一种调控辣椒青果紫色基因标记的开发与应用制造技术

技术编号:20885743 阅读:14 留言:0更新日期:2019-04-17 13:36
本发明专利技术公开了一种调控辣椒青果紫色基因标记的开发与应用。本发明专利技术提供了检测辣椒基因组的SNP‑78‑708位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色中的应用;或检测辣椒基因组的SNP‑78‑708位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色产品中的应用;所述SNP位点为辣椒基因组第10号染色体的第193360134位。本发明专利技术的实验证明,本发明专利技术在10号染色体A基因下游约37.8.3Mb处发现分子标记,并根据其设计了dCAPs标记CAPS‑78‑708,可以检测辣椒青果的颜色。

【技术实现步骤摘要】
一种调控辣椒青果紫色基因标记的开发与应用
本专利技术属于生物
,尤其涉及一种调控辣椒青果紫色基因标记的开发与应用。
技术介绍
花青素(anthocyanins)是一类重要的水溶次生代谢物,广泛的存在于自然界中,主要分布于作物的花和果实当中,但在作物的叶、茎和种子中也都普遍存在。辣椒(CapsicumannuumL.)是世界上重要的农艺作物,是维生素、类胡萝卜素和黄酮类化合物的良好来源。辣椒果实中的叶绿素和类胡萝卜素使其呈现绿色、黄色、橙色及红色等颜色果实。在栽培辣椒种质资源中,存在几个紫果基因型,可能是一个花青素的重要来源。然而,紫色的色素沉着只出现在未成熟的果实中。提高辣椒的抗逆性及其果实营养品质一直是辣椒育种的重要目标。花青素作为一种重要的抗氧化性物质,不仅可以延长辣椒果实的耐储运性,提高其对病害的抵抗能力,同时还可提高辣椒果实的营养品质;在营养器官中,花青素则可提高辣椒对环境胁迫的抵抗能力。利用同源克隆及表达分析,在辣椒中存在多个与花青素合成相关的基因,位于不同的染色体,这些基因在不同组织中,不同程度的影响辣椒中花青素的含量。2005年,YelenaBorovsky等通过番茄EST标签对An2基因同源克隆获得辣椒A基因,该基因编码R2R3MYB型转录因子,为调控花青素合成过程的调控型基因,位于辣椒10号染色体,并获得一个与A基因完全共分离的标记(F:5’GGAGTNAGGAAAGGTNCATGG3’;R:5’GTCATCTTTGTCTAATGTGTTTGTG3’),但未应用在花青素含量或紫色性状的鉴定及筛选中。分子标记辅助育种作为当前育种工作的重要辅助手段,其关键就是开发出高效的分子标记。与目标性状紧密连锁并且稳定、检测方便快捷的分子标记直接对基因型进行选择,能极大的提高育种中选择的准确性和效率,显著缩短育种周期。因此,开发高效的分子标记对于品种改良及新品种选育具有重要意义。
技术实现思路
为了鉴定辣椒青果期的颜色,本专利技术一个目的是提供检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质的用途。辣椒青果为辣椒青果成熟期。本专利技术提供的检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色中的应用;或检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色产品中的应用;所述SNP位点为辣椒基因组第10号染色体的第193360134位。本专利技术还提供了检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或筛选青果颜色为紫色的辣椒中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或筛选青果颜色为绿色的辣椒中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或筛选青果颜色为紫色的辣椒产品中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或筛选青果颜色为绿色的辣椒产品中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或筛选青果颜色为紫色辣椒的紫果基因或基因型中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或筛选青果颜色为紫色辣椒的紫果基因或基因型产品中的应用;所述SNP位点为辣椒基因组第10号染色体的第193360134位。上述应用中,所述辣椒青果的颜色为紫色或绿色。上述应用中,所述SNP-78-708位点的基因型为GG或AA或GA。上述应用中,所述检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质包括引物对和限制性内切酶SfcⅠ;所述引物对由引物F和引物R组成;所述引物F为如下a1)或a2):a1)序列表中序列1所示的单链DNA分子;a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的单链DNA分子;所述引物R为如下b1)或b2):b1)序列表中序列2所示的单链DNA分子;b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的单链DNA分子。上述应用中,所述序列表中序列1所示的单链DNA分子的衍生物为将序列1经过一个或几个核苷酸的取代且与序列1具有相同功能的DNA分子;所述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为将序列2经过一个或几个核苷酸的取代且与序列2具有相同功能的DNA分子。本专利技术另一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色的产品。本专利技术提供的产品,其为上述检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质。本专利技术第3个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色的方法。本专利技术提供的方法,包括如下步骤:检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型为GG或AA或GA,根据基因型判断所述待测辣椒青果颜色;若所述SNP-78-708位点的基因型为GG,则待测辣椒青果颜色为或候选为绿色;若所述SNP-78-708位点的基因型为AA,则待测辣椒青果颜色为或候选为紫色;若所述SNP-78-708位点的基因型为GA,则待测辣椒青果颜色为或候选为紫色。上述方法中,所述检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型为GG或AA或GA为如下A)或B):A)直接测序;B)用权利要求5中的所述引物对所述待测辣椒基因组DNA进行PCR扩增,再用SfcⅠ酶切扩增产物,检测酶切产物:若酶切产物仅含有183bp片段,则待测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型为AA;若酶切产物为183bp和232bp片段,则待测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型为GA;若酶切产物仅含有232bp片段,则待测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型为GG。本专利技术第4个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色的方法。本专利技术提供的方法,包括如下步骤:用上述引物对所述待测辣椒基因组DNA进行PCR扩增,再用SfcⅠ酶切扩增产物,检测酶切产物:若酶切产物仅含有183bp片段,则待测辣椒青果的颜色为或候选为紫色;若酶切产物为183bp和232bp片段,则待测辣椒青果的颜色为或候选为紫色;若酶切产物仅含有232bp片段,则待测辣椒青果的颜色为或候选为绿色。本专利技术的实验证明,本专利技术在10号染色体A基因下游约37.8.3Mb处发现分子标记,并根据其设计了dCAPs标记CAPS-78-708,可以检测辣椒青果的颜色,为筛选紫果基因型提供基础。附图说明图1为分子标记CAPS78-708在亲本及F1代单株中扩增结果。图2为40份已知基因型材料对分子标记CAPS-78-708的验证。具体实施方式下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。实施例1、分子标记CAPS-78-708的获得本试验母本:紫贵人(18C2458),青果紫色(为先正达公司育成的品种“紫贵人”自交纯化的自交系,房换香,彩色甜椒日光温室栽培技术要点[J].乡村科技2013(4):20-20);父本:CM334(18C3375),青果绿色(CM334辣椒高代自交系,徐小万等,辣椒疫病抗性资源‘CM334’的抗性遗传分析[J].植物保护2011(05)32-33);通过杂交获得F1,然后自交获得F2分离群体18C2459,639株本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.检测辣椒基因组的SNP‑78‑708位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色中的应用;或检测辣椒基因组的SNP‑78‑708位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色产品中的应用;所述SNP位点为辣椒基因组第10号染色体的第193360134位。

【技术特征摘要】
1.检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色中的应用;或检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定辣椒青果颜色产品中的应用;所述SNP位点为辣椒基因组第10号染色体的第193360134位。2.检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或筛选青果颜色为紫色的辣椒中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或筛选青果颜色为绿色的辣椒中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或筛选青果颜色为紫色的辣椒产品中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或筛选青果颜色为绿色的辣椒产品中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在鉴定或筛选青果颜色为紫色辣椒的紫果基因或基因型中的应用;或,检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质在制备鉴定或筛选青果颜色为紫色辣椒的紫果基因或基因型产品中的应用;所述SNP位点为辣椒基因组第10号染色体的第193360134位。3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述辣椒青果的颜色为紫色或绿色。4.根据权利要求1-3中任一所述的应用,其特征在于:所述SNP-78-708位点的基因型为GG或AA或GA。5.根据权利要求1-4中任一所述的应用,其特征在于:所述检测辣椒基因组的SNP-78-708位点的基因型的物质包括引物对和限制性内切酶SfcⅠ;所述引物对由引物F和引物R组成;所述引物F为如下a1)或a2):a1)序列表中序列1所示的单链DNA分子;a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的单链DNA分子;所述引物R为如下b1)或b2):b1)序列表中序列2所示的单链DNA分子;b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的单链DNA分子。6....

【专利技术属性】
技术研发人员:沈火林刘金秋
申请(专利权)人:中国农业大学
类型:发明
国别省市:北京,11

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