长链非编码RNA在肿瘤中的应用制造技术

本发明专利技术公开了长链非编码RNA在肿瘤中的应用，具体的公开了LOC105378728在直肠腺癌诊断和治疗中的应用，LOC105378728在直肠腺癌患者中表达上调，可以通过检测LOC105378728的表达水平来判断受试者是否患有直肠腺癌。

【技术实现步骤摘要】
长链非编码RNA在肿瘤中的应用
本专利技术属于生物医药领域，涉及长链非编码RNA在肿瘤中的应用，具体的涉及LOC105378728在直肠腺癌诊疗中的应用。
技术介绍
结直肠癌(colorectalcancer,CRC)是最常见的恶性肿瘤之一，其在全球的发病率与死亡率均位于第三位，每年约有130万新发病例。在我国，随着人们物质生活水平的丰富，土地与水资源的污染，人口老龄化的加剧，近年来结直肠癌的发病率与死亡率均呈上升趋势，且患病年龄明显提前，已经成为威肋、人类健康的常见恶性疾病之一。直肠腺癌属于直肠癌的一种，是指齿状线以上至乙状结肠与直肠移行部之间的腺癌，占结直肠癌的75％～85％，是消化道常见的恶性肿瘤。我国直肠癌的发病率占大肠癌总发病率的60％～70％，但是病因至今仍不甚清楚。缺乏早期预防手段，由于诊断技术的限制，结直肠癌的早期诊断率较低，很多患者都是在出现临床症状后就医，此时往往已到病情晚期，丧失了最佳治疗时机。因此，依托基础研究，探索新的可靠的无创的早期诊断方法是未来研究的一个重要方向。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，lncRNA)是一类长度介于200到100,000个核苷酸之间的没有编码功能的RNA(KongH,WuY,ZhuM,etal.Longnon-codingRIVAs:novelprognosticbiomarkersfarlivermetastasesinpatientswithearlystagecolorectalcancer.Oncotarget.2016Aug42；7(31):50428-36.)。长链非编码RNA因为没有编码蛋白质的功能，曾经一度被认为是基因转录和翻译过程中的“噪音”，而未被重视。然而有越来越多的研究发现长链非编码RNA其实参与了结直肠癌的各个生物学和病理过程，包括凋亡、增殖和转移(HuarteM.Theemergingroleof1ncRNAsincancer.Naturemedicine.2015Nov；21(11):1253-61.)。除此之外，许多近年来的证据表明长链非编码RNA能够作为竞争性内源性RNA(CompetingendogenousRNAs,ceRNAs)或被称为分子海绵，通过吸附或调控小RNA(miRNA)来参与基因和蛋白的调控。虽然对长链非编码RNA的研究不断地得到深入，对其功能的了解也越来越深，但是长链非编码RNA的大多数功能仍然有待进一步地阐明。长链非编码RNA在基因调控中扮演着关键的角色，影响着包括细胞增殖、迁移和基因组的稳定性等各个方面的生物活性，并且也有越来越多的证据显示许多长链非编码RNA在结直肠癌的调控中扮演着关键的角色。研究与直肠腺癌相关的lncRNA，为直肠腺癌的早期诊断和治疗提供了新的途径。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的之一在于提供一种与直肠腺癌发生发展相关的生物标志物，以及其在诊断和治疗直肠腺癌中的应用。本专利技术的目的之二在于提供一种筛选治疗直肠腺癌的候选药物的方法。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了一种检测试剂，所述试剂为检测LOC105378728水平的试剂。进一步，所述试剂选自：特异性识别LOC105378728的探针；或特异性扩增LOC105378728的引物。进一步，所述特异性扩增LOC105378728的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术的第二方面提供了一种产品，所述产品包括检测LOC105378728水平的试剂。进一步，所述试剂选自：特异性识别LOC105378728的探针；或特异性扩增LOC105378728的引物。进一步，所述特异性扩增LOC105378728的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。进一步，本专利技术第二方面所述的产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。本专利技术的第三方面提供了一种组合物，所述组合物包括有效量的LOC105378728的抑制剂。所述抑制剂选自：以LOC105378728或其转录本为靶序列、且能够抑制LOC105378728基因表达或基因转录的干扰分子，包括：shRNA(小发夹RNA)、小干扰RNA(siRNA)、dsRNA、微小RNA、反义核酸，或能表达或形成所述shRNA、小干扰RNA、dsRNA、微小RNA、反义核酸的构建物。进一步，所述抑制剂为siRNA。进一步，所述组合物还包括药学上可接受的载体。本专利技术的第四方面提供了一种筛选治疗直肠腺癌的候选药物的方法，所述方法包括：用待筛选物质处理表达或含有LOC105378728基因的体系；和检测所述体系中LOC105378728基因的表达；其中，若所述待筛选的物质可以抑制LOC105378728基因的水平，则表明该待筛选物质是治疗直肠腺癌的候选药物。所述体系选自：细胞体系、亚细胞体系、溶液体系、组织体系、器官体系或动物体系。所述候选物质包括(但不限于)：针对LOC105378728基因或其上游或下游基因设计的干扰分子、核酸抑制物、小分子化合物等。本专利技术的第五方面提供了一种预测直肠腺癌的计算模型，所述计算模型包括对LOC105378728的计算分析模块。本专利技术的第六方面提供了如下任一项应用：a.本专利技术第一方面所述的试剂在制备诊断直肠腺癌的工具中的应用；b.本专利技术第二方面所述的产品在制备诊断直肠腺癌的工具中的应用；c.LOC105378728在构建预测直肠腺癌的计算模型中的应用；d.本专利技术第三方面所述的组合物在制备治疗直肠腺癌的药物中的应用；e.LOC105378728在筛选治疗直肠腺癌的候选药物中的应用。附图说明图1是利用QPCR检测LOC105378728基因在直肠腺癌组织中的表达情况图。具体的实施方式本专利技术基于高通量测序以及生物信息学分析方法，检测直肠腺癌标本中lncRNA在肿瘤组织和癌旁组织的表达，首次发现了LOC105378728在直肠腺癌中表达上调，为直肠腺癌的早期诊断及治疗提供了新的手段。转录LOC105378728的基因是位于人1号染色体上，本专利技术中的LOC105378728包括野生型、突变型或其片段。目前已经公开的LOC105378728的转录产物有6个，序列分别如国际公共核酸数据库GeneBank中转录产物XR_947355.2、XR_947358.2、XR_947356.2、XR_947354.2、XR_947359.2、XR_947357.2所示。本领域技术人员知道，在对原始测序结果进行生物信息学分析时，通常会将测序结果和已知的基因进行比对，只要测序片段可以比对到相关基因上，就可以看做是该基因的表达，因此，在提及差异表达的基因时，该基因的不同的转录本同时包含在本专利技术中，其突变型或其片段也包含在本专利技术中。本专利技术可以利用本领域内已知的任何方法测定基因的表达水平，例如核酸测序技术、核酸扩增技术、核酸杂交技术。测定基因表达的手段不是本专利技术的重要方面。可以在转录水平上检测生物标志物的表达水平。试剂盒、芯片、核酸膜条本专利技术提供了一种试剂盒，所述试剂盒可用于检测LOC105378728的表达。作为优选的实施方案，所述试剂盒包含与生物标志物的lncRNA特异性结合的一种或多种探针或引物。作为更为优选的实施方式，所述试剂盒还包含洗涤溶液。本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂为检测LOC105378728水平的试剂。

【技术特征摘要】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂为检测LOC105378728水平的试剂。2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述试剂选自：特异性识别LOC105378728的探针；或特异性扩增LOC105378728的引物。3.根据权利要求2所述的试剂，其特征在于，所述特异性扩增LOC105378728的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。4.一种产品，其特征在于，所述产品包括权利要求1-3任一项所述的试剂。5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。6.一种组合物，其特征在于，所述组合物包括有效量的LOC105378728的抑制剂。7.根据权利要求6所述的组合物，其特征在于，所述抑制剂为siRNA。8.一种筛选治疗直肠腺癌的候选药物的方法，其特征在...

【专利技术属性】
技术研发人员：李正美，赵强，邱建峰，侯坤，石丽婷，赵慧慧，路伟钊，
申请(专利权)人：泰山医学院，泰山医学院附属医院，
类型：发明
国别省市：山东,37