鱼虾多家系多分组保种方法技术

本发明专利技术公开了一种鱼虾多家系多分组保种方法，所述方法包括：确定测试池数量；测定测试家系的目标性状值；将多个家系以分组的形式、按照指定限定条件分配到测试池中；在测试池中养殖测试家系；测定达到指定养殖要求的存活家系的目标性状值；计算存活个体的直接遗传效应值和间接遗传效应值；计算留种选择指数；根据留种选择指数选择留种家系和留种个体。通过对多家系采用多分组方式进行保种，可以解决现有保种方法因直接遗传效应、间接遗传效应、环境效应等混淆在一起而导致遗传评估数据不准确、影响鱼虾选择育种准确度的问题。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于水产养殖
，具体地说，是涉及一种鱼虾多家系多分组保种方法。
技术介绍
在水产动物选择育种体系中，家系保种是一个非常重要的环节。保种家系可以作为育种群体的备份种质，构建下一世代家系。例如，如果混养群体由于养殖管理不当，出现大规模死亡；或者由于对混养群体进行了病毒感染试验，存活个体无法直接留种，可以利用保种家系的个体作为亲本，构建下一世代家系。现有鱼虾家系保种时，采用单独养殖的方法留种优秀家系和个体。具体来说，是从每个家系中选择一部分个体，单独养殖在一个或几个保种池中，养殖后留种优秀家系及个体。采用家系独立养殖，如果某个保种家系感染细菌或病毒病，由于每个家系单独养殖，并不会感染至其他家系，其他保种家系仍然处于无特定病原状态(specific pathogen free，SPF)状态，从而可以保持核心种质的SPF状态。但是这种家系独立养殖也存在着缺点，由于每个保种池都是一个小环境，家系的直接遗传效应、保种池的环境效应以及同家系个体间的竞争效应等都混淆在一起，无法区分，如果通过这种保种方法留种家系和个体，难以对目标性状进行有效的遗传评估,进而严重影响鱼虾选择育种的准确度。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种鱼虾多家系多分组保种方法，以解决现有保种方法因直接遗传效应、间接遗传效应、环境效应等混淆在一起而导致遗传评估数据不准确、影响鱼虾选择育种准确度的问题。>为实现上述专利技术目的，本专利技术采用下述技术方案予以实现：一种鱼虾多家系多分组保种方法，其特征在于，所述方法包括：确定测试池数量：确定所有测试家系的数量f，设置与所述测试家系数量相等的测试池t＝f；测定测试家系的目标性状值：将每个所述测试家系中的个体等分为g个分组，每个分组包含k尾个体，测定并记录所述每个分组内每尾个体的目标性状值，计算每个分组内所有个体的目标性状平均值并记录；家系分配：将所有所述测试家系的所有分组内的个体以分组为单位、按照下述限定条件分配到所述测试池中：每个所述测试家系的g个分组分别分配到g个不同的测试池中，每个所述测试池均包括有g个不同家系的分组，任意两个所述测试家系在每个所述测试池中同时出现的次数不大于1；每个所述测试池内所有g个所述测试家系的家系目标性状变异系数不大于f个所述测试家系的家系目标性状变异系数和/或每个所述测试池内的所有个体的个体目标性状变异系数不大于f个所述测试家系内的所有个体的个体目标性状变异系数；每个所述测试池内所有g个所述测试家系间的亲缘系数平均值不大于f个所述测试家系间的亲缘系数平均值；所述个体目标性状变异系数为相关个体目标性状值的标准差除以相关个体目标性状平均值，所述家系目标性状变异系数为相关家系目标性状值的标准差除以相关家系目标性状平均值，家系目标性状值为该家系内相关个体目标性状值的平均值；测试池养殖测试家系：将按照上述限定条件分配到测试池中的测试家系进行养殖，达到指定养殖要求；测定达到指定养殖要求的存活家系的目标性状值：达到指定养殖要求后，测定并记录每个所述测试池内存活个体的目标性状值；计算存活个体的直接遗传效应值和间接遗传效应值：依据上述家系分配分案、所述存活个体的目标性状值和所述存活个体的系谱信息建立线性混合效应模型，利用最佳线性无偏预测法计算每个所述存活个体的直接遗传效应值和间接遗传效应值；计算综合选择指数：按照公式计算每个所述存活个体的综合育种值，按照公式计算每个所述存活个体的个体综合选择指数；对属于同一家系的存活个体的个体综合选择指数求平均值，获得家系综合选择指数；其中，Ti表示第i个存活个体的综合育种值，表示第i个存活个体的直接遗传效应值，表示第i个存活个体的间接遗传效应值,Ii表示第i个存活个体的个体综合选择指数，表示所有存活个体综合育种值的平均值，σT表示所有存活个体综合育种值的标准差；选择留种家系和留种个体：根据所述家系综合选择指数从高到低依次选择一定数量的家系作为留种家系，从留种家系内根据所述个体综合选择指数从高到低依次选择一定数量的存活个体作为留种个体。优选的，所述测试家系的数量f满足：f≥31；每个所述测试家系的分组数g满足：3≤g≤6；所述每个分组包含的个体数量k满足：5≤k≤30。与现有技术相比，本专利技术的优点和积极效果是：本专利技术通过设计新的保种分配方案，将多个测试家系进行分组，以分组为单位进行分配养殖和保种测试，有效剖分出了个体的直接遗传效应和间接遗传效应，根据直接遗传效应和间接遗传效应获得的目标性状值充分利用了个体间的遗传变异，准确度高、结果可靠、遗传进展性强，有助于降低后续鱼虾选择育种过程中个体间竞争和提高选择育种准确度。结合附图阅读本专利技术的具体实施方式后，本专利技术的其他特点和优点将变得更加清楚。附图说明图1是本专利技术鱼虾多家系多分组保种方法一个实施例的流程图。具体实施方式为了使本专利技术的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下将结合附图和实施例，对本专利技术作进一步详细说明。请参见图1，该图所示为本专利技术一种鱼虾多家系多分组保种方法一个实施例的流程图。具体而言，是对凡纳滨对虾采用多家系多分组保种的一个实施例。如图1所示，该实施例的方法包括如下的步骤：步骤1：确定测试池数量。确定进行测试的测试家系的数量f，设置与测试家系数量相等的测试池t＝f。凡纳滨对虾是目前我国养殖产量最高的对虾品种，年养殖产量超过120万吨，占我国对虾养殖总产量的80％以上。目前我国凡纳滨对虾种质主要引自美国，国内商品苗种多为二代苗种或者多代自繁苗种。凡纳滨对虾产卵量大，苗种累代养殖后可能会产生近交衰退现象。当前我国养殖的凡纳滨对虾已经出现了发病率与死亡率上升、生长速度下降、规格参差不齐、形态畸形等种质衰退的现象。培育生长快、抗逆性强的新品种(系)是当前凡纳滨对虾产业可持续发展亟待解决的关键问题。收获体重一直是凡纳滨对虾遗传改良的主要目标性状。利用凡纳滨对虾2012G1代核心群性腺发育成熟的亲虾，通过人工授精技术，每个家系2-3尾雄虾与来自不同家系的2-3个雌虾配对，建立了105个全同胞家系。每个家系在一个单独的170L圆通内养殖，幼体饵料由角毛藻、虾片、螺旋藻、卤虫和配合饲料组成，每4小时投喂一次，投喂量和投喂比例根据对虾不同发育阶段进行调整。每天换水，换水量逐渐增加，仔虾阶段换水量达到100％。凡纳滨对虾体长达到3cm时候，对每个本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鱼虾多家系多分组保种方法，其特征在于，所述方法包括：确定测试池数量：确定所有测试家系的数量f，设置与所述测试家系数量相等的测试池t＝f；测定测试家系的目标性状值：将每个所述测试家系中的个体等分为g个分组，每个分组包含k尾个体，测定并记录所述每个分组内每尾个体的目标性状值，计算每个分组内所有个体的目标性状平均值并记录；家系分配：将所有所述测试家系的所有分组内的个体以分组为单位、按照下述限定条件分配到所述测试池中：每个所述测试家系的g个分组分别分配到g个不同的测试池中，每个所述测试池均包括有g个不同家系的分组，任意两个所述测试家系在每个所述测试池中同时出现的次数不大于1；每个所述测试池内所有g个所述测试家系的家系目标性状变异系数不大于f个所述测试家系的家系目标性状变异系数和/或每个所述测试池内的所有个体的个体目标性状变异系数不大于f个所述测试家系内的所有个体的个体目标性状变异系数；每个所述测试池内所有g个所述测试家系间的亲缘系数平均值不大于f个所述测试家系间的亲缘系数平均值；所述个体目标性状变异系数为相关个体目标性状值的标准差除以相关个体目标性状平均值，所述家系目标性状变异系数为相关家系目标性状值的标准差除以相关家系目标性状平均值，家系目标性状值为该家系内相关个体目标性状值的平均值；测试池养殖测试家系：将按照上述限定条件分配到测试池中的测试家系进行养殖，达到指定养殖要求；测定达到指定养殖要求的存活家系的目标性状值：达到指定养殖要求后，测定并记录每个所述测试池内存活个体的目标性状值；计算存活个体的直接遗传效应值和间接遗传效应值：依据上述家系分配分案、所述存活个体的目标性状值和所述存活个体的系谱信息建立线性混合效应模型，利用最佳线性无偏预测法计算每个所述存活个体的直接遗传效应值和间接遗传效应值；计算综合选择指数：按照公式计算每个所述存活个体的综合育种值，按照公式计算每个所述存活个体的个体综合选择指数；对属于同一家系的存活个体的个体综合选择指数求平均值，获得家系综合选择指数；其中，Ti表示第i个存活个体的综合育种值，表示第i个存活个体的直接遗传效应值，表示第i个存活个体的间接遗传效应值,Ii表示第i个存活个体的个体综合选择指数，表示所有存活个体综合育种值的平均值，表示所有存活个体综合育种值的标准差；选择留种家系和留种个体：根据所述家系综合选择指数从高到低依次选择一定数量的家系作为留种家系，从留种家系内根据所述个体综合选择指数从高到低依次选择一定数量的存活个体作为留种个体。...

【技术特征摘要】
1.一种鱼虾多家系多分组保种方法，其特征在于，所述方法包括：
确定测试池数量：确定所有测试家系的数量f，设置与所述测试家系数量
相等的测试池t＝f；
测定测试家系的目标性状值：将每个所述测试家系中的个体等分为g个分
组，每个分组包含k尾个体，测定并记录所述每个分组内每尾个体的目标性状
值，计算每个分组内所有个体的目标性状平均值并记录；
家系分配：将所有所述测试家系的所有分组内的个体以分组为单位、按照
下述限定条件分配到所述测试池中：每个所述测试家系的g个分组分别分配到
g个不同的测试池中，每个所述测试池均包括有g个不同家系的分组，任意两
个所述测试家系在每个所述测试池中同时出现的次数不大于1；每个所述测试
池内所有g个所述测试家系的家系目标性状变异系数不大于f个所述测试家系
的家系目标性状变异系数和/或每个所述测试池内的所有个体的个体目标性状
变异系数不大于f个所述测试家系内的所有个体的个体目标性状变异系数；每
个所述测试池内所有g个所述测试家系间的亲缘系数平均值不大于f个所述测
试家系间的亲缘系数平均值；所述个体目标性状变异系数为相关个体目标性状
值的标准差除以相关个体目标性状平均值，所述家系目标性状变异系数为相关
家系目标性状值的标准差除以相关家系目标性状平均值，家系目标性状值为该
家系内相关个体目标性状值的平均值；
测试池养殖测试家系：将按照上述限定条件分配到测试池中的测试家系进...

【专利技术属性】
技术研发人员：栾生，罗坤，孔杰，孟宪红，曹宝祥，刘宁，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院黄海水产研究所，
类型：发明
国别省市：山东;37