本发明专利技术属于分子标记制备技术领域，具体涉及一种与猪妊娠期长短性状相关的SNP遗传标记的制备与关联分析。从猪COX1基因中克隆获得一种作为遗传标记应用的猪妊娠期长短性状相关的基因片段，其核苷酸序列如图4所示，在图4所示序列的452bp处有一个等位基因突变（碱基替换），该突变导致Bg?II-RFLP多态性。本发明专利技术还公开了制备猪妊娠期长短性状遗传标记的方法及其在猪妊娠期长短性状多态性检测中的应用。本发明专利技术的标记可应用于猪的标记辅助选择上。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于猪相关遗传标记（分子标记）制备
，具体涉及一种与猪妊娠期长短性状相关遗传标记。
技术介绍
繁殖性状是猪的重要经济性状之一，是我国地方猪优良品种最具特色和国际竞争力的经济性状。提高猪繁殖率可降低养猪生产成本，提高生产经济效益，促进我国养猪业持续发展。 妊娠期是指从配种受孕至分娩这段时间，是母猪的一个重要繁殖性状，与其它繁殖性状特别是初生重、产仔数关系密切。母猪的妊娠期为108～120天，平均114天，不同个体间差异较大。一般来说，青年母猪的妊娠期比经产母猪短；产仔数少的比产仔数多的妊娠期长。妊娠期短，则可以缩短母猪的繁殖周期，提高其生产能力。列为国家级重点保护目录的清平猪妊娠期短，平均为111.43±0.07天，初产母猪110.69天，经产母猪为111.06-111.51天，与一般猪种妊娠期总体均值的差异极显著。 对猪妊娠期的研究主要涉及其影响因素、与其它繁殖性状的关系、QTL定位等方面，相关遗传分子基础报道较少。母猪妊娠期的长短主要受品种遗传的影响，中等遗传力(0.47)，与总产仔数、活产仔数等存在一定程度的相关。如能筛选到一种早期的遗传分子标记，应用后则能在提高产仔数的同时亦能缩短妊娠期，提高经济效益。Wilkie等（1999）利用梅山猪×大约克夏猪资源家系，采用119个微卫星标记对18条常染色体进行基因组扫描，发现9号染色体上135cM处存在控制猪妊娠期的QTL，位于微卫星标记SWl74和SWl651之间，并估计该QTL加性效应为1.52±0.44d，显性效应为-2.34±0.75d，均达到了极显著水平；同时发现在15号染色体和1号染色体上也分别存在控制妊娠期的QTL，分别位于96和166cM处，并估计加性效应分别为1.86±0.54d和1.18±0.55d(Wilkie et al.A genomic scan of porcine reproductive traits reveals possible quantitative trait loci(QTLs)for number of corpora lutea.Mamm Genome,1999,10(6):573-578.)。动物分娩意味着妊娠的终止，分娩的启动直接决定妊娠期的长短，而分娩的启动受多种因素的影响，内分泌激素（如前列腺素、促肾上腺皮质激素释放激素）起关键作用。在前列腺素(prostaglandin，PG)的合成过程中，环氧合酶(cyclooxygenase，COX)发挥着关键的作用。COX又称前列腺素H合成酶(prostaglandin H synthase，PGHS)或前列腺素内过氧化物合成酶(prostaglandin endoperoxidesynthase,PTGS)，介导由花生四烯酸(arachidonicacid，AA)合成PG的起始步骤（Crofford L.COX-1 and COX-2 tissue expression:implications and predictions.The Journal of rheumatology,1997,49:15-19）。COX通过催化合成PG影响卵泡发育、排卵、胚胎着床、子宫内膜蜕膜化、黄体形成、退化以及分娩等雌性哺乳动物生殖的多个环节。 综合考虑基因定位信息和该基因所表达蛋白在机体内的生理生化功能，COX1基因成为我们的候选基因。COX1是一种组成型酶，人的COX1基因位于染色体9q32-q33.3上，由11个外显子和10个内含子组成，其mRNA转录产物为2.7kb。具有一段26个氨基酸长的信号肤，剪切后的COX1具有576个氨基酸残基，分子量约为65500D。小鼠、人和绵羊的COX1氨基酸序列相似性为90％，最大差异在于信号肤和紧接C末端内质网停靠信号的12个氨基酸残基。猪的COX1基因也由11个外显子和10个内含子组成。COX1在大多数组织中微量恒定表达，产生具有生理作用的前列腺素，参与维持机体正常的生理功能，如保护胃粘膜，维持肾脏血流等(Jarving,et al.On the evolutionary origin of cyclooxygenase(COX)isozymes:characterization of marine invertebrate COX genes points to independent duplication events in vertebrate and invertebrate lineages.2004,J Biol Chem,279(14):13624-13633)。
技术实现思路
本专利技术的目的在于获得一个与猪妊娠期长短性状相关的遗传标记，通过克隆猪COX1基因的特异DNA片段，并经关联分析，得到一个用于猪妊娠期长短性状检测的遗传标记，该标记属于一种新的标记，可以应用于猪的标记辅助选择的关联分析中。 本专利技术通过下列技术方案实现： 申请人通过筛选，得到一个用于检测猪妊娠期长短性状的遗传标记，该标记的核苷酸序列如下所示： GTGCCAGCACCAGGGTATCTGTGTCCGCTTTGGCCTTGACCGCTACCAGTGTGACTGCACCCGCACGGGCTACTCTGGCCCCAACTGCACCATCCGTGAGCTCGGCCTCCAGTCCCCACTCCTTCTCCCCTGGGCTCATCCCCCAAGACACCTACTTCCTACCCTTCTCTCTGGCTGGGACCCCTCTTCCCTTTCTTTGCCTGCCTTTGACCTCTGACACGACCCCTGACCTGGCTCCAGCACAAGCCGTCACTCCTGGCCAGCTCAGTCCATGTGCCTCTGGGCTCTGTGGTGAGTCTTCACCACCCAGGCCTGACCTCAGGGACCTCGTTCTCTGGTCCTGGCCCCTGTCCTCACGTCTGGTTCTGGCTCTGTCATGTGTCATCACTCCCAAGGTTCTGTCCTGACCTGTCCCGGTCCCCATCTTCCACCCTGGCTATTCCTTGGTCCTRCCAAGGGGGCCCAACTGAGCGGCTCCCACTGCCCCCGCAGCTGAGCTGTGGACCTGGCTCCGGACTTCTTTGCGGCCCAGCCCCTCTTTCTTCCACTTCCTGCTGACGCAT 在上述基因片段（序列）中的所示的“R”（即第452bp处的等位基因的突变）是A或G，，该突变导致Bg II-RFLP多态性。 申请人设计了一种扩增猪COX1基因和检测该基因片段突变的引物对，该引物对的DNA 序列如下所示： 正向引物：GTGCCAGCACCAGGGTAT， 反向引物：ATGCGTCAGCAGGAAGTG。 我们建立了一种筛选如猪猪妊娠期长短性状相关的遗传标记的方法，该方法包括以下步骤： 从猪血液中提取基因组DNA，根据猪COX1基因序列设计引物，该引物对的DNA序列如序列表SEQ ID NO：2和SEQ ID 本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一个与猪妊娠期长短性状相关的遗传标记，其核苷酸序列如下所示：
GTGCCAGCACCAGGGTATCTGTGTCCGCTTTGGCCTTGACCGCTACCAGTGTGACTGCACCCGCACGGGCTACTCTGGCCCCAACTGCACCATCCGTGAGCTCGGCCTCCAGTCCCCACTCCTTCTCCCCTGGGCTCATCCCCCAAGACACCTACTTCCTACCCTTCTCTCTGGCTGGGACCCCTCTTCCCTTTCTTTGCCTGCCTTTGACCTCTGACACGACCCCTGACCTGGCTCCAGCACAAGCCGTCACTCCTGGCCAGCTCAGTCCATGTGCCTCTGGGCTCTGTGGTGAGTCTTCACCACCCAGGCCTGACCTCAGGGACCTCGTTCTCTGGTCCTGGCCCCTGTCCTCACGTCTGGTTCTGGCTCTGTCATGTGTCATCACTCCCAAGGTTCTGTCCTGACCTGTCCCGGTCCCCATCTTCCACCCTGGCTATTCCTTGGTCCTRCCAAGGGGGCCCAACT...
【专利技术属性】
技术研发人员：柴进，蒋思文，彭建，刘高雯，郑嵘，彭永东，王丹，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：
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