【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于临床决策支持的途径可视化
本专利技术申请具体应用于临床决策支持系统。然而，应当意识到，描述的技术也可以适用于其他诊断系统、其他医学方案或其他临床技术。
技术介绍
肿瘤学中的诊断和治疗决策很大程度上基于基础生物学。理解疾病的机理在癌症研究中起重要作用，但是也可以帮助临床医师做出决策并且跟踪疾病的发展。 当前，下一代测序正接近于用来提供以前不能被临床医师访问以用于对特定疾病的诊断和预后的信息的革命。这种信息的深度和解析度两者创建了大量的数据。以前经研究的分子特征典型地并不明确地捕捉基础细胞机理(途径)，并且因此它们解释真正根本原因的能力和创建对如何处置患者的理解的能力被限制在可用治疗选择的领域内。生物学途径是呈现这种信息的直观方式。已有的方法集中在计算如何在特定的临床问题的背景中对途径和它们的反常进行评级。 在当前实践中，基于临床病理学数据，响应于治疗或选择治疗来将诊断出具有癌症的患者分成(例如根据癌症发展或复发的时间)确定预后的组，等等，但是分组的基础典型地被呈现为标记或临床数据的表格或列表。再者，通过对特征的集合的统计选择基于高通量...
【技术保护点】
一种使用定义与基因表达、基因活性水平和信息流相关联的视觉元素的视觉语法(230)来帮助将基因活性途径可视化以用于临床决策支持的系统(10)，包括：验证途径数据库，其存储多个验证途径，所述多个验证途径中的每个使用所述视觉语法来描述多个基因之间的至少一个交互作用；以及处理器(18)，其被配置为执行存储在存储器(16)中的计算机可执行指令，所述指令包括：视觉表示跨多个群体的至少一个基因的基因活性水平(28)；从所述验证途径数据库(30)检索途径(32)，其中，所述途径包括所述至少一个基因；视觉表示所述途径中的所有基因的基因活性水平(34)；通过所述途径中的基因之间的交互作用来视觉...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2012.04.02 US 61/618,8921.一种使用定义与基因表达、基因活性水平和信息流相关联的视觉元素的视觉语法(230)来帮助将基因活性途径可视化以用于临床决策支持的系统(10)，包括: 验证途径数据库，其存储多个验证途径，所述多个验证途径中的每个使用所述视觉语法来描述多个基因之间的至少一个交互作用；以及 处理器(18)，其被配置为执行存储在存储器(16)中的计算机可执行指令，所述指令包括: 视觉表示跨多个群体的至少一个基因的基因活性水平(28)； 从所述验证途径数据库(30)检索途径(32)，其中，所述途径包括所述至少一个基因； 视觉表示所述途径中的所有基因的基因活性水平(34)； 通过所述途径中的基因之间的交互作用来视觉表示信息流(36)； 将所述信息流(36)的所述视觉表示链接到针对临床医生的可行动信息(42)； 向所述临床医生输出所述信息流的所述视觉表示和被链接的可行动信息。2.如权利要求1所述的系统，其中，所述多个群体包括正常群体、肿瘤群体和当前患者。3.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括: 对跨所述多个群体的所述至少一个基因的基因活性水平进行颜色编码，使得由不同的颜色来表示各个群体。4.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括: 对跨所述多个群体的所述至少一个基因的基因活性水平进行纹理编码，使得由不同的纹理来表示各个群体。5.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括: 视觉表示温度图形，所述温度图形根据正常群体的平均基因活性水平和肿瘤群体平均基因活性水平来示出患者中的所述至少一个基因的基因活性水平。6.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括: 使用包括闪光和移动中的至少一个的时间方面来视觉表示基因活性，其中，闪光和移动中的所述至少一个的频率与所述基因活性水平成比例。7.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，所述可行动信息包括用于处置所述患者的至少一个治疗规划。8.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，所述基因活性水平包括以下中的一个或多个的活性水平: 所述基因内的突变的数量； 所述基因的复制的数量； 基因表达水平； 所述基因的蛋白质表达水平； 基因座的DNA甲基化水平； 基因座的组织蛋白甲基化水平； 基因座的组织蛋白乙酰化水平；以及 由所述基因编码的特定蛋白质的磷酸化。9.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括: 使用色相-饱和度-亮度(HSB)空间中的视觉颜色来视觉表示基因活性水平，其中，不同的基因活性水平被分配有不同的视觉颜色，并且其中，使用连续函数来生成所述视觉表/Jn ο10.如权利要求9所述的系统，其中，定义所述连续函数使得给定的基因具有r=[a，b]的值的范围，其中，值被分配在所述HSB空间中，并且对于每个点ri e [a，b]，选择函数以按照Iii = f (T1)来映射所述值。11.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，应用到当前患者的治疗方案中的至少一种药物在所述患者中具有抗血管生成作用，并且其中，所述可视化途径与血管生长相关。12.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，所述信息流根据所述途径中过表达、抑制和基准表达基因中的一个或多个的可能性来描述在所述途径中捕捉到的基因之间的交互作用，并且其中，所述指令还包括确定所述途径中的所述交互作用中的一个或多个是否已经被激活。13.如权利要求12所述的系统，所述指令还包括生成省略了节点表示并且强调了整个所述途径(222)上的所述信息流的视觉表示(220)。14.一种具有存储在其上的计算机可读指令的非瞬态计算机可读存储介质，所述计算机可读指令用于使用定义与基因表达、基因活性水平和信息流相关联的视觉元素的视觉语法(230)来将基因活性途径可视化以用于临床决策支持，所述指令包括: 视觉表示跨多个群体的至少一个基因的基因活性水平(28)； 从验证途径数据库(30)检索途径(32)，其中，所述途径包括所述至少一个基因； 视觉表示所述途径中的所有基因的基因活性水平(34)； 通过检索出的途径中的基因之间的交互作用来视觉表示信息流(36)； 将所述信息流(36)的所述视觉表示链接到针对临床医生的可行动信息(42)； 向所述临床医生输出所述信息流(36)的所...
【专利技术属性】
技术研发人员：N·迪米特罗娃，A·亚内夫斯基，N·班纳吉，V·瓦拉达恩，S·卡玛拉卡兰，
申请(专利权)人：皇家飞利浦有限公司，
类型：发明
国别省市：荷兰;NL
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