一种用于辅助鉴定身高的方法及其专用引物组技术

技术编号:20472032 阅读:41 留言:0更新日期:2019-03-02 14:30
本发明专利技术公开了一种用于辅助鉴定身高的方法及其专用引物组。本发明专利技术提供的鉴定待测者身高的方法,包括如下步骤:(1)检测待测者基于SNP组合中各个SNP的基因型;SNP组合为如下22个SNP:rs111980222、chr1_103380393、rs17346452、rs2629046、rs12612930、rs7689420、rs11021504、rs3816804、rs11170624、rs3751599、rs11082671、rs6030712、rs992100、rs2166898、rs10037512、rs3823418、rs12413361、rs17152411、rs3781426、rs7909670、rs8052560、rs4821083;(2)根据22个SNP的基因型,获得WAS;(3)根据WAS鉴定待测者身高。本发明专利技术对于儿科学及法医学具有实践应用意义。

【技术实现步骤摘要】
一种用于辅助鉴定身高的方法及其专用引物组
本专利技术涉及一种用于辅助鉴定身高的方法及其专用引物组。
技术介绍
人类身高是典型的多基因遗传复杂性状。Galton等首先发现亲代与子代身高具有一定关联性,Fisher等提出身高在遗传表型上的差异是由许多遗传因子共同作用而产生;大家系和双生子研究结果进一步表明,人类身高主要受遗传因素影响,约占80%以上。近年来,随着基因分型技术和DNA测序技术的快速发展,尤其是全基因组关联分析(Genome-wideassociationstudy,GWAS)的应用,人类身高的遗传学研究取得了很多突破性成就。2008年,针对欧洲人群的研究发现了54个与身高呈显著关联性的SNP位点。在2010年、2014年及2017年,分别针对18万、25万、71万大样本欧洲人群的GWAS分析中共发现约780个身高关联性变异位点,能够解释身高遗传变异的27.4%。这些研究表明身高变异具有多基因性,并且与调节身高的一些遗传学通路相关联。基于身高关联的SNP位点推测成年人的身高,对儿科学及法医学具有实践应用意义。身高在不同人群之间存在遗传差异,这种差异表现在关联位点的不同和同一位点对身高表型的效应不同方面。近年来,亚洲人群的身高遗传研究取得了一定的进展,但是由于样本量较小等原因,与欧洲研究相比新发现及验证的身高关联位点有限,且缺少有潜在应用价值的身高推测模型。对身高关联位点进行更为深入的验证并建立相应的推测模型,对我国人群身高遗传学研究具有重要的探索意义。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种用于辅助鉴定身高的方法及其专用引物组。本专利技术保护一种特异引物组,由引物组甲-1、引物组甲-2、引物组乙-1和引物组乙-2组成;引物组甲-1由如下24种引物组成:序列表的序列1所示的引物、序列表的序列2所示的引物、序列表的序列4所示的引物、序列表的序列5所示的引物、序列表的序列7所示的引物、序列表的序列8所示的引物、序列表的序列10所示的引物、序列表的序列11所示的引物、序列表的序列13所示的引物、序列表的序列14所示的引物、序列表的序列16所示的引物、序列表的序列17所示的引物、序列表的序列19所示的引物、序列表的序列20所示的引物、序列表的序列22所示的引物、序列表的序列23所示的引物、序列表的序列25所示的引物、序列表的序列26所示的引物、序列表的序列28所示的引物、序列表的序列29所示的引物、序列表的序列31所示的引物、序列表的序列32所示的引物、序列表的序列34所示的引物、序列表的序列35所示的引物;引物组甲-2由如下12种引物组成:序列表的序列3所示的引物、序列表的序列6所示的引物、序列表的序列9所示的引物、序列表的序列12所示的引物、序列表的序列15所示的引物、序列表的序列18所示的引物、序列表的序列21所示的引物、序列表的序列24所示的引物、序列表的序列27所示的引物、序列表的序列30所示的引物、序列表的序列33所示的引物、序列表的序列36所示的引物;引物组乙-1由如下20种引物组成:序列表的序列37所示的引物、序列表的序列38所示的引物、序列表的序列40所示的引物、序列表的序列41所示的引物、序列表的序列43所示的引物、序列表的序列44所示的引物、序列表的序列46所示的引物、序列表的序列47所示的引物、序列表的序列49所示的引物、序列表的序列50所示的引物、序列表的序列52所示的引物、序列表的序列53所示的引物、序列表的序列55所示的引物、序列表的序列56所示的引物、序列表的序列58所示的引物、序序列表的序列59所示的引物、序列表的序列61所示的引物、序列表的序列62所示的引物、序列表的序列64所示的引物、序列表的序列65所示的引物;引物组乙-2由如下10种引物组成:序列表的序列39所示的引物、序列表的序列42所示的引物、序列表的序列45所示的引物、序列表的序列48所示的引物、序列表的序列51所示的引物、序列表的序列54所示的引物、序列表的序列57所示的引物、序列表的序列60所示的引物、序列表的序列63所示的引物、序列表的序列66所示的引物。本专利技术还保护一种特异引物组,由如下66种引物组成:序列表的序列1所示引物至序列表的序列66所示的引物。所述特异引物组可用于鉴定或辅助鉴定身高。本专利技术还保护所述特异引物组在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的功能为鉴定或辅助鉴定身高。本专利技术还保护所述特异引物组的应用,为鉴定或辅助鉴定身高。本专利技术还保护一种试剂盒,包括所述特异引物组;所述试剂盒的功能为鉴定或辅助鉴定身高。以上任一所述鉴定或辅助鉴定身高具体为鉴定或辅助鉴定待测者(又称受试者)高身高概率或低身高概率。所述试剂盒还包括记载有式Ⅰ和/或式Ⅱ和/或式Ⅲ和/或式Ⅳ和/或式Ⅴ和/或式Ⅵ和/或式Ⅶ和/或式Ⅷ的载体。式Ⅰ:P=exp(0.409+2.117×WAS)/[1+exp(0.409+2.117×WAS);式Ⅰ为适于男性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥180cm,低身高的含义为身高≤160cm。式Ⅱ:P=exp(-0.314+1.241×WAS)/[1+exp(-0.314+1.241×WAS)];式Ⅱ为适于男性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥180cm,低身高的含义为身高≤165cm。式Ⅲ:P=exp(-2.117+3.772×WAS)/[1+exp(-2.117+3.772×WAS)];式Ⅲ为适于四川男性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥180cm,低身高的含义为身高≤160cm。式Ⅳ:P=exp(-2.405+2.628×WAS)/[1+exp(-2.405+2.628×WAS)];式Ⅳ为适于四川男性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥180cm,低身高的含义为身高≤165cm。式Ⅴ:P=exp(0.486+1.697×WAS)/[1+exp(0.486+1.697×WAS)];式Ⅴ为适于四川女性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥160cm,低身高的含义为身高≤150cm。式Ⅵ:P=exp(-0.661+0.897×WAS)/[1+exp(-0.661+0.897×WAS)];式Ⅵ为适于四川女性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥156cm,低身高的含义为身高<156cm。式Ⅶ:P=exp(-0.303+1.261×WAS)/[1+exp(-0.303+1.261×WAS)];式Ⅶ为适于内蒙男性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-P)值为受试者为低身高的概率;高身高的含义为身高≥180cm,低身高的含义为身高≤165cm。式Ⅷ:P=exp(-0.434+1.103×WAS)/[1+exp(-0.434+1.103×WAS)];式Ⅷ为适于内蒙男性的身高预测公式;P值为受试者为高身高的概率,(1-本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.特异引物组,由引物组甲‑1、引物组甲‑2、引物组乙‑1和引物组乙‑2组成;引物组甲‑1由如下24种引物组成:序列表的序列1所示的引物、序列表的序列2所示的引物、序列表的序列4所示的引物、序列表的序列5所示的引物、序列表的序列7所示的引物、序列表的序列8所示的引物、序列表的序列10所示的引物、序列表的序列11所示的引物、序列表的序列13所示的引物、序列表的序列14所示的引物、序列表的序列16所示的引物、序列表的序列17所示的引物、序列表的序列19所示的引物、序列表的序列20所示的引物、序列表的序列22所示的引物、序列表的序列23所示的引物、序列表的序列25所示的引物、序列表的序列26所示的引物、序列表的序列28所示的引物、序列表的序列29所示的引物、序列表的序列31所示的引物、序列表的序列32所示的引物、序列表的序列34所示的引物、序列表的序列35所示的引物;引物组甲‑2由如下12种引物组成:序列表的序列3所示的引物、序列表的序列6所示的引物、序列表的序列9所示的引物、序列表的序列12所示的引物、序列表的序列15所示的引物、序列表的序列18所示的引物、序列表的序列21所示的引物、序列表的序列24所示的引物、序列表的序列27所示的引物、序列表的序列30所示的引物、序列表的序列33所示的引物、序列表的序列36所示的引物;引物组乙‑1由如下20种引物组成:序列表的序列37所示的引物、序列表的序列38所示的引物、序列表的序列40所示的引物、序列表的序列41所示的引物、序列表的序列43所示的引物、序列表的序列44所示的引物、序列表的序列46所示的引物、序列表的序列47所示的引物、序列表的序列49所示的引物、序列表的序列50所示的引物、序列表的序列52所示的引物、序列表的序列53所示的引物、序列表的序列55所示的引物、序列表的序列56所示的引物、序列表的序列58所示的引物、序序列表的序列59所示的引物、序列表的序列61所示的引物、序列表的序列62所示的引物、序列表的序列64所示的引物、序列表的序列65所示的引物;引物组乙‑2由如下10种引物组成:序列表的序列39所示的引物、序列表的序列42所示的引物、序列表的序列45所示的引物、序列表的序列48所示的引物、序列表的序列51所示的引物、序列表的序列54所示的引物、序列表的序列57所示的引物、序列表的序列60所示的引物、序列表的序列63所示的引物、序列表的序列66所示的引物。...

【技术特征摘要】
1.特异引物组,由引物组甲-1、引物组甲-2、引物组乙-1和引物组乙-2组成;引物组甲-1由如下24种引物组成:序列表的序列1所示的引物、序列表的序列2所示的引物、序列表的序列4所示的引物、序列表的序列5所示的引物、序列表的序列7所示的引物、序列表的序列8所示的引物、序列表的序列10所示的引物、序列表的序列11所示的引物、序列表的序列13所示的引物、序列表的序列14所示的引物、序列表的序列16所示的引物、序列表的序列17所示的引物、序列表的序列19所示的引物、序列表的序列20所示的引物、序列表的序列22所示的引物、序列表的序列23所示的引物、序列表的序列25所示的引物、序列表的序列26所示的引物、序列表的序列28所示的引物、序列表的序列29所示的引物、序列表的序列31所示的引物、序列表的序列32所示的引物、序列表的序列34所示的引物、序列表的序列35所示的引物;引物组甲-2由如下12种引物组成:序列表的序列3所示的引物、序列表的序列6所示的引物、序列表的序列9所示的引物、序列表的序列12所示的引物、序列表的序列15所示的引物、序列表的序列18所示的引物、序列表的序列21所示的引物、序列表的序列24所示的引物、序列表的序列27所示的引物、序列表的序列30所示的引物、序列表的序列33所示的引物、序列表的序列36所示的引物;引物组乙-1由如下20种引物组成:序列表的序列37所示的引物、序列表的序列38所示的引物、序列表的序列40所示的引物、序列表的序列41所示的引物、序列表的序列43所示的引物、序列表的序列44所示的引物、序列表的序列46所示的引物、序列表的序列47所示的引物、序列表的序列49所示的引物、序列表的序列50所示的引物、序列表的序列52所示的引物、序列表的序列53所示的引物、序列表的序列55所示的引物、序列表的序列56所示的引物、序列表的序列58所示的引物、序序列表的序列59所示的引物、序列表的序列61所示的引物、序列表的序列62所示的引物、序列表的序列64所示的引物、序列表的序列65所示的引物;引物组乙-2由如下10种引物组成:序列表的序列39所示的引物、序列表的序列42所示的引物、序列表的序列45所示的引物、序列表的序列48所示的引物、序列表的序列51所示的引物、序列表的序列54所示的引物、序列表的序列57所示的引物、序列表的序列60所示的引物、序列表的序列63所示的引物、序列表的序列66所示的引物。2.特异引物组,由如下66种引物组成:序列表的序列1所示引物至序列表的序列66所示的引物。3.权利要求1或2所述特异引物组在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的功能为鉴定或辅助鉴定身高。4.权利要求1或2所述特异引物组的应用,为鉴定或辅助鉴定身高。5.一种试剂盒,包括权利要求1或2所述特异引物组;所述试剂盒的功能为鉴定或辅助鉴定身高。6.一种鉴定待测者身高的方法,包括如下步骤:(1)检测待测者基于SNP组合中各个SNP的基因型;SNP组合为如下22个SNP:rs111980222、chr1_103380393、rs17346452、rs2629046、rs12612930、rs7689420、rs11021504、rs3816804、rs11170624、rs3751599、rs11082671、rs6030712、rs992100、rs2166898、rs10037512、rs3823418、rs12413361、rs17152411、rs3781426、rs7909670、rs8052560、rs4821083;(2)根据22个SNP的基因型,获得WAS;WAS=b1x1+b2x2+b3x3+b4x4+b5x5+b6x6+b7x7+b8x8+b9x9+b10x10+b11x11+b12x12+b13x13+b14x14+b15x15+b16x16+b17x17+b18x18+b19x1...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵雯婷李彩霞叶健孙亚男
申请(专利权)人:公安部物证鉴定中心
类型:发明
国别省市:北京,11

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