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对亲水气单胞菌O7,O8,O9和O10特异的核苷酸及应用制造技术

技术编号:12743486 阅读:93 留言:0更新日期:2016-01-21 10:55
本发明专利技术涉及一种对亲水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)O抗原特异的核苷酸及其应用,所述核苷酸包括1)SEQ ID NO:1-8所示的核苷酸中的至少一种;2)与SEQ ID NO:1-8所示的核苷酸互补的核苷酸中的至少一种。这些核苷酸可用于制备检测亲水气单胞菌用PCR试剂盒和基因芯片。本发明专利技术的对亲水气单胞菌O抗原特异的核苷酸及包含该核苷酸的PCR试剂盒、基因芯片的实用性强,PCR试剂盒配制方法简便,检测周期短、速度快,可操作性强,易于产业化生产,而检测成本却相对较低;准确性高;灵敏度高。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术设及对亲水气单胞菌07,08,09和010血清型特异的核巧酸,尤其设及对亲 水气单胞菌07, 08, 09和010血清型0抗原基因簇中单个基因特异的核巧酸及其应用。
技术介绍
亲水气单胞菌(Aeromonashy化ophila)属于弧菌科气单胞菌属,为革兰氏阴性短 杆菌,没有芽抱和芙膜,又名嗜水气单抱菌。亲水气单胞菌广泛存在于自然界众多水体中, 是多种水生动物的原发性致病菌。为条件性致病菌,是典型的人-兽-鱼共患病病原菌。它 通过肠道进入机体,可W产生毒性很强的外毒素,引起暴发性出血病。一般情况下,菌体对 肠道组织的粘附力越强,其产生的外毒素的毒性就越强。亲水气单胞菌的血清型很多,症状 也各异,由亲水气单胞菌感染的疾病一般病情严重,多位恶性传播,死亡率较高。 细菌分型与鉴定方法主要有传统的表型方法、血清学方法W及分子鉴定方法。然 而,随着分子生物学的发展,传统的血清分型和鉴定方法存在着一定的问题,如血清分型运 种诊断方法需要大量的抗血清,而抗血清一般种类不全,数量不足,大量的抗血清在制备和 储存中也存在一些困难。另一方面血清分型方法耗时长、灵敏度低、漏检率高、准确性差,不 同的0抗原产生的抗血清之间经常存在交叉反应。因此,建立基于分子生物学技术的血清 鉴定方法成为发展方向。亲水气单胞菌的分子鉴定越来越受到人们的重视,成为亲水气单胞菌菌种与株型 鉴定的重要依据,不少新菌也因此产生。对弧菌而言,生化反应主要是各种酶谱的表现,属 于外部形态的内容,核酸的相似性才是弧菌种的界定最根本、最直接的特征。因此,亲水气 单胞菌的分型与鉴定最有效、最直接的方式应该从核酸的研究触发,通过比较核酸(包括基 因组与核酸片段)的相似性确定亲水气单胞菌的归属。 近年来,越来越多的分子技术用于病原菌的分型、鉴定、检测及病害诊断,包括转 录间隔区ατ巧序列分析、随机扩增长度多态性(RAPD)分析、核糖体DNA限制性片段长度 多态性(RFL巧分析等。分子生物学方法不仅可用于亲水气单胞菌的快速血清分型筛查, 稳定的鉴定结果可W弥补表型特征鉴定方法的不足。和传统检测技术相比,运些基于多聚 酶链式反应(PCR)的分子检测技术,不需要经过病原菌的分离、纯培养等过程,而且具有快 速、灵敏、特异性强等优点。 聚合酶链式反应技术(Polymerasechainreaction,简称PCR技术)作为微生物 检测技术目前正在得到认同和推广,该技术相对于传统的方法有高通量、检测速度快、特异 性强、灵敏度高等优点,只需对样品进行简单的预增菌或增菌过程,再通过离屯、及裂解制备 细菌DNA模板,就可W在高特异性引物介导下的PCR过程中扩增目标序列,达到检测样品中 是否含有待测的致病性微生物的目的。PCR的扩增过程仅需1个半小时。运对检验检疫部 口和临床检验无疑极大提高了工作速度和降低了工作成本。不论从国内和国际的角度来看,快速、准确地鉴定出血清类型,为亲水气单胞菌的 防控提供有效技术支持是十分重要的。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供了一种对亲水气单胞菌0抗原特异的核巧酸,其特征在于 所述的核巧酸具有: 1) 沈QIDNO: 1-8所示的核巧酸中的至少一种; 2) 与SEQIDNO: 1-8所示的核巧酸互补的核巧酸中的至少一种;所述的SEQIDNO: 1-8 如下:本专利技术还提供了一种PCR试剂盒,包括PCR引物、dNTP、缓冲液和DM聚合酶,所述PCR引物为如SEQIDN0:l-8所示的核巧酸中的至少一种。所述的试剂盒,还包括如下试剂:10 mldNTP30μ1 ; 10X酶特异性反应缓冲液50μ1 ;5U/μ1耐热DNA聚合酶5μ1 ;引物混合 物10μ1 ;阳性对照品10μ1 ;阴性对照品10μ1;d地2〇 5ml。 其中所述的PCR引物优选为所述如SEQIDNO: 1-8所示的核巧酸中的至少一种。 本专利技术进一步公开了一种对亲水气单胞菌0抗原特异的SEQIDNO: 1-8核巧酸在 制备用于检测亲水气单胞菌0抗原PCR试剂盒、基因忍片或微阵列方面的应用。 本专利技术所述亲水气单胞可W取样于自来水、污水、海水的培养物的粗提液、瓜果蔬 菜中、病体标本或是亲水气单胞菌的纯培养物的粗提液。 收集亲水气单胞菌提取基因组是采用常规方法制备获得。 针对亲水气单胞菌的PCR试剂盒,整个检测步骤包括样品预处理一扩增一电泳检 测结果。引物和PCR反应体系所需要的试剂已预先加入扩增管中,使用者只需将预处理后 的样本加入扩增管启动扩增反应即可,简单快速的完成检测工作。 本专利技术还提供一种基因忍片,包括固相载体和固定在固相载体上的寡核巧酸探 针,其中所述寡核巧酸探针包括上述的核巧酸;其中所述核巧酸优选为如SEQIDNO: 1-8所 示的核巧酸。 本专利技术还提供一种微列阵,其包括上述的核巧酸;其中所述核巧酸优选为如SEQ IDNO: 1-8所示的核巧酸。检测亲水气单胞的基因忍片方面、检亲水气单胞微阵列方面的应 用。所述亲水气单胞菌是检测由于污染水源和未煮熟、未清洗的食物引起的急性胃肠炎、外 伤感染、肠道传染病、医院内感染等多种混合型感染的细菌。 本专利技术公开的一种对亲水气单胞菌0抗原特异的核巧酸与现有技术相比,本专利技术 具有如下优点: (1)实用性强:本专利技术建立的一种PCR反应体系,可检测亲水气单胞菌,提供血清分型 检测所用到的特异引物,利用该PCR方法可W对临床标本进行检测。 (2)准确性高:本专利技术通过对亲水气单胞菌的各血清型特异的基因的PCR反应,每 个样品得到一条目的条带,将得到目的片段与已知长度相比较,就可W得到亲水气单胞菌 所属的血清型。 (3)检测成本相对较低:可W推广应用于食品卫生监督、环境监测、尚品监测检验 检疫等领域,并为其他不同致病菌检测组合提供技术模式。 W上所述,仅是本专利技术的操作和实施方法而已,并非对本专利技术作任何形式上的限 审IJ,凡是依据本专利技术的技术实质对W上实施例所作的任何简单修改、等同变化与修饰,均仍 属于本专利技术技术方案的范围内。【附图说明】: 图1表示本专利技术07血清型特异引物检测亲水气单胞菌其他血清型标准菌株电泳结果 图,wz/s基因P1和P2引物的筛选,目的条带为15化P,其余的血清型没有任何条带具体菌株 信息见表2 ; 图2表示本专利技术07血清型特异引物种特异性的鉴定电泳结果图,其中检测了 6株弧菌W及1株沙口菌、1株大肠杆菌,均无任何条带,具体菌株信息见表2 ; 图3表示本专利技术08血清型wzm基因P3和P4引物检测亲水气单胞菌其他血清型标准 菌株电泳结果图,wzm基因P3和P4引物的筛选,目的条带为193bp,其余的血清型没有任何 条带。具体菌株信息见表2; 图4表示本专利技术08血清型wzm基因P3和P4引物种特异性的鉴定电泳结果图,其中检 测了 6株弧菌W及1株沙口菌、1株大肠杆菌,均无任何条带。具体菌株信息见表2 ; 图5表示本专利技术09血清型G7基因P5和P6引物检测亲水气单胞菌其他血清型标准菌 株电泳结果图,獻基因P5和P6引物的筛选,目的条带为159bp,其余的血清型没有任何条 带,具体菌株信息见表2; 图6表示本专利技术09血清型G7基因P5和P6引物种特异性的鉴定;电泳结果图,其中检 测了 6株弧菌W及1株沙口菌、1株本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种对亲水气单胞菌O抗原特异的核苷酸,其特征在于所述的核苷酸具有:1)SEQ ID NO:1‑8所示的核苷酸中的至少一种;2)与SEQ ID NO:1‑8所示的核苷酸互补的核苷酸中的至少一种。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:王磊许广楠王敏张新杰许玲玲
申请(专利权)人:南开大学
类型:发明
国别省市:天津;12

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