一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用制造技术

技术编号:20885574 阅读:36 留言:0更新日期:2019-04-17 13:36
本发明专利技术公开了一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,位于ARID5B基因第10外显子261bp处。本发明专利技术以延黄牛DNA为模板,通过HRM分型技术检测ARID5B基因的多态性,再通过单因素方差分析该基因的多态性与延黄牛肉用性状的相关性。本发明专利技术结果可为延黄牛肉质改良和有效遗传标记基因的筛选提供参考依据。

【技术实现步骤摘要】
一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用
本专利技术涉及延黄牛品种培育
,尤其涉及一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用。
技术介绍
延黄牛因其适应性强、生长速度快、产肉率高和具有独特的肉质风味等优点越来越受到人们的关注,是吉林省延吉市饲养的主导肉牛品种之一。延黄牛品种来源是由延黄牛和利木赞经过27年杂交合成、横交固定和群体继代选育而成的新型培育品种。富含AT相互作用功能域5B(AT-richinteractivedomain5B,ARID5B)基因位于牛28号染色体上,含有13个外显子,共编码939个氨基酸,是ARID基因家族重要的一员。ARID包含15种人类特殊蛋白质,根据个体成员之间序列同源性差异可将其分为7个亚型,分别是ARID1、ARID2、ARID3、ARID4、ARID5、JARID1和JARID2。ARID5B和ARID5A也是ARID家族成员,而ARID5B也被称为调制器识别因子2(modulaterrecognitionfactor2,MRF2)能与巨细胞病毒的增强子结合并抑制其活性。有研究报道ARID5B基因编码的转录因子在细胞生长调控过程、细胞型基因表达和胚胎发育过程中发挥着重要的作用。早期研究发现,人ARID5B基因的5个SNP位点与儿童急性淋巴细胞白血病相关,还发现该基因与人类动脉粥样硬化有关。拷贝数变异(CNV)与多种人类疾病(包括肥胖)的病因有关,Selvanayagam等学者对罕见CNV肥胖儿科病例个体中发现ARID5B是一种潜在的新型肥胖候选基因。敲除调节剂识别因子-2(Mrf-2)的小鼠体型消瘦,白色脂肪组织显著减少,Mrf2可能是脂肪细胞分化的潜在调节因子和瘦蛋白的潜在抑制因子。ARID5B在脂肪细胞产热调节途径发挥着重要作用,具有显著的肥胖和抗肥胖作用。脂肪是由脂肪细胞组成,是动物体内能量储存和内分泌功能的主要器官,不仅在调节新陈代谢中发挥重要作用,而且还调节动物肥胖。脂肪形成是一个涉及细胞增殖、分化、激素调节和基因表达调控等复杂过程。牛肉品质受许多主效基因的影响,例如脂肪酸结合蛋白(FABP)基因影响牛肉的肌内脂肪含量和钙蛋白酶(Calpain)基因影响牛肉的嫩度。目前已证实ARID5B基因参与脂肪酸代谢,但是对于该基因在牛肉质方面的研究尚未见报道。肌内脂肪是影响牛肉品质的一个关键因素,而脂肪形成过程受许多基因调控。L.A.Aqrawi等研究发现ARID5B是影响脂肪组织发育和减少线粒体脂肪酸β-氧化的关键基因。J.Murray等研究报道ARID5B在脂肪生成和软骨形成中具有重要功能,并且该基因的抑制导致原代骨骼肌细胞分化也受到抑制,说明该基因在骨骼肌肌肉生成中也发挥着重要的作用。L.L.Sun等还研究发现ARID5B基因的四个单核苷酸多态性(SNP)位点与2型糖尿病(T2DM)和人类脂质代谢相关。本研究发现延黄牛ARID5B基因第10外显子261bp处存在A/G突变,且存在三种基因型,AA是优势等位基因型,A为优势等位基因。三种基因型与延黄牛肉用性状中的肌内脂肪存在显著相关性(P<0.05)。ARID5B基因在小鼠骨骼肌原代细胞中敲除导致骨骼肌细胞分化也受抑制,说明ARID5B基因在骨骼肌生长过程中发挥调控作用,而骨骼肌的发育与动物体尺性状息息相关。J.Dong等才研究报道敲除ARID5B基因的小鼠体型消瘦,白色脂肪组织显著减少,ARID5B基因可能是脂肪细胞分化的潜在调节因子和瘦蛋白的潜在抑制因子。M.Claussnitzer等发现ARID5B基因在脂肪细胞产热途径也发挥重要的调控作用,具有显著的肥胖和抗肥胖的作用,而本专利技术发现ARID5B基因的多态性与延黄牛肉质性状中的肌内脂肪含量具有相关性,这说明GG基因型有可能是调控延黄牛脂肪酸代谢的关键基因型。肌内脂肪均匀地分布于肌肉组织中,磷脂约占整个脂肪组织的20%-50%,磷脂是影响肉品质风味的主要物质,这也说明ARID5B基因的多态性可能影响延黄牛肉质风味。本专利技术以延黄牛DNA为模板,通过HRM分型技术检测ARID5B基因的多态性,再通过单因素方差分析该基因的多态性与延黄牛肉用性状的相关性。本专利技术结果可为延黄牛肉质改良和有效遗传标记基因的筛选提供参考依据。
技术实现思路
基于
技术介绍
存在的技术问题,本专利技术提出了一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用。本专利技术的技术方案如下:一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,位于ARID5B基因第10外显子261bp处。优选的,具有影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点的核苷酸序列分别为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示;本专利技术发现了延黄牛ARID5B基因第10外显子261bp处存在A/G突变,含有三种基因型,分别为AA基因型、AG基因型和GG基因型。优选的,影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点完全连锁的分子标记,该分子标记为ARID5B-HRM-10,其引物序列为:ARID5B-HRM-F10:5’-AAAAGAGAATGCCCCAAAG-3’;ARID5B-HRM-R10:5’-CTGTAGAGGAGCACAACT-3’。优选的,所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点在延黄牛分子标记辅助育种中的应用。优选的,所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因分子标记在延黄牛分子标记辅助育种中的应用。优选的,所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因分子标记的引物在延黄牛分子标记辅助育种中的应用。本专利技术的有益之处在于:本专利技术发现了延黄牛ARID5B基因第10外显子261bp处存在A/G突变,含有三种基因型,分别为AA基因型、AG基因型和GG基因型。ARID5B基因第10外显子基因型GG与肉质性状中的肌内脂肪存在显著正相关(P<0.05)。本专利技术结果可为延黄牛肉质改良和有效遗传标记基因的筛选提供参考依据。附图说明图1:ARID5B基因第10外显子PCR产物电泳图;其中,M,DL2000DNAMarker;1、3、11、18、25、35、40和65表示不同DNA样品PCR产物;图2:延黄牛ARID5B第10外显子核苷酸序列比对图;注:1、3、11、18、25、35、40、65、77、86、96、98-F表示随机挑选的测序样品;图3:延黄牛ARID5B基因第10外显子氨基酸序列比对图;注:1、3、11、18、25、35、40、65、77、86、96、98-F表示随机挑选的测序样品;图4:AA、AG和GG基因型的测序波峰图;图5:延黄牛ARID5B基因外显子10的分型结果图。具体实施方式实施例:1材料与方法1.1试验动物选取18月龄的99头延黄牛母牛,参照肉牛遗传改良计划的标准测量肌内脂肪含量(通过甘道夫兽用B超仪测量获得)。采集其耳组织约1.5g放入含有75%乙醇的2mLEP管中,做好标记和日期带回实验室,-20℃保存。1.2主要试剂及仪器480HRMMasterMix试剂盒购自美国罗氏公司;2×ESTaqMasterMix购自CWBIO公司;AxyPrep基因组DNA提取试剂盒购自Axygeno公司;PCR仪T100购自上海伯乐生命医学产品有限本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,其特征在于,位于ARID5B基因第10外显子261bp处。

【技术特征摘要】
1.一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,其特征在于,位于ARID5B基因第10外显子261bp处。2.如权利要求1所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,其特征在于,具有该基因突变位点的核苷酸序列分别为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2。3.一种ARID5B突变基因,其特征在于,该突变基因在ARID5B基因第10外显子261bp处具有基因突变位点。4.一种与权利要求1所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点完全连锁的分子标记,其特征在于,该分子标记为ARID...

【专利技术属性】
技术研发人员:曹阳赵玉民吴健胡忠昌金海国于永生张立春肖成魏天高一
申请(专利权)人:吉林省农业科学院
类型:发明
国别省市:吉林,22

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