本发明专利技术公开了一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因及其应用，其cDNA包括如SEQ ID NO 01所示的序列。本发明专利技术首次从黄姑鱼的肝脏组织中克隆到一种超氧化物歧化酶MnSOD基因的cDNA。采用本发明专利技术试剂盒首次研究氨氮急性攻毒后，黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因mRNA表达的时相变化，该mRNA表达水平的检测在氨氮对黄姑鱼的污染检测中作为一种生物标记，在黄姑鱼对氨氮环境预警中有重要的应用前景，并为黄姑鱼的健康状态和生长环境安全的检测奠定基础。
Superoxide dismutase MnSOD gene of yellow croaker and its application
The present invention discloses a superoxide dismutase MnSOD gene and its application, and its cDNA includes a sequence as shown in SEQ ID NO 01. A cDNA of superoxide dismutase MnSOD gene is cloned from the liver tissue of the genus yellowish for the first time. The time phase changes of the expression of MnSOD gene mRNA of the superoxide dismutase (SOD) of the yellow croaker were studied by the kit for the first time, and the detection of the expression level of the mRNA was used as a biomarker in the contamination detection of the ammonia nitrogen to the yellow croaker, and it had an important application prospect in the pre alarm for the ammonia nitrogen environment and was Huang Gu. The foundation of fish health status and growth environment safety detection is laid.
【技术实现步骤摘要】
一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因及其应用
本专利技术属于氨氮污染检测
，具体涉及一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因及其应用。
技术介绍
黄姑鱼(Nibeaalbiflora)是我国重要经济鱼类之一，主要分布在我国沿海、日本及朝鲜西南岸，在我国近海鱼类资源中占有重要地位。海水网箱养殖黄姑鱼，具有生长快、抗病力强等优点，在我国东南沿海迅速发展，然而，受农业径流及养殖水体内有机物(包括养殖动物排泄物、残饵及动植物尸体等)分解的影响，氨氮等对鱼类有明显毒害作用的污染物不断积累，影响黄姑鱼的健康生长。研究表明，高浓度的氨氮会造成水生生物氧化损伤、离子失衡、伤害鱼体组织结构、鱼类生长迟缓甚至死亡(SinhaAK，AbdelgawadH，GiblenT，etal.Anti-oxidativedefencesaremodulateddifferentiallyinthreefreshwaterteleostsinresponsetoammonia-inducedoxidativestress.[J].PlosOne，2014，9(4)：e95319；BenliACK，G，A.SublethalammoniaexposureofNiletilapia(Oreochromisniloticus，L.)：Effectsongill，liverandkidneyhistology[J].Chemosphere，2008，72(9)：1355-1358.)。超氧化物歧化酶(SOD，EC1.15.1.1)是抗氧化系统的关键酶，在清除活性氧(ROS)的过程中发挥重要的作用，能将ROS快速歧化为普通分子氧和过氧化氢。截至目前，自然界中已发现6种SOD，按其所含金属辅基不同可分为：MnSOD、CuZnSOD、FeSOD、NiSOD、MnFeSOD和FeZnSOD(张克烽，张子平，陈芸，等.动物抗氧化系统中主要抗氧化酶基因的研究进展[J].动物学杂志，2007，42(2)：153-160)，但是，目前只有MnSOD和Zn/CuSOD在鱼类中有发现。当前，针对MnSOD的研究主要集中在哺乳动物中，在鱼类中的研究相对较少，虽然MnSOD的基因在少数鱼中已经克隆出来，但是，其在黄姑鱼中的研究还未报道，此外，氨氮对黄姑鱼中MnSOD基因mRNA的表达情况的影响也尚未报道。因此，通过黄姑鱼MnSOD基因对氨氮的应急反应，可检测环境中氨氮对黄姑鱼生长造成的危害，同时也是黄姑鱼养殖环境预警的一种有效方法。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因。本专利技术的另一目的在于提供上述黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因的应用。本专利技术的技术方案如下：一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因，其cDNA包括如SEQIDNO01所示的序列。在本专利技术的一个优选实施方案中，所述cDNA以黄姑鱼肝脏组织总cDNA为模板，以正向引物F1和反向引物R1为扩增引物对，通过PCR反应获得，其中，F1包括SEQIDNO02所示的序列，R1包括如SEQIDNO03所示的序列。一种氨氮污染PCR检测试剂盒，基于实时荧光定量PCR，以黄姑鱼组织中的上述黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因为检测对象，包括检测引物对和内参引物对，其中，检测引物对包括正向引物F2和反向引物R2，内参引物对包括用于检测黄姑鱼管家基因β-actin的正向引物F3和反向引物R3。在本专利技术的一个优选实施方案中，所述黄姑鱼组织为黄姑鱼的肝脏组织和鳃组织。在本专利技术的一个优选实施方案中，所述正向引物F2和反向引物R2分别包括如SEQIDNO04和05所示的序列。在本专利技术的一个优选实施方案中，所述正向引物F3和反向引物R3分别包括如SEQIDNO06和07所示的序列。上述氨氮污染PCR检测试剂盒的使用方法，包括如下步骤：(1)取不同的黄姑鱼组织，提取相应的总RNA，然后反转录得到相应的cDNA，以此为模板，通过实时荧光定量PCR扩增所述黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因；(2)采用2-ΔΔCt法对上述黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因的mRNA的时相差异表达进行分析。本专利技术的有益效果是：1、本专利技术首次从黄姑鱼的肝脏组织中克隆到一种超氧化物歧化酶MnSOD基因的cDNA。2、采用本专利技术试剂盒首次研究氨氮急性攻毒后，黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因mRNA表达的时相变化，该mRNA表达水平的检测在氨氮对黄姑鱼的污染检测中作为一种生物标记，在黄姑鱼水产养殖中对氨氮的预警有重要应用前景，并为黄姑鱼的健康状态和生长环境安全的检测奠定基础。附图说明图1为本专利技术实施例2的实验结果图。具体实施方式以下通过具体实施方式结合附图对本专利技术的技术方案进行进一步的说明和描述。实施例1超氧化物歧化酶MnSOD基因的克隆1.黄姑鱼肝脏总RNA的提取：用手术剪刀解剖活的黄姑鱼，取少量肝脏组织置于RNA保护液中用于RNA的提取。肝脏总RNA的提取使用北京全式金生物技术有限公司的TransZolUpPlusRNAKit，提取方法参照使用说明书，并采用RNase-freeDnase(Promega，USA)除去其中的DNA杂质，产物于1％琼脂糖凝胶电泳以检测RNA质量。2.黄姑鱼cDNA：cDNA第一条链的合成采用GoScriptTMReverseTranscriptionkit(Promega，USA)并参照其实验说明具体操作。3.黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因克隆(1)通过PCR技术扩增黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因，其中正向引物F1：5’ATGAGCACTATCATGAACAT3’(SEQIDNO02)，反向引物R1：5’CTACTTTTTGGCGATCTG3’(SEQIDNO03)；PCR的试剂与条件：10xTaqDNA聚合酶缓冲液(Mg2+浓度为20mM)2μl模板肝脏cDNA1μL正向引物F1(10μM)1μL反向引物R1(10μM)1μL脱氧核苷酸混合物(dNTP，10mM)1.6μLTaqDNA聚合酶(5U/μL)0.5μL灭菌双蒸水12.9μL；PCR反应程序为：94℃预变性5min；然后30个下列循环：94℃变性30s，59℃退火30s，72℃延伸1min；最后72℃延伸10min，1.2％琼脂糖凝胶电泳检测。(2)反应产物纯化：利用北京全式金生物技术有限公司产品(EasyPureQuickGelExtractionKit)对PCR产物进行纯化，操作步骤按产品说明书进行。(3)cDNA序列：纯化后的PCR产物与pMD19-T载体(宝生物工程(大连)有限公司)连接，之后采用转化DH5α(天根公司)菌株进行蓝白斑筛选，挑取单克隆白斑扩增培养后，提取质粒，以F1、R1为引物对所提取的质粒做PCR检测，确认插入及片段大小后进行测序验证。测序结果显示，黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因cDNA全长共949bp(SEQIDNO01所示)，包括38bp的5’非编码区、233bp的3’非编码区和678bp的开放阅读框，该阅读框编码225个氨基酸。实施例2本实施例根据实施例1克隆方法得到的黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因cDNA序列，设计相应引物，检测被氨氮攻毒后，该基因在肝脏和鳃组织中的mRNA表本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因，其特征在于：其cDNA包括如SEQ ID NO 01所示的序列。
【技术特征摘要】
1.一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因，其特征在于：其cDNA包括如SEQIDNO01所示的序列。2.如权利要求1所述的一种黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因，其特征在于：所述cDNA以黄姑鱼肝脏组织总cDNA为模板，以正向引物F1和反向引物R1为扩增引物对，通过PCR反应获得，其中，F1包括SEQIDNO02所示的序列，R1包括如SEQIDNO03所示的序列。3.一种氨氮污染PCR检测试剂盒，其特征在于：基于实时荧光定量PCR，以黄姑鱼组织中的权利要求1所述的黄姑鱼超氧化物歧化酶MnSOD基因为检测对象，包括检测引物对和内参引物对，其中，检测引物对包括正向引物F2和反向引物R2，内参引物对包括用于检测黄姑鱼管家基因β-actin的正向引物F3和反向引物R3。4.如权利要求3所述的一种氨氮污染...
【专利技术属性】
技术研发人员：韩芳，宋青，王小龙，白泽清，高静，林伟琦，侯晓阳，方荣谦，白荣汉，王水亮，张倩，王志伟，
申请(专利权)人：厦门市产品质量监督检验院，集美大学，
类型：发明
国别省市：福建,35
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