针对膀胱癌的DNA甲基化生物标志物制造技术

一种对受试对象的膀胱癌或膀胱癌复发进行预测、预后和/或诊断的方法，所述方法包括：提供来自所述受试对象的测试样品；测量所述测试样品中的两种或多于两种多核苷酸的至少一部分的DNA甲基化水平，所述两种或多于两种多核苷酸选自由HOXA9、SOXI、NPY、IRAK3、L1-MET和ZO2组成的组；基于所测量的DNA甲基化水平计算风险评分，将所计算的风险评分与阈值进行比较，所述阈值源自基于从对照组获得的一种或多种生物标志物的DNA甲基化水平的参比DNA甲基化谱，所述对照组的成员具有膀胱癌；和基于所计算的风险评分与所述阈值的比较，确定以下(1)、(2)和(3)中的至少一项：(1)膀胱癌是否已复发；(2)是否存在膀胱癌复发的可能性；和(3)患者是否具有膀胱癌。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】201480039548

【技术保护点】
一种对受试对象的膀胱癌或膀胱癌复发进行预测、预后和/或诊断的方法，所述方法包括：提供来自所述受试对象的测试样品；测量所述测试样品中的一种或多种多核苷酸的至少一部分的DNA甲基化水平，所述一种或多种多核苷酸选自由HOXA9、SOX1、NPY、IRAK3、L1‑MET和ZO2组成的组；将所述测试样品中的所述一种或多种多核苷酸的DNA甲基化水平与基于对照组中的所述一种或多种多核苷酸的DNA甲基化水平的参比DNA甲基化谱进行比较，所述对照组的成员具有膀胱癌；和基于所述比较，确定以下(1)、(2)和(3)中的至少一项：(1)膀胱癌是否已复发；(2)是否存在膀胱癌复发的可能性；和(3)患者是否具有膀胱癌。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.05.10 US 61/821,8381.一种对受试对象的膀胱癌或膀胱癌复发进行预测、预后和/或诊断的方法，所
述方法包括：
提供来自所述受试对象的测试样品；
测量所述测试样品中的一种或多种多核苷酸的至少一部分的DNA甲基化水平，
所述一种或多种多核苷酸选自由HOXA9、SOX1、NPY、IRAK3、L1-MET和ZO2
组成的组；
将所述测试样品中的所述一种或多种多核苷酸的DNA甲基化水平与基于对照组
中的所述一种或多种多核苷酸的DNA甲基化水平的参比DNA甲基化谱进行比较，
所述对照组的成员具有膀胱癌；和
基于所述比较，确定以下(1)、(2)和(3)中的至少一项：(1)膀胱癌是否已复发；(2)
是否存在膀胱癌复发的可能性；和(3)患者是否具有膀胱癌。
2.如权利要求1所述的方法，其中，所述测试样品是尿或血液。
3.如权利要求1所述的方法，其中，所述一种或多种多核苷酸是HOXA9。
4.如权利要求1所述的方法，其中，所述一种或多种多核苷酸包括至少一种高
甲基化的多核苷酸和至少一种低甲基化的多核苷酸。
5.如权利要求1所述的方法，其中，所述一种或多种多核苷酸包括SOX1、IRAK3
和L1-MET。
6.如权利要求1所述的方法，其中，所述一种或多种多核苷酸由SOX1、IRAK3
和L1-MET组成。
7.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括：从所述测试样品中提取DNA，
进行亚硫酸氢盐转化和PCR扩增。
8.如权利要求1所述的方法，其中，DNA甲基化水平是甲基化的胞嘧啶的百分
比，其定义为甲基化的胞嘧啶的数量除以甲基化和未甲基化的胞嘧啶的总数。
9.一种对受试对象的膀胱癌或膀胱癌复发进行预测、预后和/或诊断的方法，所
述方法包括：
提供来自所述受试对象的测试样品；
测量所述测试样品中的两种或多于两种多核苷酸的至少一部分的DNA甲基化水

\t平，所述两种或多于两种多核苷酸选自由HOXA9、SOX1、NPY、IRAK3、L1-MET
和ZO2组成的组；
基于所测量的DNA甲基化水平，计算风险评分；
将所述风险评分与阈值进行比较，所述阈值源自基于从对照组获得的一种或多种
生物标志物的DNA甲基化水平的参比DNA甲基化谱，所述对照组的成员具有膀胱
癌；和
基于所计算的风险评分与所述阈值的比较，确定以下(1)、(2)和(3)中的至少一项：<...

【专利技术属性】
技术研发人员：SF·苏，梁港宁，P·琼斯，K·西格蒙德，
申请(专利权)人：南加州大学，
类型：发明
国别省市：美国;US