一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法技术

技术编号:9060864 阅读:566 留言:0更新日期:2013-08-21 23:57
本发明专利技术涉及一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法,包括:(1)获取G蛋白偶联受体序列数据及相应的球蛋白数据,对数据集进行去冗余处理,采用二肽组成表示G蛋白偶联受体,采用最近邻算法构建分类器,建立7水平分层分类模型;(2)对待识别G蛋白偶联受体进行识别和分类。本发明专利技术能够方便、快捷地对G蛋白偶联受体进行识别和分类,具有较高的预测准确率,性能稳定可靠;本发明专利技术适合于大规模识别生物蛋白质组中的G蛋白偶联受体,并能将G蛋白偶联受体分配至具体的亚型,在G蛋白偶联受体的功能分类研究中具有很好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法,包括:(1)获取G蛋白偶联受体序列数据及相应的球蛋白数据,对数据集进行去冗余处理,采用二肽组成表示G蛋白偶联受体,采用最近邻算法构建分类器,建立7水平分层分类模型;(2)对每条待识别的蛋白序列进行判别分析,若待识别蛋白被判别为球蛋白,则分类过程结束;若判别为G蛋白偶联受体,则自动进入下一层,进行功能家族分类;若待识别蛋白被判别为味觉受体家族,则分类过程结束;若判别为其他家族,则进行子家族分类;完成子家族分类之后,进一步细分至具体类型;最终根据训练样本将待识别蛋白分至具体亚型。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:贺佳高青斌
申请(专利权)人:中国人民解放军第二军医大学
类型:发明
国别省市:

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