本发明专利技术属于植物生物技术领域，具体涉及一种鉴别水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记。所述的鉴别水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记，与野生型位点检测相关的标记Cas-tgw6-1的核苷酸序列SEQ ID No.1所示。用于鉴定上述水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记的引物为：上游引物TGW6-F：5′-CAACCAAACCAAAGCCTGC-3′；下游引物TGW6-R：5′-CAACTCGCATCAATCCCATG-3′；所述的鉴别水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记或引物可以应用于水稻种质资源鉴定或育种辅助选育中。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于植物生物
，具体设及一种鉴别水稻千粒重基因TGW6野生型 和突变体的分子标记。
技术介绍
千粒重是水稻产量S要素之一，迄今已有7个控制水稻粒重和粒形的giL得到克 隆，其中，TGW6是由Ishimaru等（2013)应用化卵onbare/Kasalath所衍生的回交近交系 定位并克隆的，它编码吗I噪乙酸-葡糖糖水解酶的基因，同时控制粒长和千粒重。该基因位 于水稻第6染色体长臂C358附近，序列比对和遗传互补实验表明：Kasalath的TGW6等位 基因为功能缺失突变，引起胚乳中吗I噪乙酸含量下降，进而使细胞数量增加，粒长变长、粒 重增加。CRISPR/tas9系统是2013年开发的一种快速、简单的对基因组进行定点编辑的新 技术，该技术不仅在模式植物拟南芥中得到应用，也在玉米、水稻、小麦、高梁等禾本科作物 中也取得了突破。水稻上，已有3个不同的研究组成功利用CRISPR/tas9系统对PDS、MPK2、 BAD肥、0s02g23823、OsSWEETll、0sSWEET14、R0C5、SPP和YSA等基因进行精确编辑，得到了 预期的序列变异及突变表型。由于CRISPR/tas9系统只是通过识别祀序列后进行剪切，再 利用宿主自身的DNA修复机制来实现基因定点编辑，转入的载体及其携带的抗性筛选标记 可W在自交后代中获得不存在转基因成分的植株，从而可W避免由转基因可能引起的安全 和伦理问题。 为提高Cas-tgw6突变体在育种中的利用效率，开发一种用于区分Cas-tgw6突变 体与其它常规水稻品种的分子标记，W实现TGW6等位基因型的有效、可靠、快速鉴定，在后 续利用Cas-tgw6突变体进行育种群体筛选中具有重要价值。虽然王军等（2014)《水稻千 粒重基因TGW6功能标记的开发与利用》（中国水稻科学2014,28(5) :473-478)的文章中开 发了一种针对千粒重基因TGW6功能标记，但该标记不能有效区分化s-tgw6突变体，而且还 需要对扩增产物进行酶切才能区分。
技术实现思路
为了克服现有技术的不足和缺点，本专利技术的首要目的在于提供一种鉴别水稻千粒 重基因TGW6野生型和突变体的分子标记。 本专利技术的另一目的在于提供上述分子标记的应用。 一种鉴别水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记，与野生型位点检测 相关的标记化s-tgw6-l的核巧酸序列如下所示：CAACCAAACCAAAGCCTGCAGCTGCAGCGAACGAGAGCACCAGCACGAGAGCCAAGCGTACGTGCAGTG CAGCCAACTGATCAGACTGAGACAGCGCGCGTACACGGCCGAGCTCCTACAGGCTACAGCCATGAGAAGCACGGCGA GGCAAGCGGCGACCGCGGCGGCGTTCGCGCTCATTGTCTTCCTCGTGCTGCTCTCGCCGTCCCCTACTGCCGCCGCC ACAGCCACAACGAGAATGTTCAAGACCATTGACGCCCGGCGGAGCCAGCATCTGGACCTCGGCGGATCACTGGTCGG CCCGGAGAGCGTCGCGTTCGACGGCAAAGGCCGCGGCCCGTACAGCGGCGTCTCCGACGGCCGCATCATGAGGTGGA ACGGCGAGGCCGCTGGCTGGAGCACCTACACGTACAGCCCCAGCTACACGAAAAACAAGTGCGCGGCATCGACTCTC CCCACGGTCCAGACCGAGAGCAAATGCGGCCGCCCGTTAGGCCTACGGTTTCACTACAAAACCGGCAACCTGTACAT CGCCGACGCCTACATGGGATTGATGCGAGTTG； 所述的水稻品系为H447 ; 所述的H447为R819/玉香占//R8I9BC2F7代稳定品系，即先将R819与玉香占杂 交，再将杂交后代与R819回交两次后再自交7代后所得的稳定品系； 所述的水稻千粒重基因tgw6突变体为化s-tgw6。、Cas-tgw6b或化s-tgw6C; 与突变体化s-tgw63位点检测相关的标记化s-tgw6-2的核巧酸序列如下所示： CAACCAAACCAAAGCCTGCAGCTGCAGCGAACGAGAGCACCAGCACGAGAGCCAAGCGTACGTGCAGTG CAGCCAACTGATCAGACTGAGACAGCGCGCGTACACGGCCGAGCTCCTACAGGCTACAGCCATGAGAAACTACAAAA CCGGCAACCTGTACATCGCCGACGCCTACATGGGATTGATGCGAGTTG； 与突变体化s-tgw6b位点检测相关的标记化s-tgw6-3的核巧酸序列如下所示： CAACCAAACCAAAGCCTGCAGCTGCAGCGAACGAGAGCACCAGCACGAGAGCCAAGCGTACGTGCAGTG CAGCCAACTGATCAGACTGAGACAGCGCGCGTACACGGCCGAGCTCCTACAGGCTACAGCCATGGGGCGGATCACTG GTCGGCCCGGAGAGCGTCGCGTTCGACGGCAAAGGCCGCGGCCCGTACAGCGGCGTCTCCGACGGCCGCATCATGAG GTGGAACGGCGAGGCCGCTGGCTGGAGCACCTACACGTACAGCCCCAGCTACACGAAAAACAAGTGCGCGGCATCGA CTCTCCCCACGGTCCAGACCGAGAGCAAATGCGGCCGCCCGTTAGGCCTACGGTTTCACTACAAAACCGGCAACCTG TACATCGCCGACGCCTACATGGGATTGATGCGAGTTG； 与突变体化s-tgw6。位点检测相关的标记化s-tgw6-4的核巧酸序列如下所示： CAACCAAACCAAAGCCTGCAGCTGCAGCGAACGAGAGCACCAGCACGAGAGCCAAGCGTACGTGCAG TGCAGCCAACTGATCAGACTGAGACAGCGCGCGTACACGGCCGAGCTCCTACAGGCTACAGCCATGAGAATGTTC AAGACCATTGACGCCCGGCGGAGCCAGCATCTGGACCTCGGCGGATCACTGGTCGGCCCGGAGAGCGTCGCGTTC GACGGCAAAGGCCGCGGCCCGTACAGCGGCGTCTCCGACGGCCGCATCATGAGGTGGAACGGCGAGGCCGCTGGC TGGAGCACCTACACGTACAGCCCCAGCTACACGAAAAACAAGTGCGCGGCATCGACTCTCCCCACGGTCCAGACC GAGAGCAAATGCGGCCGCCCGTTAGGCCTACGGTTTCACTACAAAACCGGCAACCTGTACATCGCCGACGCCTAC ATGGGATTGATGCGAGTTG； 一种用于鉴定上述水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记的引物为： 上游引物TGW6-F: 5' -CAACCAA本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种鉴别水稻千粒重基因TGW6野生型和突变体的分子标记，其特征在于：与野生型位点检测相关的标记Cas‑tgw6‑1的核苷酸序列如下所示：CAACCAAACCAAAGCCTGCAGCTGCAGCGAACGAGAGCACCAGCACGAGAGCCAAGCGTACGTGCAGTGCAGCCAACTGATCAGACTGAGACAGCGCGCGTACACGGCCGAGCTCCTACAGGCTACAGCCATGAGAAGCACGGCGAGGCAAGCGGCGACCGCGGCGGCGTTCGCGCTCATTGTCTTCCTCGTGCTGCTCTCGCCGTCCCCTACTGCCGCCGCCACAGCCACAACGAGAATGTTCAAGACCATTGACGCCCGGCGGAGCCAGCATCTGGACCTCGGCGGATCACTGGTCGGCCCGGAGAGCGTCGCGTTCGACGGCAAAGGCCGCGGCCCGTACAGCGGCGTCTCCGACGGCCGCATCATGAGGTGGAACGGCGAGGCCGCTGGCTGGAGCACCTACACGTACAGCCCCAGCTACACGAAAAACAAGTGCGCGGCATCGACTCTCCCCACGGTCCAGACCGAGAGCAAATGCGGCCGCCCGTTAGGCCTACGGTTTCACTACAAAACCGGCAACCTGTACATCGCCGACGCCTACATGGGATTGATGCGAGTTG。...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：王加峰，郭涛，罗文龙，周丹华，陈志强，王慧，
申请(专利权)人：华南农业大学，
类型：发明
国别省市：广东;44
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