一种用于检测ALK基因不含重复序列的FISH探针、试剂盒及其检测方法技术

技术编号:9378442 阅读:418 留言:0更新日期:2013-11-27 20:58
本发明专利技术属于生物技术领域,公开了一种用于检测ALK基因不含重复序列的荧光原位杂交探针、试剂盒及其检测方法。以人工构建的基因序列或者大小为30~1000kb的ALK基因为模板,对ALK基因中的非重复序列进行聚合酶连反应,扩增产物为350~800碱基对大小不等的DNA片段,消除ALK基因中的重复序列,从而形成不含重复序列的产物,产物经过荧光标记后获得ALK基因不含重复序列荧光原位杂交探针,用于ALK基因荧光原位杂交检测。本发明专利技术获得的ALK基因荧光原位杂交探针可消除重复序列,显著降低ALK基因荧光原位探针的非特异性背景信号,提高荧光原位杂交探针的特异性。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种用于检测ALK基因不含重复序列的FISH探针,其特征在于,所述FISH探针DNA以ALK基因为模板,利用78对PCR引物组或与引物组具有同一性的核苷酸序列,进行PCR扩增反应制备得到,所述78对PCR引物组为:1F:5“ACTGTTGTTCCACCCAAGATG3“1R:5“ACCAGGCTGTTCCAAGTATGA3“2F:5“GGAAGATACACCCAATCC3“2R:5“AACCTCCTCCACTACCTC3“3F:5“TGCCAGGTAGTCACATCAT3“3R:5“AGGCCACATTCCTAAACA3“4F:5“ACCCTTTGTATTCTTCTTCATCTTG3“4R:5“GCCTTTTAGTAGTCCTTCCAGTG3“5F:5“GGGATGGCTGCTGCTCTT3“5R:5“GATGCTGCCTGGGAAACAA3“6F:5“GAGTCAAAGAATGCTGGGTA3“6R:5“CTTCCTTGGAGGATAAACA3“7F:5“CGATTTCTGTGCCTCTTG3“7R:5“GCTCTGCTCTGCCTACCT3“8F:5“GAGGTCATTGTAAGGAGGAT3“8R:5“AGGTCAGCACATGCCACT3“9F:5“ATGTAGTCAAGGCAGGTTTC3“9R:5“CAAGCGTTAAGGGTTAGG3“10F:5“GCAGGCTGGAAATCTATG3“10R:5“TCCCACTGGAAGGGTTAT3“11F:5“CTGGGCAGGCTGCTTATC3“11R:5“GTGGCACAGAGTTTGTTTCC3“12F:5“TTCGGGAGAAGGCACAAT3“12R:5“CAAGGGCAAAGCCAGCAA3“13F:5“TAATGCTTTGCTGGTCTG3“13R:5“AGGGCTCTTAAATTGGTC3“14F:5“TAGGGCTGGAAAGGTGATGG3“14R:5“TGGCTCTGGCTTGCTGAA3“15F:5“TGCCTATGTGCCACCCTC3“15R:5“CAGCCTGTTAGTGCTCCAAG3“16F:5“GGCAGATGTGGATGCTGTAGA3“16R:5“TGAGGGGAATTAGGGAGTGG3“17F:5“AGGAACAAGCCCTGAGAC3“17R:5“CTTAGACAACCCGACCAC3“18F:5“CAGCCTAAGTTGTTTGTTCC3“18R:5“TTCCGATTGCTCTATGTTTCA3“19F:5“CCAGGGAAATCCTCAGAACA3“19R:5“ATGGCATCCGCAGCAATC3“20F:5“ACCGTTCATCACCCATCA3“20R:5“TTCTATCCCACCCTCTACC3“21F:5“GACCAAGGGCTACAAGTT3“21R:5“GGAGGCAAGGAGAATACA3“22F:5“CTGCTGACTGTATTTTGGTGCT3“22R:5“GCTAGGGAGTTGGAGGGATTA3“23F:5“AGGGCTTAGCACCATTCG3“23R:5“AACTCTGCCTCCCACATC3“24F:5“GGTTCTGAAGAGGAGGCA3“24R:5“AGGATAGTGGTGTTGAGGC3“25F:5“ATAAAGTAGGGATGGAGGC3“25R:5“ATAGGGAGCTGAGGGAAT3“26F:5“CGTTGCCAGGAACAAGAAAG3“26R:5“CCACAAAAGGGGAATAGGGA3“27F:5“ACTCATCATTAGCCACCCATTT3“27R:5“GGTCATCCCCAACTTCAACAT3“28F:5“AGGCTGTGAGTCTGAGGT3“28R:5“AGCTTTCCCAGTTCTTCC3“29F:5“ATTCCACCAAGTCACCAT3“29R:5“AAGACTGCCCAGAAAGAT3“30F:5“ACTAACAGGCAGGCAGAA3“30R:5“AACTTGAGATACTTGGAGGG3“31F:5“GAGTCTCCAACGGTGTTC3“31R:5“TTACATCCTCCCACAAAA3“32F:5“TATGCCTGGCTGTGACTC3“32R:5“TGTGCCCACTACTGACCC3“33F:5“TTCGGGAGCATTGATTGG3“33R:5“CGACTTGGGACTTGACACC3“34F:5“CTGGTAGTCAGGCATTGTGG...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:程弘夏叶伦薛力泉李雪梅付金玲陈刚
申请(专利权)人:武汉康录生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:

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