【技术实现步骤摘要】
【技术保护点】
一种基于多核学习与Boosting算法的蛋白质‑DNA绑定位点预测方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:特征提取,使用PSI‑BLAST与SANN程序分别提取蛋白质序列的进化信息特征和溶剂可及性特征,在此基础上使用滑动窗口技术构建每一个氨基酸残基的特征向量,每个残基有两个对应着两种不同的信息来源的特征向量;步骤2:特征融合,使用基于线性核的多核学习算法对上述步骤1中的两个特征向量进行评估,得到相应的权重信息,并根据权重进行加权串行组合得到最终的样本特征向量;步骤3:使用随机下采样技术,对非绑定位点残基进行多次下采样,得到多个非绑定位点样本子集,将每一个非绑定位点样本子集与 ...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:於东军,胡俊,李阳,沈红斌,杨静宇,
申请(专利权)人:南京理工大学,
类型:发明
国别省市:江苏;32
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