子标记QS1122-135的正向引物序列如SEQIDNO.1所示，反向引物序列
如SEQIDNO.2所示。
2.根据权利要求1所述的分子标记QS1122-135，其特征在于，所述分子标记
QS1122-135是以梨品种‘晚秀梨’的基因组DNA为底物进行PCR扩增所得的
长度为135bp的DNA片段，该分子标记QS1122-135与MSF之间的遗传距离为
4.37cm。
3.一种权利要求1所述的分子标记QS1122-135的引物对，其特征在于，所述引
物对的正向引物序列如SEQIDNO.1所示，反向引物序列如SEQIDNO.2所示。
4.一种鉴定梨果实单果重主效QTL位点MSF的分子标记方法，其特征在于，
所述方法是以梨基因组DNA作为模板，用权利要求3所述的分子标记
QS1122-135的引物对为引物进行PCR扩增，扩增产物进行电泳检测，如扩增出
长度为135bp的DNA片段，则标志梨果实单果重主效QTL位点MSF存在。
5.一种权利要求1所述的分子标记QS1122-135的筛选方法，其特征在于，包括
以下步骤：
(1)利用梨品种‘红茄梨’和‘晚秀梨’杂交获得F1代群体单株；
(2)利用SSR分子标记方法分析两个亲本及其F1群体，统计分析亲本间具有多
态性位点在后代群体中的遗传类...

【专利技术属性】
技术研发人员：王龙，王磊，李秀根，薛华柏，王苏珂，苏艳丽，杨健，
申请(专利权)人：中国农业科学院郑州果树研究所，
类型：发明
国别省市：河南;41