一种用于直肠腺癌诊疗的lncRNA制造技术

本发明专利技术公开了一种用于直肠腺癌诊疗的lncRNA，所述lncRNA为LOC105376270，本发明专利技术公开了LOC105376270在制备直肠腺癌诊断和治疗产品中的应用以及相应的产品。本发明专利技术同时公开了LOC105376270在筛选治疗直肠腺癌的候选药物中以及构建预测直肠腺癌的计算模型中的应用。

【技术实现步骤摘要】
一种用于直肠腺癌诊疗的lncRNA
本专利技术属于生物医药领域，涉及一种用于直肠腺癌诊疗的lncRNA，具体的涉及lncRNALOC105376270。
技术介绍
结直肠癌是一种常见的消化系统肿瘤，在我国的发病率总体上呈逐年上升趋势(XuJ,QinX,WangJ,etal.Chineseguidelinesforthediagnosisandcomprehensiveofhepaticmetastasisofcolorectalcancer[月.1CancerResClinOncol2011,137(9):1379-96.)。直肠腺癌属于直肠癌的一种，占结直肠癌的75％～85％，是消化道常见的恶性肿瘤。近年来，虽然诊疗技术和化疗药物不断更新，极大的改善了结直肠患者的治疗效果，但由于大多数患者发现时已经发生转移，结直肠癌患者的预后仍然没有显著改善(AnayaDA,BeckerNS,AbrahamNS.Globalgraying,colorectalcancerandlivermetastasis:newimplicationsforsurgicalmanagement[1].CritRevOncolHematol2011,77(2):100-8.)。因此，积极开展直肠癌转移相关机制研究，寻找新的分子标志物及治疗靶点并进行早期干预和个体化治疗，提高患者生存率具有重要的临床价值和社会意义。长链非编码RNA(longnoncodingRNA,1ncRNA)是一类长度大于200nt缺乏开放读码框架的非编码RNA，主要从表观遗传学、转录调控及转录后调控等方面实现对基因表达的调控。LncRNA在生物生长发育的特定阶段表达，具有组织和时间特异性。近年来的研究表明，lncRNA参与了基因组印迹、X染色体失活、染色体修饰以及端粒生物学等多种生命活动过程。LncRNA还可在转录水平、转录后水平以及表观遗传水平调节基因的表达，参与包括肿瘤在内的人类多种疾病的发生和发展。虽然，相较于miRNA(microRNA，微小核糖核酸)，有关1ncRNA与肿瘤关系的文献明显较少，且研究不够深入，但已经能够确定lncRNA广泛参与肿瘤的发生发展过程，且对肿瘤的诊断、治疗及预后也具有极其重要的作用(.ZhengHT,ShiDB,WangYW,etal.Highexpressionof1ncRNAMALAT1suggestsabiomarkerofpoorprognosisincolorectalcancer[J].IntJClinExpPathol,2014；7(6):3174-3181.)。因此，进一步阐明lncRNA在肿瘤发生发展中的作用机制，将有助于发现新的肿瘤分子诊断、基因治疗及预后判断的标志物。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种与直肠腺癌相关的lncRNA标志物，将其应用到临床中，从而实现直肠腺癌的早期诊断和治疗，进行有效干预，提高患者的生存率和生存质量。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了LOC105376270的应用，用于制备诊断直肠腺癌的产品。进一步，所述产品包括检测样本中LOC105376270表达水平的试剂。进一步，所述试剂包括通过反转录PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片技术检测LOC105376270表达水平的试剂。本专利技术提供了一种诊断直肠腺癌的产品，包括芯片或试剂盒，其中，所述芯片或试剂盒包括检测LOC105376270表达水平的试剂。进一步，所述芯片中检测LOC105376270表达水平的试剂包括特异性识别LOC105376270基因的探针；所述试剂盒中检测LOC105376270表达水平的试剂包括特异性扩增LOC105376270基因的引物或特异性识别LOC105376270基因的探针。进一步，特异性扩增LOC105376270基因的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。在本专利技术中，试剂盒还包括容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂，以及附有试剂盒的使用说明书，其中记载了如何采用试剂盒进行检测，和如何利用检测结果对肿瘤发展进行判断、对治疗方案进行选择。试剂盒的组分可以以水介质的形式或以冻干的形式来包装。试剂盒中适当的容器通常至少包括一种小瓶、试管、长颈瓶、宝特瓶、针筒或其它容器，其中可放置一种组分，并且优选地，可进行适当地等分。在试剂盒中存在多于一种的组分时，试剂盒中通常也将包含第二、第三或其它附加的容器，其中分离地放置附加的组分。然而，不同组合的组分可被包含在一个小瓶中。本专利技术的试剂盒通常也将包括一种用于容纳反应物的容器，密封以用于商业销售。这种容器可包括注模或吹模的塑料容器，其中可保留所需的小瓶。在本专利技术中，芯片还包括固相载体，所述固相载体包括塑料制品、微颗粒、膜载体等。所述塑料制品可通过非共价或物理吸附机制与抗体或蛋白抗原相结合，最常用的塑料制品为聚苯乙烯制成的小试管、小珠和微量反应板；所述微颗粒是由高分子单体聚合成的微球或颗粒，其直径多为微米，由于带有能与蛋白质结合的功能团，易与抗体(抗原)形成化学偶联，结合容量大；所述膜载体包括硝酸纤维素膜、玻璃纤维素膜及尼龙膜等微孔滤膜。本专利技术提供了一种LOC105376270的应用，用于构建预测直肠腺癌的计算模型。正如熟练技术人员知道的，可以以不同方式实施和实现将标志物水平与某种可能性或风险关联起来的步骤。优选地，在数学上组合标志物和一种或多种其它标志物的测定浓度，并将组合值与根本的诊断问题关联起来。可以通过任何适宜的现有技术数学方法将标志物值的测定组合。优选地，在标志物组合中应用的数学算法是一种对数函数。优选地，应用此类数学算法或此类对数函数的结果是单一值。根据根本的诊断问题，能容易地将此类值与例如个体关于直肠腺癌的风险或与有助于评估直肠腺癌患者的其它有意诊断用途关联起来。以一种优选的方式，此类对数函数是如下获得的：a)将个体分类入组，例如正常人、有直肠腺癌风险的个体、具有直肠腺癌的患者等等，b)通过单变量分析来鉴定在这些组之间差异显著的标志物，c)对数回归分析以评估标志物的可用于评估这些不同组的独立差别值，并d)构建对数函数来组合独立差别值。在这种类型的分析中，标志物不再是独立的，而是代表一个标志物组合。用于将标志物组合与疾病关联起来的对数函数优选采用通过应用统计方法开发和获得的算法。例如，适宜的统计方法是判别分析(DA)(即线性、二次、规则DA)、Kernel方法(即SVM)、非参数方法(即k-最近邻居分类器)、PLS(部分最小二乘)、基于树的方法(即逻辑回归、CART、随机森林方法、助推/装袋方法)、广义线性模型(即对数回归)、基于主分量的方法(即SIMCA)、广义叠加模型、基于模糊逻辑的方法、基于神经网络和遗传算法的方法。熟练技术人员在选择适宜的统计方法来评估本专利技术的标志物组合并由此获得适宜的数学算法方面不会有问题。在一个实施方案中，用于获得评估直肠腺癌中使用的数学算法的统计方法选自DA(即线性、二次、规则判别分析)、Kernel方法(即SVM)、非参数方法(即k-最近邻居分类器)、PLS(部分最小二乘)、基于树的方法(即逻辑回归、CART、随机森林方法、助推方法)、或广义线性本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.LOC105376270的应用，其特征在于，用于制备诊断直肠腺癌的产品。

【技术特征摘要】
1.LOC105376270的应用，其特征在于，用于制备诊断直肠腺癌的产品。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括检测样本中LOC105376270表达水平的试剂。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括通过反转录PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片技术检测LOC105376270表达水平的试剂。4.一种诊断直肠腺癌的产品，其特征在于，包括芯片或试剂盒，其中，所述芯片或试剂盒包括检测LOC105376270表达水平的试剂。5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述芯片中检测LOC105376270表达水平的试剂包括特异性识别LOC105376270基因的探针；所...

【专利技术属性】
技术研发人员：李正美，赵强，邱建峰，侯坤，石丽婷，赵慧慧，路伟钊，
申请(专利权)人：泰山医学院，泰山医学院附属医院，
类型：发明
国别省市：山东,37