暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记制造技术

技术编号:12142585 阅读:88 留言:0更新日期:2015-10-03 00:15
本发明专利技术涉及暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记,属DNA分子标记技术领域。本发明专利技术在已经获得其基因组数据的基础之上,利用常规的生物信息学方法,在基因组水平上检测其SSR的分布,进行引物设计,利用来自西双版纳地区的暗褐网柄牛肝菌样品,选取部分引物进行初筛、复筛后,得到15个具有多态性的SSR分子标记,其编号为: PP50097、PP64100、PP32087、PP85099、PP80085、PP56123、PP76127、PP57130、PP39117、PP60130、PP93120、PP23157、PP45160、PP30156、PP48147。本发明专利技术的有益效果在于:暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记,建立技术体系,弥补其特异性分子标记的空白,为暗褐网柄牛肝菌遗传多样性,群体遗传学及种质鉴定研究提供有力的研究工具。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记,具体涉及暗褐网柄牛肝菌的简单重复序列(SSRs,Simple sequence repeats)分子标记,属DNA分子标记

技术介绍
简单重复序列(SSRs,Simple Sequence Repeats),又叫做微卫星位点(Microsatellites),是由I ~ 6 bp的重复单元串联重复而成的序列(Sharma et al.2007)。它们在原核、真核基因组中广泛分布,在基因编码区及非编码区都能找到(Li etal.2004)。作为分子标记,SSR有许多优点:在整个基因组中分布广泛、均匀且数量充足,因而多态性很高;SSR标记呈孟德尔共显性遗传,可以区分纯合、杂合基因型;PCR扩增仅需要少量DNA,且对DNA的质量要求不高。近年来还发现SSR在基因组中可能发挥着一些功能,例如影响基因调控、基因组系统组成等。因此从基因组水平上了解SSR的分布是非常重要的。传统获得SSR标记的方法需通过建立、筛选基因组文库、克隆测序、引物设计等一系列实验,耗费许多人力、物力。而现在,随着基因组测序越来越便捷,由基因组数据中直接开发S本文档来自技高网...
暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记

【技术保护点】
暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记,其特征在于暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记包括15个具有多态性的SSR分子标记,其编号为: PP50097、PP64100、PP32087、PP85099、PP80085、PP56123、PP76127、PP57130、PP39117、PP60130、PP93120、PP23157、PP45160、PP30156、PP48147;其中:上述SSR分子标记的核苷酸序列分别为:PP50097,由SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列组成:PP64100,由SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列组成:PP32087,由SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列组成:PP8509...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:曹旸徐建平张颖张春霞何明霞刘静高锋王文兵许欣景
申请(专利权)人:云南省热带作物科学研究所云南大学
类型:发明
国别省市:云南;53

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