The invention belongs to the field of molecular biology DNA marking technology, and specifically relates to microsatellite loci of paraloach, their primers and applications. The nucleic acid sequence of the microsatellite loci is shown as SEQ ID NO:1-7, and the primer-pair nucleotide sequence for amplifying the microsatellite loci is shown as SEQ ID NO:8-21. Seven microsatellite loci were screened out from the genomic DNA of the short paraloach, and specific primer pairs were designed according to the flanking regions at both ends of the microsatellite repeat sequence. The specific primer pairs were used to amplify the genomic DNA of the short paraloach. The obtained products have high polymorphism and stability, and can be applied to the population relics of the short paraloach. Transmission, phylogenetic analysis and molecular marker assisted breeding.
【技术实现步骤摘要】
短体副鳅微卫星位点及其引物和应用
本专利技术属于分子生物学DNA标记
,具体涉及短体副鳅微卫星位点及其引物和应用。
技术介绍
微卫星DNA:又称为短串联重复序列或简单序列重复。它是以1~6个碱基的短核苷酸为基本单位首尾相连组成串联重复序列,由于重复次数不同以及重复程度的不完全造成了每个位点的长度多态性。由于每个微卫星两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,可根据其两端设计一对特异性引物,通过PCR技术来扩增相应位点的微卫星序列,再经电泳分析,即可显示不同基因型个体微卫星的多态性。微卫星由于分布广泛,密度大,多态性丰富,遵循孟德尔分离定律,共显性遗传、易于PCR扩增,所需DNA数量极少,对DNA质量要求不高,结果重复性好等优点,目前已被广泛应用于遗传多样性、亲缘关系分析、连锁图谱构建、功能基因定位、分子标记辅助育种等领域。短体副鳅(Paracobitispotanini),别名包氏条鳅、钢鳅,隶属于鲤形目鳅科(Cobitidae)条鳅亚科(Noemacheilinae)副鳅属(Paracobitis),主要分布在长江上游干流以及三峡库区的一些支流,如香溪、龙船河、大宁河、乌江等天然水域,秦岭南部也有分布,是长江上游特有鱼类。短体副鳅个体小,常见个体体长45~96mm,短体副鳅体色鲜艳,全身布满漂亮的花纹,具有极高的观赏价值。近年来,由于酷渔滥捕以及挖沙船等对鱼类三场的破坏等原因,资源量急剧下降。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供了7个短体副鳅的微卫星位点及其引物和应用。为实现上述专利技术目的,本专利技术采用的技术方案为:短体副鳅的微卫星位点,包括7个微卫 ...
【技术保护点】
1.短体副鳅的微卫星位点,其特征在于,包括7个微卫星位点,所述微卫星位点的核酸序列如SEQ ID NO:1~7所示。
【技术特征摘要】
1.短体副鳅的微卫星位点,其特征在于,包括7个微卫星位点,所述微卫星位点的核酸序列如SEQIDNO:1~7所示。2.用于扩增权利要求1所述短体副鳅微卫星位点的引物对,其特征在于,核苷酸序列如SEQIDNO:8~21所示;用于扩增序列为SEQIDNO:1的微卫星位点的引物对,其上下游序列分别为SEQIDNO:8、SEQIDNO:9;用于扩增序列为SEQIDNO:2的微卫星位点的引物对,其上下游序列分别为SEQIDNO:10、SEQIDNO:11;用于扩增序列为SEQIDNO:3的微卫星位点的引物对,其上下游序列分别为SEQIDNO:12、SEQIDNO:13;用于扩增序列为SEQIDNO:4的微卫星位点的引物对,其上下游序列分别为SEQIDNO:14、SEQIDNO:15;用于扩增序列为SEQIDNO:5的微卫星位点设计的引物对,其上下游序列分别为SEQIDNO:16、SEQIDNO:17;用于扩增序列为SEQIDNO:6的微卫星位点设计的引物对,其上下游序列分别为SEQIDNO:18...
【专利技术属性】
技术研发人员:李伟涛,阙延福,熊美华,邵科,廖小林,朱滨,
申请(专利权)人:水利部中国科学院水工程生态研究所,
类型:发明
国别省市:湖北,42
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。