用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性的试剂盒制造技术

技术编号:11944380 阅读:79 留言:0更新日期:2015-08-26 15:17
本发明专利技术提供一种用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性的试剂盒,该试剂盒包括针对DNAH11基因上单核苷酸多态性位点rs2285947(G→A)的引物,以及针对LRFN2基因上单核苷酸多态性位点rs2494938(G→A)的引物。本发明专利技术所选取的单核苷酸多态性位点在亚洲人群中具有显著相关性,并且彼此独立、不存在连锁不平衡,因此本发明专利技术的位点选择具有代表性、独立性和风险值可积累性。本发明专利技术同时提供了上述试剂盒检测结果的评估方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性的试剂盒
技术介绍
肺癌是发病率和死亡率增长最快,对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。 近50年来许多国家都报道肺癌的发病率和死亡率均明显增高,男性肺癌发病率和死亡率 均占所有恶性肿瘤的第一位,女性发病率占第二位,死亡率占第二位。 基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列, 预测罹患多种疾病的可能性,从而实现提前预防和治疗。 中国专利申请201210021993. 1提供了一种检测小细胞肺癌易感基因无创检测试 剂盒。该试剂盒包括检测VEGF基因上T-460C,CYPlAl基因上Ile462Val,MTHFR基因上 C677T的3个单核苷酸多态性位点基因型的特异性引物与DNA测序引物、PCR反应组件、PCR 产物纯化组件、DNA测序反应组件等。 上述技术方案的缺陷在于,相关基因的独立性差,存在连锁不平衡。
技术实现思路
为了克服现有技术的不足,本专利技术的目的在于提供一种用于辅助评价待测者肺癌 遗传风险性的试剂盒,以及其检测结果的评估方法。 为实现上述目的,一方面,本专利技术提供一种用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性 的试剂盒,该试剂盒包括: 针对DNAHll基因上单核苷酸多态性位点rs2285947(G - A)的引物,以及 针对LRFN2基因上单核苷酸多态性位点rs2494938 (G - A)的引物。 本专利技术的试剂盒通过检测与肺癌发生密切相关的单核苷酸多态性位点,来评估受 试者肺癌患病风险级别,并最终根据每个受试者的基因检测结果,从基因层面指导受试者 有针对性地预防和早期诊断肺癌,降低肺癌的发病率,进行早期治疗,提高生存率。 本专利技术所选取的单核苷酸多态性位点在亚洲人群中具有显著相关性,并且彼此独 立,不存在连锁不平衡,因此本专利技术的位点选择具有代表性、独立性和风险值可积累性。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对TP63基因上单核苷酸多 态性位点rs4488809(T -C)的引物。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,针对单核苷酸多态性位点rs2285947的引物包 括: rs2285947 上游引物:AGTATGATGAGTTTGGAGCA(SEQ ID N0:1); rs2285947 下游引物:GGAAATAAGCCAAACTGAGA(SEQ ID N0:2)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,针对单核苷酸多态性位点rs2494938的引物包 括: rs2494938 上游引物:ACTAAGCCTCAGTCAAGGTTTG(SEQ ID N0:3); rs2494938 下游引物:TAGCGAGGCATTTGGAACAG(SEQ ID N0:4)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,针对单核苷酸多态性位点rs4488809的引物包 括: rs4488809 上游引物:GGGAAGGTAGAATATATGAGT(SEQ ID N0:5); rs4488809 下游引物:AAGCCCTCTCAATATCTG(SEQ ID N0:6)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对DCBLDl基因上单核苷酸 多态性位点rs9387478(C -A)的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs9387478的引物包 括,例如,rs9387478 上游引物:GGCAGAAAGGAAACAGTTGT(SEQ ID N0:7) ;rs9387478 下游引 物:ATGTTGGGAATTGTTGAGAC(SEQ ID N0:8)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对MIPEP基因上单核苷酸多 态性位点rs753955(A - G)的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs753955的引物包括, 例如,rs753955 上游引物:GCACCACACATTCTTAGGAC(SEQ ID N0:9) ;rs753955 下游引物: TTATGGAGGCTGGCAAGTC(SEQ ID N0:10)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对MTMR3基因上单核苷酸 多态性位点rs36600(T - C)的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs36600的引物包括, 例如,rs36600 上游引物:GTAGAATTGTTGGATCATAGG(SEQ ID NO: 11) ;rs36600 下游引物: GAGATGCCACTGAATTGTA(SEQ ID N0:12)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对VTIlA基因上单核苷酸多 态性位点rs7086803 (G - A)的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs7086803的引物包括, 例如,rs7086803 上游引物:GTGGGTGGAGAGAAATCAAG(SEQ ID N0:13) ;rs7086803 下游引物: GATCATGCGGCTAGGTCACT(SEQ ID N0:14)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对TERT基因上单核苷酸多 态性位点rs2736100(C -A)的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs2736100的引物包括, 例如,rs2736100 上游引物:GTCTGAAACATTGCTACCCT(SEQ ID N0:15) ;rs2736100 下游引物: TCGTGAGTCTCCACATCTTC(SEQ ID N0:16)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对HLA基因上单核苷酸多态 性位点rs2395185(G - T)的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs2395185的引物包括, 例如,rs2395185 上游引物:CACTTCAAATCATTTCCTCC(SEQ ID N0:17) ;rs2395185 下游引物: TCTGTCCCTTTATTTCTCAA(SEQ ID N0:18)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒进一步包括针对单核苷酸多态性位 点rs28366298的引物。该针对单核苷酸多态性位点rs28366298的引物包括,例如, rs28366298 上游引物:AGTCCAAGATTAAGGCAC(SEQ ID N0:19) ;rs28366298 下游引物: TACATTGTTTAGCCTGAACT(SEQ ID N0:20)。 根据本专利技术另一【具体实施方式】,试剂盒的组分和含量包括:PCR反应体系、PCR产 物纯化体系、测序反应体系。其中,前述引物属于PCR反应体系;PCR产物纯化体系用于PCR 扩增产物纯化;测序反应体系用于DNA测序,进而确定单核苷酸多态性位点的基因型。例 如,PCR反应体系包括10XPCR反应缓冲液2. 5ul ;25mM dNTP混合液0. 2ul ;5U/ul Taq DNA 聚合酶0. 125ul ;20uM引物对,每条引物0. 25ul ;ddH20 19. 175ul。例如,PCR产物纯化体系 包括:lU/ul SAP 酶 0· 75ul ;10U/ul ExoI 酶 0· 375ul ;ddH20 3. 875ul。例如,测序反应体系 包括:25% BigDye mix Iul ;3· 2本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:针对单核苷酸多态性位点rs2285947的引物,以及针对单核苷酸多态性位点rs2494938的引物。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:由晓斌兰兆吉
申请(专利权)人:广州拓普基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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