一种用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物及其应用,包含CDK5调节亚基相关蛋白1类似物1SNPrs7756992，电压门控钾通道的KQT类亚家族成员1SNPrs2237892，胰岛素样生长因子2mRNA结合蛋白SNPrs4402960三种SNPs的引物.通过使用本发明专利技术的引物组合检测DNA中这三种单核苷酸多态性的存在可以判断出高风险人群，从而帮助他们调节生活习惯，降低患二型糖尿病的风险，同时定时监控，提早发现二型糖尿病症状，有益治疗。
【技术实现步骤摘要】
-种用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物及其应用
[〇〇〇1] 本专利技术属于生物领域，涉及一种用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物及其应用。
技术介绍
二型糖尿病是糖尿病中最常见的，其主要症状有高血糖，不同程度的胰岛素抵抗， 和胰岛素分泌功能受损。二型糖尿病会给患者带来各种生活不便，例如口渴，无力，视力下 降等。血液中过高的血糖浓度对血管和器官会造成伤害，引起各种并发症，对患者造成较大 痛苦。其发病原因中有环境因素，生活方式因素，年龄因素等，基因也是其中一个重要原因。 目前糖尿病的确定诊断以血糖水平为依据。但是等到血糖水平异常升高到确诊标 准时，往往为时已晚。作为一种慢性代谢性紊乱病症，二型糖尿病也是长期内分泌失调的结 果，其发病过程中伴随着一系列的激素异常，而此类异常往往发生在血糖异常出现之前。发 掘早于血糖指标的早期指标能为预防和治疗糖尿病争取宝贵的时间，也因此成为对抗糖尿 病的关键。 SNP 全称为 Single-nucleotide polymorphism，单核昔酸多态性。SNPs 是最常见 的基因突变。每一个SNP代表一个核苷酸的不同。大多数时候SNPs出现在编码基因之间， 这可以帮助研究人员定位编码基因。但是，当SNP出现在编码基因当中时有可能对基因的 功能造成一定影响。研究已经发现，SNPs可以影响到一个人对药物的反应,感染某些疾病 的可能性，比如，心脏病，癌症和糖尿病。 近年来，研究已经发现了多种SNPs与二型糖尿病相关。不过，这些研究更多的是 针对欧美人种。在基于中国人遗传背景的研究中，二型糖尿病相关SNP多以单个形式被报 道，并未建立起相关模型。由于二型糖尿病是一种慢性代谢紊乱症，与多种蛋白质功能失常 相关，以单个SNP来检测二型糖尿病风险准确性偏低。为了弥补这一缺陷，通过同时检测这 三种易感基因，本专利技术可以提供更加准确的个体化二型糖尿病患病的危险性评估，从而安 排具体干预措施，通过生活方式上的适度调整（增加每天的身体运动，同时削减热量的摄 入）显著地减少或者延缓糖尿病的发生，降低糖尿病治疗成品。
技术实现思路
解决的技术问题： 本专利技术主要目的是提供一种可以用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物组合。 本专利技术的另一目的是提供上述SNPs引物在制备检测二型糖尿病风险的试剂盒上 的应用。 本专利技术的另一目的是提供用于检测二型糖尿病风险的试剂盒。[〇〇1〇] 技术方案： -种用于检测_型糖尿病风险的SNPs引物，包含⑶K5调节亚基相关蛋白1 类似物1(CDKAL1)SNP rs7756992,电压门控钾通道的KQT类亚家族成员1(KCNQ1)SNP rs2237892,胰岛素样生长因子2mRNA结合蛋白（IGF2BP2) SNP rs4402960三种SNPs的引物。 所述rs7756992 的引物如 SEQ ID NO. 13 和 SEQ ID NO. 14 所示；rs2237892 的引物 如 SEQ ID NO. 15 和 SEQ ID NO. 16 所示；rs4402960 的引物如 SEQ ID NO. 7 和 SEQ ID NO. 8 所示。 所述的用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物在制备检测二型糖尿病风险的试剂 盒中的应用。 一种用于检测二型糖尿病风险的试剂盒，该试剂盒用于检测DNA中CDK5调节 亚基相关蛋白1类似物1(⑶KAL1)SNP rs7756992,电压门控钾通道的KQT类亚家族成员 1(KCNQ1)SNP rs2237892,胰岛素样生长因子 2mRNA 结合蛋白（IGF2BP2)SNP rs4402960 三 种 SNPs。 所述的用于检测二型糖尿病风险的试剂盒，试剂盒中含有CDK5调节亚基相关蛋 白1类似物1 (CDKAL1) SNP rs7756992,电压门控钾通道的KQT类亚家族成员1 (KCNQ1) SNP rs2237892，胰岛素样生长因子2mRNA结合蛋白（IGF2BP2) SNP rs4402960三种SNPs的引物。 所述的用于检测二型糖尿病风险的试剂盒，试剂盒中含有rs7756992的引物如 SEQ ID N0. 13 和 SEQ ID N0. 14 所示；rs2237892 的引物如 SEQ ID N0. 15 和 SEQ ID N0. 16 所示；rs4402960 的引物如 SEQ ID NO. 7 和 SEQ ID NO. 8 所示。 所述的用于检测二型糖尿病风险的试剂盒，该试剂盒还包括PCR反应中常用的酶 和/或试剂。 本专利技术所述的SNPs引物筛选过程包括以下步骤（图1)。 1)建立统一标准的标本库和数据库：以标准操作程序（S0P)从医院采集的血液样 本，系统收集完整的人口学资料和临床资料，患其他类型糖尿病患者不被包括在内。 2)根据现有文献，筛选出11种二型糖尿病相关SNP钾离子内向整流通道蛋 白Jll (KCNJ11) SNP rs5219 (E23K变异），过氧化物酶体增殖物激活受体-γ (PPARG) SNP rsl801282(P12A变异），转录因子7类似物2(TCF7L2)SNP rs7903146,胰岛素样生长因 子2mRNA结合蛋白（IGF2BP2)SNP rs4402960, CDK5调节亚基相关蛋白1类似物1 (CDKAL1) SNP rs7756992,锌转运蛋白 8(SLC30A8)SNP rsl3266634,同源框转录因子（HHEX)SNP rsllll875,肝细胞核因子1β (HNFIP)SNP rs4430796,电压门控钾通道的KQT类亚家族成 员 1(KCNQ1)SNP rs2237892, Wolfram 综合征 I 型基因（WFSl)SNP rsl0010131，细胞周期蛋 白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B) SNP rs 10811161进行分析。 3)使用全血基因组DNA提取试剂盒（BioTeke，China)提取样本中的DNA。 4)根据发布的SNP序列设计引物并使用PCR Master Mix (Tiangen Biotech, China)提取相关 SNPs。 5)提纯聚合酶链反应产物，使用ABI PRISM3730xl(Applied Biosystems，California，USA)确定序列。并使用 Chromas software version2.0(Gene Codes Corporation, USA)分析所得结果。 6)使用 SAS9. 2 (SAS Institute Inc.，Cary, NC, USA)进行数据分析，主要步骤如 下： a)使用Chi-square test来分析比较二型糖尿病组与正常对照组的等位基因频 率，p〈0. 05被视为差异有统计学意义。 b)精确检验的近似检验法被用于分析SNP的Hardy-Weinberg equilibrium(HWE)〇 c)基于显性模型，Logistic regression analysis被应用于每一个符合 Hardy-Weinberg equilibrium的SNP，ρ〈0· 05被视为差异有统计学意义。 d)基于多变量模型，multi-SNP logistic r本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物，其特征在于包含CDK5调节亚基相关蛋白1类似物1 SNP rs7756992，电压门控钾通道的KQT类亚家族成员1 SNP rs2237892，胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白 SNP rs4402960三种SNPs的引物。
【技术特征摘要】
1. 一种用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物，其特征在于包含CDK5调节亚基相关蛋 白1类似物1 SNP rs7756992,电压门控钾通道的KQT类亚家族成员1 SNP rs2237892,胰 岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白SNP rs4402960三种SNPs的引物。2. 根据权利要求1所述所述用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物，其特征在于所述 rs7756992 的引物如SEQIDN(λl3和SEQIDN(λl4所示；rs2237892 的引物如SEQID NO. 15 和 SEQ ID NO. 16 所示；rs4402960 的引物如 SEQ ID NO. 7 和 SEQ ID NO. 8 所示。3. 权利要求1或2所述的用于检测二型糖尿病风险的SNPs引物在制备检测二型糖尿 病风险的试剂盒中的应用。4. 一种用于检测二型糖尿病风险的试剂盒，其特征在于该试剂盒用于检测DNA中CDK5 调节亚基相关蛋白1类似物1 SNP rs7756992,电压门控钾通道的KQT类亚家族成员...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘宁生，
申请(专利权)人：南京医科大学，刘宁生，
类型：发明
国别省市：江苏;32
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