一种基于Y-STR基因座的复合扩增体系及其专用引物组合制造技术

本发明专利技术公开了一种基于Y‑STR基因座的复合扩增体系及其专用引物组合。本发明专利技术所提供的引物组合由序列表中的序列1至序列30所示的30种DNA分子组成。采用所述引物组合构建基于Y‑STR基因座的复合扩增体系，然后进行男性个体的STR分型，检出的多态性高，且能够增强Y染色体遗传标记的群体筛查和个体识别能力，尤其对同一家族的远亲具有重要的鉴别价值。因此，应用本发明专利技术提供引物组合进行样本排查，成本低且效率高，具有重要的应用价值。

A Compound Amplification System Based on Y-STR Locus and Its Primer Combination

The invention discloses a composite amplification system based on Y_STR locus and a special primer combination thereof. The primer combination provided by the invention consists of 30 DNA molecules shown in sequence 1 to sequence 30 in the sequence list. A multiplex amplification system based on Y_STR locus was constructed by using the primer combinations mentioned above, and then the male individuals were typed by STR. The detected polymorphism was high, and the ability of population screening and individual identification of Y chromosome genetic markers could be enhanced, especially for distant relatives of the same family. Therefore, the application of the primer combination provided by the invention for sample checking has low cost and high efficiency, and has important application value.

【技术实现步骤摘要】
一种基于Y-STR基因座的复合扩增体系及其专用引物组合
本专利技术涉及法医学
，具体涉及一种基于Y-STR基因座的复合扩增体系及其专用引物组合，尤其涉及基于13个多拷贝Y-STR基因座、1个单拷贝基因座DYS391和1个性别鉴定基因座Amelogenin的复合扩增体系及其专用引物组合。
技术介绍
短串联重复序列(shorttandemrepeat，STR)属于第二代遗传标记，由于其重复单元小、突变率高、在基因组中分布广等特点，现已广泛应用于群体遗传学及法医学领域。在人类基因组中，大约每15-20kb就有一个STR位点，它们占人类基因组总量的10％。这些STR通常由2-6个碱基组成串联重复单元，由于重复单元及重复次数的不同，它们在不同种族、地域的人群中显示出较大的差异性，表现为遗传多态性。最早应用于法医学领域的是人类常染色体STR，至今国内外已有比较成型的扩增、检测试剂盒及相关技术路线，扩增位点数目不断增加。同时，常染色体STR数据库的建成，为案件侦破及罪犯特征刻画提供了条件。然而，对于案发现场提取的混合斑，常染色体STR往往显示出不足。Y-STR是对常染色体STR的重要补充，它们呈现稳定的父系遗传，在混合斑中男性成分的个体识别、父系男性亲属的亲权鉴定等方面具有特殊的应用价值。此外，利用Y-STR在一个家系中的保守特性，案件侦查中，可以方便地利用它快速锁定嫌疑人所在家系，所谓“以Y找群”，为侦查提供重要线索。如今，Y-STR在家系排查、男女混合样品中男性成分的检测等方面越来越展现出无可替代的独特价值，并在公安办案实践中屡立奇功。然而随着社会的不断发展，更为复杂的案件给公安机关带来更大的挑战。尤其在一些性侵案件中，现场DNA检材混合程度高，有时只能获取作案嫌疑人的Y-STR分型。在进行大量的男性个体识别时，现有Y-STR基因座的复合扩增体系，无论从基因座数量或是基因座突变率上，都显示出不足：一方面，现有Y-STR基因座的复合扩增体系中单拷贝Y-STR基因座占多数，仅有的个别多拷贝Y-STR基因座也只有2个拷贝，检出的多态性非常有限；另一方面，常用的Y-STR基因座突变率不高，约为1×10-3甚至更低，这就导致同一家系内部不同个体之间无法被很好地区分开来，在一定程度上限制了Y-STR基因座在个体识别方面的应用。相比之下，快速突变Y-STR基因座(如DYF387S1、DYF399S1、DYF403S1、DYF404S1、DYS526等)突变率较高，一般均大于1×10-2，拥有更高的个体识别能力。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何增强Y染色体遗传标记的群体筛查和个体识别能力。为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了引物组合。本专利技术所提供的引物组合，可由引物1、引物2、引物3、引物4、引物5、引物6、引物7、引物8、引物9、引物10、引物11、引物12、引物13、引物14、引物15、引物16、引物17、引物18、引物19、引物20、引物21、引物22、引物23、引物24、引物25、引物26、引物27、引物28、引物29和引物30组成。所述引物1可为如下A1)或A2)：A1)序列表中的序列1所示的单链DNA分子；A2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子。所述引物2可为如下A3)或A4)：A3)序列表中的序列2所示的单链DNA分子；A4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子。所述引物3可为如下A5)或A6)：A5)序列表中的序列3所示的单链DNA分子；A6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子。所述引物4可为如下A7)或A8)：A7)序列表中的序列4所示的单链DNA分子；A8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子。所述引物5可为如下A9)或A10)：A9)序列表中的序列5所示的单链DNA分子；A10)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子。所述引物6可为如下A11)或A12)：A11)序列表中的序列6所示的单链DNA分子；A12)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子。所述引物7可为如下A13)或A14)：A13)序列表中的序列7所示的单链DNA分子；A14)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子。所述引物8可为如下A15)或A16)：A15)序列表中的序列8所示的单链DNA分子；A16)将序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列8具有相同功能的DNA分子。所述引物9可为如下A17)或A18)：A17)序列表中的序列9所示的单链DNA分子；A18)将序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列9具有相同功能的DNA分子。所述引物10可为如下A19)或A20)：A19)序列表中的序列10所示的单链DNA分子；A20)将序列10经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列10具有相同功能的DNA分子。所述引物11可为如下B1)或B2)：B1)序列表中的序列11所示的单链DNA分子；B2)将序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列11具有相同功能的DNA分子。所述引物12可为如下B3)或B4)：B3)序列表中的序列12所示的单链DNA分子；B4)将序列12经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列12具有相同功能的DNA分子。所述引物13可为如下B5)或B6)：B5)序列表中的序列13所示的单链DNA分子；B6)将序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列13具有相同功能的DNA分子。所述引物14可为如下B7)或B8)：B7)序列表中的序列14所示的单链DNA分子；B8)将序列14经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列14具有相同功能的DNA分子。所述引物15可为如下B9)或B10)：B9)序列表中的序列15所示的单链DNA分子；B10)将序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列15具有相同功能的DNA分子。所述引物16可为如下B11)或B12)：B11)序列表中的序列16所示的单链DNA分子；B12)将序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列16具有相同功能的DNA分子。所述引物17可为如下B13)或B14)：B13)序列表中的序列17所示的单链DNA分子；B14)将序列17经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列17具有相同功能的DNA分子。所述引物18可为如下B15)或B16)：B15)序列表中的序列18所示的单链DNA分子；B16)将序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列18具有相同功能的DNA分子。所述引物19可为如下B17)或B18)：B17)序列表中的序列19所示的单链DNA分子；B18)将序列19经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.引物组合，由引物1、引物2、引物3、引物4、引物5、引物6、引物7、引物8、引物9、引物10、引物11、引物12、引物13、引物14、引物15、引物16、引物17、引物18、引物19、引物20、引物21、引物22、引物23、引物24、引物25、引物26、引物27、引物28、引物29和引物30组成；所述引物1为如下A1)或A2)：A1)序列表中的序列1所示的单链DNA分子；A2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；所述引物2为如下A3)或A4)：A3)序列表中的序列2所示的单链DNA分子；A4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；所述引物3为如下A5)或A6)：A5)序列表中的序列3所示的单链DNA分子；A6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子；所述引物4为如下A7)或A8)：A7)序列表中的序列4所示的单链DNA分子；A8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子；所述引物5为如下A9)或A10)：A9)序列表中的序列5所示的单链DNA分子；A10)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子；所述引物6为如下A11)或A12)：A11)序列表中的序列6所示的单链DNA分子；A12)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子；所述引物7为如下A13)或A14)：A13)序列表中的序列7所示的单链DNA分子；A14)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子；所述引物8为如下A15)或A16)：A15)序列表中的序列8所示的单链DNA分子；A16)将序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列8具有相同功能的DNA分子；所述引物9为如下A17)或A18)：A17)序列表中的序列9所示的单链DNA分子；A18)将序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列9具有相同功能的DNA分子；所述引物10为如下A19)或A20)：A19)序列表中的序列10所示的单链DNA分子；A20)将序列10经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列10具有相同功能的DNA分子；所述引物11为如下B1)或B2)：B1)序列表中的序列11所示的单链DNA分子；B2)将序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列11具有相同功能的DNA分子；所述引物12为如下B3)或B4)：B3)序列表中的序列12所示的单链DNA分子；B4)将序列12经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列12具有相同功能的DNA分子；所述引物13为如下B5)或B6)：B5)序列表中的序列13所示的单链DNA分子；B6)将序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列13具有相同功能的DNA分子；所述引物14为如下B7)或B8)：B7)序列表中的序列14所示的单链DNA分子；B8)将序列14经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列14具有相同功能的DNA分子；所述引物15为如下B9)或B10)：B9)序列表中的序列15所示的单链DNA分子；B10)将序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列15具有相同功能的DNA分子；所述引物16为如下B11)或B12)：B11)序列表中的序列16所示的单链DNA分子；B12)将序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列16具有相同功能的DNA分子；所述引物17为如下B13)或B14)：B13)序列表中的序列17所示的单链DNA分子；B14)将序列17经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列17具有相同功能的DNA分子；所述引物18为如下B15)或B16)：B15)序列表中的序列18所示的单链DNA分子；B16)将序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列18具有相同功能的DNA分子；所述引物19为如下B17)或B18)：B17)序列表中的序列19所示的单链DNA分子；B18)将序列19经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列19具有相同功能的DNA分子；所述引物20为如下B19)或B20)：B19)序列表中的序列20所示的单链DNA分子；B20)将序列20经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列20具有相同功能的DNA分子；所述引物21为如下C1)或C2)：C1)序列表中的序列21所示的单链DNA分子；C...

【技术特征摘要】
1.引物组合，由引物1、引物2、引物3、引物4、引物5、引物6、引物7、引物8、引物9、引物10、引物11、引物12、引物13、引物14、引物15、引物16、引物17、引物18、引物19、引物20、引物21、引物22、引物23、引物24、引物25、引物26、引物27、引物28、引物29和引物30组成；所述引物1为如下A1)或A2)：A1)序列表中的序列1所示的单链DNA分子；A2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；所述引物2为如下A3)或A4)：A3)序列表中的序列2所示的单链DNA分子；A4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；所述引物3为如下A5)或A6)：A5)序列表中的序列3所示的单链DNA分子；A6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子；所述引物4为如下A7)或A8)：A7)序列表中的序列4所示的单链DNA分子；A8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子；所述引物5为如下A9)或A10)：A9)序列表中的序列5所示的单链DNA分子；A10)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子；所述引物6为如下A11)或A12)：A11)序列表中的序列6所示的单链DNA分子；A12)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子；所述引物7为如下A13)或A14)：A13)序列表中的序列7所示的单链DNA分子；A14)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子；所述引物8为如下A15)或A16)：A15)序列表中的序列8所示的单链DNA分子；A16)将序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列8具有相同功能的DNA分子；所述引物9为如下A17)或A18)：A17)序列表中的序列9所示的单链DNA分子；A18)将序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列9具有相同功能的DNA分子；所述引物10为如下A19)或A20)：A19)序列表中的序列10所示的单链DNA分子；A20)将序列10经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列10具有相同功能的DNA分子；所述引物11为如下B1)或B2)：B1)序列表中的序列11所示的单链DNA分子；B2)将序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列11具有相同功能的DNA分子；所述引物12为如下B3)或B4)：B3)序列表中的序列12所示的单链DNA分子；B4)将序列12经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列12具有相同功能的DNA分子；所述引物13为如下B5)或B6)：B5)序列表中的序列13所示的单链DNA分子；B6)将序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列13具有相同功能的DNA分子；所述引物14为如下B7)或B8)：B7)序列表中的序列14所示的单链DNA分子；B8)将序列14经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列14具有相同功能的DNA分子；所述引物15为如下B9)或B10)：B9)序列表中的序列15所示的单链DNA分子；B10)将序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列15具有相同功能的DNA分子；所述引物16为如下B11)或B12)：B11)序列表中的序列16所示的单链DNA分子；B12)将序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列16具有相同功能的DNA分子；所述引物17为如下B13)或B14)：B13)序列表中的序列17所示的单链DNA分子；B14)将序列17经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列17具有相同功能的DNA分子；所述引物18为如下B15)或B16)：B15)序列表中的序列18所示的单链DNA分子；B16)将序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列18具有相同功能的DNA分子；所述引物19为如下B17)或B18)：B17)序列表中的序列19所示的单链DNA分子；B18)将序列19经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列19具有相同功能的DNA分子；所述引物20为如下B19)或B20)：B19)序列表中的序列20所示的单链DNA分子；B20)将序列20经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列20具有相同功能的DNA分子；所述引物21为如下C1)或C2)：C1)序列表中的序列21所示的单链DNA分子；C2)将序列21经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列21具有相同功能的DNA分子；所述引物22为如下C3)或C4)：C3)序列表中的序列22所示的单链DNA分子；C4)将序列22经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列22具有相同功能的DNA分子；所述引物23为如下C5)或C6...

【专利技术属性】
技术研发人员：尚蕾，孙辉，杨帆，莫晓婷，赵兴春，李万水，叶健，
申请(专利权)人：公安部物证鉴定中心，
类型：发明
国别省市：北京,11