一种筛选和鉴定miRNAs所调控的基因的方法技术

技术编号:10503746 阅读:107 留言:0更新日期:2014-10-08 09:37
本发明专利技术建立了一种直接筛选和鉴定出miRNAs调控的基因组DNA的方法。该方法是将生物素标记到研究的目的miRNAs上,利用生物素和链霉亲和素之间的亲和力将生理状况下与生物素标记的miRNAs靶向结合在一起的基因组DNA分离和纯化出来,然后将分离纯化的DNA进行克隆和测序获得DNA序列信息,通过生物信息学分析DNA序列所在的基因位置和基因名称,获得调控基因组DNA的miRNAs的所有靶标基因。通过本发明专利技术建立的方法可以应用到所有靶向基因组DNA的miRNAs的功能研究。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及,为miRNAs的功能研究 中寻找其调控的可能靶基因提供了一种简单、实用的方法。
技术介绍
miRNAs是一类由大约19-23个碱基组成的单链RNA分子,是一种不能编码蛋白质 但是具有重要调控作用的小RNA。成熟的miRNA通过碱基互补配对可以结合到靶基因的相 关序列上面,现在已知报道的结合位点可以位于基因 mRNA的3'和5'非翻译区,也可能位于 基因的启动子区域。现在已知miRNAs在包括细胞分化、凋亡、增殖、发育、造血和肿瘤等多 种生命活动中具有重要的调控功能。由于miRNA发挥调控生命活动的作用是通过与调控靶 基因的表达实现的,所以对于miRNAs革E基因的寻找和确定对于miRNAs的功能研究具有重 要的意义。但是由于miRNAs和靶基因之间的互补结合可以通过碱基的不完全匹配,因此一 个miRNA可能会调控很多种的祀基因,所以导致miRNAs的寻找十分困难。现在对于miRNAs 靶基因的寻找主要是通过生物软件的预测,但是生物软件预测具有不真实性、假阳性率较 高、工作量太大等缺陷,所以使用实验方法直接分离和筛选出miRNAs调控的靶基因具有了 本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种筛选和鉴定miRNAs所调控的基因的方法,其特征在于包括:(1)将miRNAs与靶基因组DNA互补结合的RNA链进行生物素标记,转染细胞后,利用甲醛将miRNAs和与之结合的DNA、蛋白交联在一起;(2)将生物素标记的miRNAs以及结合在一起的DNA进行Streptavidin‑Biotin亲和沉淀分离和纯化;(3)通过克隆和测序鉴定分离纯化出来的DNA序列,鉴定出miRNAs调控的靶基因。

【技术特征摘要】
1. 一种筛选和鉴定miRNAs所调控的基因的方法,其特征在于包括: (1) 将miRNAs与靶基因组DNA互补结合的RNA链进行生物素标记,转染细胞后,利用甲 醛将miRNAs和与之结合的DNA、蛋白交联在一起; (2) 将生物素标记的miRNAs以及结合在一起的DNA进行Streptavidin-Biotin亲和沉 淀分离和纯化; (3) 通过克隆和测序鉴定分离纯化出来的DNA序...

【专利技术属性】
技术研发人员:向双林魏科颜峰胡翔张健
申请(专利权)人:湖南师范大学
类型:发明
国别省市:湖南;43

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