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水稻黄绿叶突变基因YGL8及其编码的蛋白和应用制造技术

技术编号:13056327 阅读:83 留言:0更新日期:2016-03-23 19:06
本发明专利技术公开了水稻黄绿叶突变基因YGL8及其编码的蛋白和应用,其中水稻黄叶突变基因YGL8的核苷酸序列如SEQ ID No.11所示,氨基酸序列如SEQ ID No.12所示,与野生型相比水稻黄绿叶突变基因YGL8在编码框第671位碱基由C转换为T,导致第224位的编码氨基酸由丙氨酸(Ala)变异为缬氨酸(Val),该基因突变后的水稻YGL8突变体在全生育期叶片均呈现黄绿色,遗传分析发现该性状为隐性性状,能够将此性状作为分子标记进行田间除杂和种子纯度鉴定,对水稻的遗传育种具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于遗传学领域,具体涉及一种水稻黄绿叶突变基因YGL8,还涉及该基因 编码的蛋白和应用。
技术介绍
水稻(OrvzasativaL.)是世界上最重要的粮食作物,在120个国家和地区广泛 种植,全球一半以上的人口以稻米为主食。我国成功育成杂交水稻,并进行推广和应用,增 产的粮食为一些国家实现粮食自给创造了条件,对国家乃至世界粮食安全作出了杰出贡 献。然而由于不育系育性不稳定而造成的杂交种子混杂,严重影响杂种纯度和杂交水稻的 生产,甚至给农民造成的严重损失,制约杂交稻发挥更大作用。在两系和三系杂交稻育种及 生产实践中,人们发现不育系不育性表达不稳定现象普遍存在。因此,如何有效提高亲本繁 殖制种过程中的除杂效率,快速准确鉴定种子生产过程中因育性波动可能出现的种子纯度 问题,已成为杂交水稻研究和应用中的一个重要课题。叶色突变体可作为苗期标记性状进 行作物杂种一代新品种选育和种子纯度鉴定,其优势是在苗期即可通过观察标记性状的存 在或消失与否来识别真假杂种,因此在三系和两系杂交水稻亲本繁殖、杂交制种、杂交种子 纯度鉴定等方面得到充分利用。该项技术直观准确,简便快速,具有一般的异地种植鉴定和 DNA分子标记鉴定技术无法比拟的优越性。近年来育种家已经选育出多个带有叶色标记的 不育系,如白化转绿叶色标记不育系白丰A、淡黄叶不育系标810S、黄叶不育系黄玉A和黄 绿叶不育系黄标A系列。但由于多数苗期标记性状单系本身性状不优良、光合效率下降,造 成植株生长发育不正常而减产,使其在育种实践中的应用受到限制。因而,发现一些稳定遗 传、叶色变异对其它性状尤其产量、品质性状没有显著影响的叶色突变非常重要。
技术实现思路
有鉴于此,本专利技术的目的之一在于提供水稻黄绿叶突变基因YGL8,该基因为全生 育期标记性状,为水稻转基因研究提供有力的工具,促进杂交稻育种研究;本专利技术的目的之 二在于提供水稻黄绿叶突变基因YGL8编码的蛋白质;本专利技术的目的之三在于提供水稻黄 绿叶突变基因YGL8的应用。 为实现上述目的,本专利技术利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变优良恢复系缙恢10号,获 得了一个全生育期叶片均表现为黄绿色的突变体(命名为ygl8),遗传分析发现该突变性 状受一对隐性核基因(命名为YGL8)控制。分子标记定位结果显示,该基因定位于第1染 色体长臂端Indel标记ID-3和SSR标记RM12339之间54kb的区间内。 在上述基因定位的基础上,本专利技术通过候选基因预测、同源搜索及基因序列差 异比较,初步确定了YGL8为尿苷酸激酶(UMPkinase)基因(L〇C_0s01g73450);随后,本 专利技术以水稻黄绿叶突变体ygl8为材料,克隆了该基因的cDNA并进行了测序,具有如SEQ IDNo. 11所示的核苷酸序列,结果显示,YGL8基因由7个外显子组成,⑶S编码框全长为 1056bp,共编码351个氨基酸,其氨基酸序列如SEQIDNo. 12所示。与缙恢10号野生型基 因相比,YGL8基因在编码框第671位碱基由C转换为T,导致第224位的编码氨基酸由丙氨 酸(Ala)变异为缬氨酸(Val),该突变位点位于UMP结合位点附近。 然后,本专利技术构建了互补载体并转化水稻黄绿叶突变体ygl8,性状分析发现转基 因阳性植株叶片恢复正常绿色,叶绿素含量分析显示转基因阳性植株叶片叶绿素含量恢复 正常水平;构建RNAi载体并转化缙恢10号,经鉴定转基因阳性植株叶片变为黄绿色、叶绿 素含量极显著降低,转基因阳性植株中YGL8突变基因表达量也明显下调。因此,确定突变 体黄绿叶性状是由YGL8基因突变引起的。 本专利技术的有益效果在于:本专利技术提供了水稻黄绿叶突变基因YGL8,该基因为苗期 标记性状,对千粒重等主要农艺性状无显著影响,为水稻遗传育种研究提供了有力的工具, 为选育纯种不育系奠定基础。【附图说明】 为了使本专利技术的目的、技术方案和有益效果更加清楚,本专利技术提供如下附图: 图1为野生型缙恢10号和水稻黄绿叶突变体ygl8形态学观察结果(A:苗期野生 型缙恢10号与ygl8突变体植株和叶片;B:分蘖期野生型缙恢10号与ygl8突变体植株和 叶片;C:成熟期野生型缙恢10号与ygl8突变体植株) 图2为野生型缙恢10号和水稻黄绿叶突变体ygl8的细胞超微结构分析(A-B:野 生型缙恢10号的细胞超微结构分析;C-D:ygl8突变体的细胞超微结构分析)。 图3为野生型缙恢10号与ygl8突变体主要农艺性状分析(A:株高;B:单株有效 穗数;C:每穗粒数;D:每穗实粒数;E:结实率;F:千粒重)。 图4为水稻黄绿叶突变基因YGL8基因的遗传和物理图谱,其中A为YGL8的初步 定位,在第1染色体长臂SSR标记RM6141和RM6321之间;B为YGL8基因的精细定位,在 InDel标记ID-3和SSR标记RM12339之间54kb的范围内;C为突变基因所在的BAC克隆 AP0023263;D为突变体ygl8的候选基因0s01g73450的结构及突变位置。 图5为ygl8突变体的互补表型及RNAi鉴定分析,其中A为野生型WT和互补转基 因阳性植株(ygl8-C) ;B为野生型WT和互补转基因阳性植株(ygl8-C)的总叶绿素含量分 析;C为野生型WT和RNAi转基因阳性植株;D为野生型WT和RNAi转基因阳性植株的总叶 绿素含量分析;F为YGL8基因在野生型WT和RNAi转基因阳性植株中的表达分析。 图6为YGL8基因与野生型基因的序列比对图,YGL8基因cDNA在第671位发生了 c-τ的转变。 图7为YGL8基因编码蛋白与野生型基因编码蛋白的序列比对图,YGL8基因编码 蛋白在第224位发生了A-V的变异。【具体实施方式】 下面将结合附图,对本专利技术的优选实施例进行详细的描述。实施例中未注明具体 条件的实验方法,通常按照常规条件,例如分子克隆实验指南(第三版,J.萨姆布鲁克等 著)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。 本专利技术实施例中使用的材料:野生型水稻材料缙恢10号(WT)和水稻黄绿叶突变 体ygl8均由西南大学水稻研究所培育;M-MLV逆转录酶、高保真DNA聚合酶PFU、TaqDNA 聚合酶、T4DNA连接酶、限制性内切酶、pMD19-T载体、Trizol试剂盒、DNA凝胶回收试剂盒、 质粒提取试剂盒、λ-HindIIIDNAMarker及DL5000DNAMarker购自TaKaRa公司;DNA MarkerIII购自天根生化科技(北京)有限公司;氨节青霉素(Ampicillin,Amp)和卡拉 霉素(Kanamycin,Kan)为Sigma公司产品;引物合成和DNA测序由上海英俊生物技术有 限公司完成;其它化学试剂购自北京鼎国生物技术有限责任公司;大肠杆菌DH5a、农杆菌 LBA4404由本实验室保存。 实施例1、水稻黄绿叶突变体ygl8的获得和形态学观察 在西南大学水稻研究所水稻EMS突变体库中发现了一个全生育期表现为黄绿叶 突变体,根据表型特征命名为ygl8(图1)。该性状经过多代观察,表现稳定遗传,透射电镜 观察苗期野生型缙恢10号和ygl8突变体叶片细胞超微结构,突变体细胞结构完整,叶绿体 基粒片层结构受到破坏(图2)本文档来自技高网
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【技术保护点】
水稻黄绿叶突变基因YGL8,其特征在于:核苷酸序列如SEQ ID No.11所示。

【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员:何光华朱小燕张天泉郭爽杜青王忠伟邢亚迪桑贤春凌英华
申请(专利权)人:西南大学
类型:发明
国别省市:重庆;85

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