一种鉴定或辅助鉴定普通小麦穗粒数性状的方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种鉴定或辅助鉴定普通小麦穗粒数性状的方法及其应用。本发明专利技术的方法为检测待测小麦的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G，TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为A的待测小麦的穗粒数大于或候选的大于TaSBEI-7A基因(AJ237897)的第4384位脱氧核糖核苷酸为G的待测小麦。通过实验证明：本发明专利技术的方法可以有效的鉴定待测小麦的穗粒数性状，在提高小麦穗粒数的分子标记辅助选择和分子设计育种中具有较好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种鉴定或辅助鉴定普通小麦穗粒数性状的方法及其应用，属于生物

技术介绍
小麦是主要的粮食作物之一，提高其产量对世界粮食安全具有重要意义。产量的提高涉及到小麦生长过程中的各个环节，淀粉占小麦籽粒干重的70％左右，其产量最终体现是籽粒中淀粉储藏的多少。因此，在小麦中开展相关研究有利于阐明淀粉合成途径及其影响因素，也为小麦的高产育种提供理论依据。淀粉合成是植物体中非常重要的能量代谢途径，并与最终的储藏物质(产量)的形成息息相关，而且，淀粉合成途径的关键酶基因作为与产量相关的候选基因，其遗传变异可能与淀粉产量和组成有关(WilsonLM,WhittSR,IbanezAM,etal.Dissectionofmaizekernelcompositionandstarchproductionbycandidategeneassociations.PantCell,2004,16:2719-2733)。
技术实现思路
本专利技术的一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的方法。本专利技术提供的鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的方法包括如下步骤：检测待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G；TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为A的待测植物的穗粒数大于或候选的大于TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为G的待测植物；所述TaSBEI-7A基因的序列如GenBankAccessionNumberAJ237897所示。所述TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸也就是TaSBEI-7A基因的第10个外显子上的第10位核苷酸。上述方法中，所述检测待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G的方法为如下1)或2)：1)直接测序；2)用能够扩增含有TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸的引物对扩增所述待测植物的基因组DNA，得到PCR扩增产物，用限制性内切酶酶切所述PCR扩增产物，得到酶切产物，根据所述酶切产物确定待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G。上述方法中，所述引物对由SEQIDNo.1所示的DNA分子和SEQIDNo.2所示的DNA分子组成；所述限制性内切酶为BsmI；根据所述酶切产物确定待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G的方法为：若酶切产物中仅含有大小为7bp、18bp、57bp和1077bp的片段；则待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为A；若酶切产物中仅含有大小为7bp、75bp和1077bp的片段；则待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为G。上述方法中，所述待测植物为小麦。本专利技术的另一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的试剂。本专利技术提供的鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的试剂是检测待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G的物质；所述TaSBEI-7A基因的核苷酸序列如GenBankAccessionNumberAJ237897所示。上述试剂中，所述物质为由SEQIDNo.1所示的DNA分子和SEQIDNo.2所示的DNA分子组成的引物对。本专利技术的最后一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的试剂盒。本专利技术提供的鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的试剂盒包括上述试剂。上述试剂或上述试剂盒在鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状中的应用也属于本专利技术的保护范围。上述试剂或上述试剂盒在制备鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的产品中的应用也属于本专利技术的保护范围。上述试剂或上述试剂盒或上述应用中，所述待测植物为小麦。上述方法或上述试剂或上述试剂盒在植物育种中的应用也属于本专利技术的保护范围。本专利技术发现了小麦TaSBEI-7A基因的第10外显子SNP(G/A)的变化使其编码氨基酸发生变化，并基于此SNP专利技术了一种鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的方法及其专用引物对：检测待测小麦的TaSBEI-7A基因的SNP是A还是G，TaSBEI-7A基因的SNP为A的待测小麦的穗粒数大于或候选的大于TaSBEI-7A基因的SNP为G的待测植物。通过实验证明：348份中国小麦现代育成品种中TaSBEI-7A基因的SNP位点为A的小麦品种的穗粒数明显多于TaSBEI-7A基因的SNP为G的小麦品种的穗粒数，说明本专利技术的引物对和方法可以有效的鉴定待测小麦的穗粒数性状，在提高小麦穗粒数的分子标记辅助选择和分子设计育种中具有较好的应用前景。附图说明图1为TaSBEI染色体定位，泳道从左到右依次为N7AT7B：缺7A补7B；N7AT7D：缺7A补7D；N7BT7A：缺7B补7A；N7BN7D：缺7B补7D；N7DT7A：缺7D补7A；N7DT7B：缺7D补7B；CS：中国春：；H2O：水；M：分子量标记。图2为TaSBEI-7A定位标记。图3为TaSBE-7A在南大2419×望水白重组自交系中的连锁定位。图4为TaSBEI-7A多态性位点的分布。图5为TaSBEI-7A第十外显子SNP的dCAPS标记设计。图6为Hap-7A-A频率在中国小麦育成品种中随年代的变化。图7为TaSBEI-7A不同等位变异在中国各麦区的分布。图7a为地方品种；图7b为育成品种。其中，I：北部冬麦区；II：黄淮冬麦区；III：长江中下游冬麦区；IV：西南冬麦区；V：华南冬麦区；VI：东北春麦区；VII：北部春麦区；VIII：西北春麦区；IX：青藏春冬麦区；X：新疆冬春麦区。具体实施方式下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。实施例1、辅助鉴定小麦穗粒数性状的方法一、小麦TaSBEI-7A基因g.4384G>A多态性位点的确定1、中国春缺四体定位根据已有序列TaSBEI-7A(AJ237897)、TaSBEI-7D(AF525764.1)以及在IWSC检索到的TaSBEI-7B(Traes_7BL_11C5C7BC4)序列，分别设计如下引物：SB1A-1437F和SB1A-1437R、SB1-DF和SB1-DR、Sbe1-BF和Sbe1-BR(表2)，并在中国春缺四体中进行定位，将其定位于第七同源群(图1)。2、TaSBE本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的方法，包括如下步骤：检测待测植物的TaSBEI‑7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G；TaSBEI‑7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为A的待测植物的穗粒数大于或候选的大于TaSBEI‑7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸为G的待测植物；所述TaSBEI‑7A基因的核苷酸序列如GenBank Accession Number AJ237897所示。

【技术特征摘要】
1.一种鉴定或辅助鉴定待测植物穗粒数性状的方法，包括如下步骤：检测待测植
物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G；TaSBEI-7A基因的第
4384位脱氧核糖核苷酸为A的待测植物的穗粒数大于或候选的大于TaSBEI-7A基因的
第4384位脱氧核糖核苷酸为G的待测植物；
所述TaSBEI-7A基因的核苷酸序列如GenBankAccessionNumberAJ237897所示。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述检测待测植物的TaSBEI-7A
基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是A还是G的方法为如下1)或2)：
1)直接测序；
2)用能够扩增含有TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸的引物对扩增所
述待测植物的基因组DNA，得到PCR扩增产物，用限制性内切酶酶切所述PCR扩增
产物，得到酶切产物，根据所述酶切产物确定待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384
位脱氧核糖核苷酸是A还是G。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于：所述引物对由SEQIDNo.1所
示的DNA分子和SEQIDNo.2所示的DNA分子组成；所述限制性内切酶为BsmI；
根据所述酶切产物确定待测植物的TaSBEI-7A基因的第4384位脱氧核糖核苷酸是
A还是G的方法为：
若酶切产物中仅含有大小为7bp、18bp、57bp和1077bp的片段；则待测...

【专利技术属性】
技术研发人员：郝晨阳，降彦苗，李甜，张学勇，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：北京;11