The invention discloses a rice semi-dwarf gene sd1 allele and its identification method, which is an allele formed by C_G mutation at the 146 base of the third exon of the rice semi-dwarf gene sd1, and is a gene regulating plant height traits of rice. The invention also discloses the detection method and application of the functional molecular markers. The functional molecular markers of the invention are based on the PCR technology, and can distinguish and identify the dwarf source types of rice germplasm resources, which are not affected by environment and human factors. The functional molecular markers of the invention can be used for rice dwarf breeding and improving rice plant type. The sd1 allele and its identification method have wide application in rice breeding field. Application prospects.
【技术实现步骤摘要】
一种水稻半矮秆基因sd1等位基因及其鉴定方法
本专利技术属于水稻选育
,涉及一种水稻半矮秆基因sd1等位基因及其鉴定方法。
技术介绍
水稻是人类主要的能源作物,随着全球人口数量的持续增加及耕地面积的急剧减少,粮食安全正成为一个严重的全球问题。株高是水稻重要的农艺性状之一,半矮秆基因sd1的应用极大提高了水稻单产,解决了高秆水稻品种高肥条件下的倒伏问题,在“绿色革命”中起到了关键性的作用。以矮仔占、矮脚南特或低脚乌尖为矮源育成的矮秆品种,已为世界水稻生产做出了举世瞩目的贡献。但是,目前籼稻品种的矮源基因来源过于单一,主要集中在矮脚南特突变类型。因此,目前亟待解决的问题是在育种中如何利用现有品种为亲本,在繁育新品种时不受单一矮源的限制。
技术实现思路
本专利技术解决的问题在于提供一种水稻半矮秆基因sd1等位基因及其鉴定方法,该等位基因筛选自籼稻品种9311,利用该等位基因进行水稻培育可降低水稻株高,尤其是籼稻的株高,也可以进一步改造粳稻株型。本专利技术是通过以下技术方案来实现:一种水稻半矮秆基因sd1等位基因,是水稻半矮秆基因sd1基因第3外显子上的第146位碱基发生C-G突变形成的等位基因,是调控水稻株高性状的基因。该等位基因的第3外显子核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示。该等位基因的C-G突变导致GA20氧化酶编码提前终止,导致蛋白功能缺失,从而调控水稻株高性状。该分子标记用于检测水稻半矮秆基因sd1基因第3外显子上的第146位碱基是否发生了C-G突变,其包括SEQIDNO.2和SEQIDNO.3所示的引物对;SEQIDNO.2:CGCGGTTTGT ...
【技术保护点】
1.一种水稻半矮秆基因sd1等位基因,其特征在于,是水稻半矮秆基因sd1基因第3外显子上的第146位碱基发生C‑G突变形成的等位基因,是调控水稻株高性状的基因。
【技术特征摘要】
1.一种水稻半矮秆基因sd1等位基因,其特征在于,是水稻半矮秆基因sd1基因第3外显子上的第146位碱基发生C-G突变形成的等位基因,是调控水稻株高性状的基因。2.如权利要求1所述的水稻半矮秆基因sd1等位基因,其特征在于,该等位基因的第3外显子核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示。3.如权利要求1所述的水稻半矮秆基因sd1等位基因,其特征在于,该等位基因的C-G突变导致GA20氧化酶编码提前终止,导致蛋白功能缺失,从而调控水稻株高性状。4.权利要求1所述的水稻半矮秆基因sd1等位基因的分子标记,其特征在于,该分子标记用于检测水稻半矮秆基因sd1基因第3外显子上的第146位碱基是否发生了C-G突变,其包括SEQIDNO.2和SEQIDNO.3所示的引物对;SEQIDNO.2:CGCGGTTTGTCCTTGTCG;SEQIDNO.3:AAATCGGCTTCTGTTCGTTCC。5.一种水稻半矮秆基因sd1等位基因的鉴定方法,其特征在于,包括以下操作:以提取的水稻总DNA为模板,以SEQIDNO.2和SEQIDNO.3所示的引物对为引物进行PCR扩增,对扩增产物进行Ncil酶切后电泳检测,根...
【专利技术属性】
技术研发人员:翟荣荣,张林,张小明,叶胜海,
申请(专利权)人:浙江省农业科学院,扬州大学,
类型:发明
国别省市:浙江,33
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